Geri Dön

Candida türlerinin tiplendirilmesinde ve antifungal duyarlılığın belirlenmesinde çeşitli yöntemlerin karşılaştırılması

The Comparison of different methods in identification and antifungal susceptibility of candida species

PDF İndir

  1. Tez No: 86798
  2. Yazar: ASUMAN BİRİNCİ
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. AHMET SANİÇ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Candida, İdantifikasyon, Antifungal duyarlılık, Makrodilüsyon, E test. VHI, Candida, Identification, Antifungal susceptibility, Macrodilution, E test. X
  7. Yıl: 1999
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 73

Özet

ÖZET CANDİDA TÜRLERİNİNTİPLENDİRİLMESİNDE VE ANTİFUNGAL DUYARLILIĞIN BELİRLENMESİNDE ÇEŞİTLİ YÖNTEMLERİN KARŞILAŞTIRILMASI Bu çalışmanın amacı yeni selektif kromojenik besiyerlerinden MAST ID- CHROMagar Candida ve ticari kitlerden API 20C AUX'un kandidalan idantifiye edebilme derecelerinin, klasik mikolojik tanı yöntemleri referans alınarak araştırılmasıdır. Ayrıca basit bir agar difüzyon methodu olan E test yönteminin, Candida türlerinin amfoterisin B, flukonazol ve ketokonazol'e karşı antifungal duyarlılıklarının belirlenmesinde, National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) tarafindan önerilen standart makrodilüsyon yöntemine alternatif olup olamayacağının araştırılmasıdır. Çalışmada vajinal örneklerden izole edilen 50 Candida kökeni kullanılmıştır. Çalışmaya alman 50 Candida kökeninin standart klasik yöntemler (pirinç ekstresi Tween 80 agar, karbonhidrat asimilasyon, germ tüp) ile idantifiye edilmesi sonucu, 34 (%68)'ü C. albicans, 9 (%18)'u C. krusei, 5 (%10)'i C. tropicalis, 2 (%4)'si C. glabrata olarak değerlendirildi. Germ tüp testi 34 C. albicans kökeninin 31 (%91,2)'inde olumlu bulundu. API 20C AUX ile çalışmaya alman suşlann %98'i klasik mikolojik yöntemlerle uyumlu olarak değerlendirildi. C. krusei kökenlerinden l'i C. zeylanoides olarak tanımlandı. Diğer kökenlerin hepsi doğru olarak tanımlandı. Mast ID-CHROMagar Candida' run 48 saat inkübasyondan sonra idantifikasyon derecesi %92 olarak değerlendirildi. 34 C. albicans kökeninin 33 'ü doğru olarak saptanırken, l'i C. tropicalis olarak saptandı (duyarlıhk=%97.0, özgüllük=%93.7). 5 C. tropicalis kökeninin ise 4'ü doğru olarak saptanırken, l'i C. albicans olarak saptandı (duyarlılık=%80.0, özgüllük=%97.8). C. krusei ve C. glabrata kökenlerinin ise hepsi doğru olarak saptandı. EC. Y6K5Rtâft*»r!J!f i vn "T3f50 Candida kökeninin standart makrodilüsyon yöntemi ile MİK aralığı, MİK90 değerleri sırasıyla amfoterisin B için C. albicans kökenlerinde 0.03-0.5 ug/ml, 0.5 |ig/ml, diğer kökenlerde 0.125-lu,g/ml, 1 |!g/ml; flukonazol için C. albicans kökenlerinde 0.125-2 |ig/ml, 1 |ig/ml, diğer kökenlerde 1-64 ug/ml, 64 ug/ml; ketokonazol için C. albicans kökenlerinde 0.03-0.125 ug/ml, 0.125 ng/ml, diğer kökenlerde 0.03-0. 5 |ig/ml, 0.5 ug/ml, olarak belirlendi. C. albicans kökenlerinde MİK değerleri diğer kökenlerdeki MİK değerlerinden daha düşük olarak saptandı. E test yöntemi ile Candida kökenlerinin antifungal duyarlılığının belirlenmesinde azoller için üç farklı ortam (MOPS tamponlu RPMI 1640, Fosfat tamponlu RPMI 1640, Casitone agar) kullanıldı. İstatistiksel olarak bu ortamlarda elde edilen ortalama MİK değerlerinin karşılaştırılmasında fark bulunamadı (p>0.05). E test yönteminin standart makrodilüsyon yöntemi ile uyumu ± 1 dilüsyonlar aynı kabul edilerek, amfoterisin B için MOPS tamponlu RPMI 1640' da %84; flukonazol için MOPS tamponlu RPMI 1640'da %97, Fosfat tamponlu RPMI 1640 ve Casitone ağarda %90; ketokonazol için MOPS tamponlu RPMI 1640'da %78, Fosfat tamponlu RPMI1640'da %79, Casitone ağarda %60 olarak saptanmıştır. Sonuçlarımız Candida türlerinin idantifikasyonunda API 20C AUX ve Mast ID-CHROMagar Candida' nın kullanılabileceğini gösterdi. Ayrıca E test yönteminin Candida türlerinin antifungal duyarlılığının rutinde saptanmasında amfoterisin B ve flukonazol için standart makrodilüsyon yöntemine değerli bir alternatif olduğu, ketokonazol için ise olmadığı sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

SUMMARY THE COMPARISION OF DIFFERENT METHODS IN IDENTIFICATION AND ANTTFUNGAL SUSCEPTIBILITY OF CANDD3A SPECD2S The aim of this study to evaluate the performance with respect to identification of Candida species of new selective chromogenic media MAST ID-CHROMagar Candida, commercial kit API 20C AUX, and classical mycological methods as reference and also to evaluate E test a simple agar diffusion method as a alternative to the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) reference standard macrodilution method for detennining the MICs of amphotericin B, fluconazole, ketoconazole by testing 50 vaginal Candida isolates. By using classical mycological methods (Rice extrate-Tween 80 agar, carbon hyrate assimilation and germ tube) 50 Candida strains were identified as follows: 34 (68%) C. albicans, 9 (18%) C. krusei, 5 (10%) C. tropicalis, 2 (4%) C. glabrata. The germ tube test was positive in 31 (91,2%) of 34 C. albicans strains. By using API 20C AUX, 49 of 50 studied strains were correctly identified with an overall concordance of 98% this method and standard one. One of the C. krusei strains was identified as C. zeylanoides. All other strains were showed 100% concordance with classical mycological methods. The identification performance of Mast ID-CHROMagar Candida, was 92%. As 33 of 34 C. albicans strains were correctly identified, one of them was identified as C. tropicalis (sensitivity=97.0%, specifity=93.7%). 4 of 5 C. tropicalis strains were correctly and one was identified as C. albicans (sensitivity=80%, specifity=97.8%). All of C. krusei strains were correctly identified but none of C. glabrata strains could be identified. MIC ranges and MIC 90 values for amphotericin B 0.03-0.5 ug/ml, 0.5 ug/ml in C. albicans strains 0.125-1 ug/ml, 1 ug/ml in non albicans strains; for fluconazole 0.125-2 u,g/ml, 1 ug/ml in C. albicans strains, 1-64 ug/ml, 64 ug/ml; in non albicans strains; for ketoconazole 0.03-0.125 ug/ml, 0.125 ug/ml, in C. albicans strains, IX0.03-0.5u,g/ml, 0.5 ug/ml in non albicans strains. MIC values were lower in C. albicans strains than non albicans strains. Three different mediums (MOPS buffered RPMI 1640, Phosphate buffered RPMI 1640 and Casitone agar) were used for azoles in determining the antifungal susceptibility of Candida strains with E test. There was no statistically significant difference between MIC values obtained in these medium (p>0.05). Agreement (±1 twofold dilutions) between E test and macrodilution tests were 84% in MOPS bufferred RPMI 1640 for amphotericin B, 97%, 90%, 90% in MOPS bufferred RPMI 1640, Phosphate buffered RPMI 1640, Casitone agar respectively for fluconazole and 78%, 79% and 60% in MOPS bufferred RPMI 1640, Phosphate buffered RPMI 1640, Casitone agar respectively for ketoconazole. In conclusion, it is thought that MAST ID-CHROMagar Candida and API 20C AUX can be used in identification of Candida species. In the other hand we conclude that E test is valuable alternative to the standard macrodilution method for routine susceptibility testing of Candida species with amphotericin B and fluconazole but not with ketoconazole.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    157941

    Yoğun bakım hastalarının örneklerinden soyutlanan Candida türlerinin tiplendirilmesi

    Typing of Candida species isolated from clinical specimens of patients hospitalized in intensive care unit

    SERHAT MAROL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MİNE YÜCESOY

  2. Tez No

    360203

    Candida türlerinin tanımlanmasında iki farklı isitemin karşılaştırılması

    Comparison of two different medhots for identification candida species

    ÜLKÜ GAYIBOV

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. BEYZA ENER

  3. Tez No

    347837

    Candıda türlerinin tanımlanmasında 26S RDNA dizi analizi temel alınarak 'API ID 32C' ve 'maldı tof ms' yöntemlerinin duyarlılık ve maliyet etkinliklerinin araştırılması

    Evaluation of sensitivity and cost effectiveness of 'API id 32C' and 'maldi tof ms' methods on the basis of 26s rdna sequence analysis in identification of candida species

    EYLEM TURHAN ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU

  4. Tez No

    664203

    Candida türlerinin vorikonazol ve flukonazol duyarlılık profillerinin araştırılması

    Investigation of voriconazole and fluconazole susceptibility profiles of candida species

    SEMA NUR ALTINTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH ŞAHİNER

  5. Tez No

    434822

    Candıda türlerinin moleküler tekniklerle tiplendirilmesi

    Typing candida species with molecular techniques

    EMRULLAH AKSAKAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM BARIŞ

Geri Dön