Effects of nutrient depletion on translational regulation in HCT-116 colorectal cancer cells
Kısıtlı besiyerinin HCT-116 kolorektal kanser hücrelerinin translasyonel kontrolü üzerine etkileri
- Tez No: 864872
- Danışmanlar: PROF. DR. SREEPARNA BANERJEE, PROF. DR. İREM EREL GÖKTEPE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Onkoloji, Biyoloji, Oncology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tümör mikroçevresindeki kısıtlı besin kaynağı, hayatta kalmayı sağlamak için çok sayıda stres tepkisine bağlı yolakları aktive edebilir. Araştırmamız, HCT-116 hücrelerinin 24 saat boyunca düşük glikoz, glutamin ve serum içeren, besin açısından kısıtlı bir ortama maruz bırakılmasıyla, beklenildiği üzere mTOR yolağının inhibasyonuna yol açtığını göstermiştir. Ancak, mTOR yolağının bilinen bir hedefi ve bileşeni olan Ribozomal protein S6'nın (RPS6)'nın aktivasyonu da gözlemlenmiştir. mTOR yolağının inaktif olduğu durumlarda, bir MEK inhibitörü olan U0126'nın RPS6 fosforilasyonunu azaltması sonucuyla RPS6'nın MAPK yolu yoluyla fosforile edildiği gözlemlenmiştir. Kolorektal tümörlerden elde edilen ters faz protein dizisi (RPPA) veri analizi, RPS6 fosforilasyonunun ERK1/2 fosforilasyonu ile pozitif korelasyon içinde olduğunu göstermiştir. Ek olarak, polizom profili verileri, MAPK'nin U0126 ile inhibisyonunun, RPS6'nın aktivitesinin yanı sıra translasyonel düzenlemede katkısı olduğunu göstermiştir. Genel olarak bulgularımız, kısıtlı besiyerine bağlı olarak, HCT-116 kolorektal kanser hücrelerinde bir hayatta kalma mekanizması olarak RPS6 ve MAPK yolaklarının eşzamanlı aktivasyonuna yol açabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Limited nutrient supply in the tumor microenvironment can activate numerous stress response pathways in order to ensure survival. Our research demonstrated that exposing HCT-116 cells to a nutrient-depleted medium containing low glucose, glutamine, and serum for 24 hours led to the inhibition of nutrient sensing pathways such as mTOR, as expected. However, the activation of Ribosomal protein S6 (RPS6), a known target of the mTOR pathway and a component of the small ribosomal subunit was observed. In the absence of an active mTOR pathway, RPS6 was phosphorylated via the MAPK pathway since U0126, a MEK inhibitor could abrogate RPS6 phosphorylation. Analysis of reverse phase protein array (RPPA) data from colorectal tumors showed that the phosphorylation of RPS6 was positively correlated with ERK1/2 phosphorylation. In addition, polysome profiling data demonstrated that nutrient restriction and inhibition of MAPK with U0126 could alter the distribution of ribosomes from polysomes to 80S monosomes, suggesting a role in translational regulation. Overall, our findings suggest that the depletion of nutrients may lead to the simultaneous activation of RPS6 and MAPK pathway as a survival mechanism in HCT-116 colorectal cancer cells.
Benzer Tezler
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- Diesel motorları yakıt püskürtme sistemlerinin dinamik simülasyonu
Başlık çevirisi yok
İRFAN KARAGÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Makine MühendisliğiUludağ ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OĞUZ BORAT
- Cam ve plastik seraların sonbahar domates üretimi yönünden karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
ERGUN DURAN
- Doğuştan kalça çıkıklı hastalarda kalça patolojilerinin bilgisayarlı tomografi ile değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
NECDET ŞÜKRÜ ALTUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Ortopedi ve TravmatolojiGazi ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ORHAN ASLANOĞLU
- Makro besin elementlerinin (NPK) İzmir'de Mayıs ayında açığa dikilen 4-6 cm çevre büyüklüğündeki Gladiolus cinsine ait“hunting song”ve“Novalüx”kültür çeşitlerinin yumrularının gelişmeleri üzerine etkileri
Başlık çevirisi yok
TAHA ALİ AMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
ZiraatEge ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN HATİPOĞLU