Yeni tripeptit sübstitüe siklotrifosfazen bileşiklerinin sentezi, karakterizasyonu ve in vitro sitotoksik ve genotoksik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of synthesis, characterization in vitro cytotoxic and genotoxic properties of new tripeptide substituted cyclotrifosphazenes
- Tez No: 875598
- Danışmanlar: DOÇ. DR. KENAN KORAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Anorganik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
Bu tez çalışmasında ilk olarak, başlangıç bileşiği olarak amin grubu korumalı karboksil grubu serbest olan tirozin aminoasitinin (Boc-Tyr-OH) sırasıyla Glisin ve Alanin metil ester hidroklorür formları ile CDMT yöntemi ile asetonitril ortamında etkileştirilerek 2 adet dipeptit bileşiği (Boc-Tyr-Gly-OCH3 ve Boc-Tyr-Ala-OCH3) elde edildi. Bu dipeptitler kullanılarak birinci aşamada, metil esterli dipeptit bileşiklerinin ester grupları karboksil grubuna dönüştürülerek Boc-Tyr-Gly/Ala-OH dipeptitleri sentezlenmiştir. Boc-Tyr-Gly-OH ve Boc-Tyr-Ala-OH dipeptitleri bileşiklerinden Boc-Tyr-Gly-OH ile Glisin (NH2-Gly-OCH3.HCl) ve Alanin (NH2-Ala-OCH3.HCl), Boc-Tyr-Ala-OH dipeptiti ile sırasıyla Glisin (NH2-Gly-OCH3.HCl), Alanin (NH2-Ala-OCH3.HCl), Valin (NH2-Val-OCH3.HCl) ve Fenilalanin (NH2-Phe-OCH3.HCl) metil ester hidroklorür aminoasitleri ile asetonitril içerisinde CDMT yöntemine kullanılarak etkileştirilmesi ile 6 adet tripeptit bileşiği elde edilmiştir. Üçüncü aşamada, elde edilen tripeptit bileşikleri, fosfazen başlangıç bileşiği olan DPP ile etkileştirilerek 6 adet disübsititüe tripeptit-siklotrifosfazen bileşiği elde edildi. Elde edilen tüm bileşikler ince tabaka kromatografisi ile takip edilerek sonlandırıldı ve aynı hareketli faz göz önünde bulundurularak Flash kromatografisi ile saflaştırılmıştır. Saf olarak elde edilen tripeptitlerin yapısal karakterizasyonları elementel analiz, FT-IR, 1H, 13C-APT NMR spektrumları ile sübstitüe fosfazen bileşiklerinin ise ek olarak 31P ve HETCOR (2D) NMR ve MALDI-TOF MS spektroskopi yöntemleri kullanılarak gerçekleştirildi. Bileşiklerin termal özellikleri TGA yöntemi ile belirlendi. TGA eğrilerinden bileşiklerin neredeyse tamamının bozunmaya başladığı sıcaklık 400 0C'nin üzerindedir. Bu sonuçlar neticesinde elde edilen siklotrifosfazenlerin termal olarak kararlı bir yapıda oldukları görülmektedir. Saf olarak elde edilen bileşiklerin insan kanser hücre hatları over (A2780) ve prostat (PC-3) kanser hücre hatlarına karşı sitotoksisite özellikleri MTT assay yöntemiyle belirlenerek % hücre canlılıkları belirlendi ve bileşiklerin LogIC50 değerleri hesaplandı. Hücre ölümlerinin DNA hasarı mekanızması üzerinden olup olmadığı Comet Assay metodu ile belirlendi. Hücre canlılığında meydana gelen azalmanın temelinde DNA hasarına bağlı olarak ortaya çıktığı comet assay deneyleriyle belirlendi (p
Özet (Çeviri)
In this thesis, 2 dipeptide compounds (Boc-Tyr-Gly-OCH3 and Boc-Tyr-Ala-OCH3) were obtained by interacting the amino acid tyrosine (Boc-Tyr-OH) with Glycine and Alanine methyl ester hydrochloride forms with protected amine group and free carboxyl group respectively by CDMT method in acetonitrile medium. Using these dipeptides, Boc-Tyr-Gly-OH and Boc-Tyr-Ala-OH dipeptides were synthesized in the first step by converting the ester groups of the methyl ester dipeptide compounds into carboxyl groups in acetonitrile. Boc-Tyr-Gly/Ala-OH dipeptides were synthesized as Boc-Tyr-Gly-OH with Glycine (NH2-Gly-OCH3.HCl) and Alanine (NH2-Ala-OCH3.HCl), Boc-Tyr-Ala-OH dipeptide with Glycine (NH2-Gly-OCH3.HCl), Alanine (NH2-Ala-OCH3. HCl), Valine (NH2-Val-OCH3.HCl) and Phenylalanine (NH2-Phe-OCH3.HCl) methyl ester hydrochloride amino acids in acetonitrile using the CDMT method, 6 tripeptide compounds were obtained. In the third step, the obtained tripeptide compounds were interacted with the phosphazene starting compound DPP to obtain 6 disubstituted tripeptide-cyclotriphosphazene compounds. All the compounds obtained were followed by thin layer chromatography and purified by flash chromatography using the same mobile phase. Structural characterizations of the purified tripeptides were carried out by elemental analysis, FT-IR, 1H, 13C-APT NMR spectra and substituted phosphazene compounds were additionally characterized by 31P and HETCOR (2D) NMR and MALDI-TOF MS spectroscopy. Thermal properties of the compounds were determined by TGA method. From the TGA curves, the temperature at which almost all of the compounds start to decompose is above 400 0C. These results indicate that the obtained cyclotriphosphazenes are thermally stable. The cytotoxicity properties of the pure compounds against human cancer cell lines ovarian (A2780) and prostate (PC-3) cancer cell lines were determined by MTT assay method, % cell viability was determined and LogIC50 values of the compounds were calculated. Comet assay method was used to determine whether cell death was caused by DNA damage mechanism. It was determined by comet assay experiments that the decrease in cell viability was mainly due to DNA damage (p
Benzer Tezler
- Rejeneratif özellikli tripeptit bakır kompleksine dayalı nanopartikül geliştirilmesi
Development of nanoparticles based on tripeptide copper complex
NESLİNUR ÖZÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. RABİA ÇAKIR KOÇ
- Eritrosit içi okside, redükte ve toplam glutatyon miktarını ölçen yeni kolorimetrik bir yöntem geliştirilmesi
Development of a new colorimetric method to measure oxidized, reduced and total glutathione levels of intraerythrocyte
MURAT ALIŞIK
- Investigation of stability in self-assembled peptides by computational modelling
Kendiliğinden birleşen peptitlerin kararlılığının sayısal modelleme ile incelenmesi
OĞUZHAN MARABA
Doktora
İngilizce
2021
BiyokimyaUniversity of LimerickFen Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DAMIEN THOMPSON
- Beyin hücrelerinin adezyonunda kullanım potansiyeli olan yeni fonksiyonel yüzeylerin hazırlanması
Preparation of novel functional surfaces which have potential for the adhesion of brain cells
FATMA ÖZTÜRK KIRBAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyokimyaEge ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DİLEK ODACI DEMİRKOL
- DNA ve protein analizine yönelik elektrokimyasal sensörlerin geliştirilmesi
Development of electrochemical sensors for DNA and protein analysis
ECE EKŞİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyokimyaEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN