Köprüçay, Manavgat Çayı ve geçiş sularından temin edilen plastiferlerde bulunan bakterilerin teşhisi
Diagnosis of bacteria in plastisphere obtained from Köprüçay, Manavgat Stream and estuaries
- Tez No: 877640
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İFAKAT TÜLAY ÇAĞATAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Deniz Bilimleri, Mikrobiyoloji, Marine Science, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Antibakteriyel etkiler, Antibiyotik dirençliliği, Biyofilmler, Deniz kirliliği, Mikroplastik, Mikroplastik kirliliği, PCR, Antibacterial effects, Biofilms, Marine pollution, Mikroplastic, Microplastic pollution
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Su Ürünleri Temel Bilimler Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında Köprü (Serik/Antalya) ve Manavgat (Manavgat/Antalya) çayları ve deniz kenarında (0-5 m derinliklerinde) elde edilen plastiklerin üzerinde biyofilm formu oluşturan bazı bakteriler izole edilerek, bakteriler hem moleküler biyolojik yötemlerden biri olan PZR yöntemiyle hemde proteomik bazlı matriks aracılı lazer dezorbsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) (Bruker Microflex) yöntemi ile tanımlanması ve ardından bu bakterilerde bulunan çeşitli antibiyotiklere erm(B), tet(S), strA karşı oluşan direnç genlerinin tespiti amaçlanmıştır. Köprü (Serik/Antalya) ve Manavgat (Manavgat/Antalya) çayları ve deniz kenarında (0-5 m derinliklerinde) plastiferde bulunan bakteri örneklerinden mikrobiyolojik ekimler yapılarak insanlarda ve su ürünleri yetiştiriciliğinde hastalıklara yol açan ve ekonomik kayıplara neden olan Vibrio alginoticus ve Vibrio parahaemoliticus bakteri türleri moleküler biyolojik yöntemlerden biri olan PZR yöntemi ve gen dizilemesi ile teşhis edilmiştir. Ayrıca MALDI-TOF MS bakteriyal protein analiz yöntemi ile bu bulgular doğrulanmıştır. İzole edilen ve tanımlanan bakterilerin antibiyotiklerine duyarlılıkları disk difüzyon yöntemiyle ampisilin (10µg), tetrasiklin (30 µg), trimetoprim-sulfametoksazol (1.25µg/23.75 µg), kloramfenikol (30µg), nalidiksik asit (30 µg), siprofloksasin (5µg), seftazidim (30µg), gentamisin (10 µg), ve sefotaksim (30µg) antibiyotikleri kullanılarak belirlenmiştir. Bu çalışmada kullanılan bakterilerin tetrasiklin (30 µg), trimetoprim-sulfametoksazol (1.25µg/23.75 µg), kloramfenikol (30µg), nalidiksik asit (30 µg), siprofloksasin (5µg), seftazidim (30µg), gentamisin (10 µg), ve sefotaksim (30µg) antibiyotiklere duyarlı ve ampisilin (10µg) antibiyotiğine dirençli olduğu tespit edilmiştir. Kullanılan izolatların herhangi birinde antibiyotik direnç genine rastlanılmamıştır.
Özet (Çeviri)
Aim of this thesis study was to test for both antimicrobial susceptibility and molecular identification of pathogenic bacteria forming biofilm on plastics obtained from Köprü (Serik/Antalya) and Manavgat (Manavgat/Antalya) streams and sea (0-5 m depths), and presence of various antibiotic resistance genes (erm(B), tet(S), strA). Vibrio alginoticus and Vibrio parahaemoliticus bacterial species, which cause diseases in many economically valuable aquaculture products and humans, were identified by PCR, which is one of the molecular biological methods, by inoculation from bacteria samples in Plastisphere obtained from Köprü (Serik / Antalya) and Manavgat (Manavgat / Antalya) streams and seaside (0-5 m depths). In addition, these findings were confirmed by bacterial protein analysis by matrix-mediated laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry MALDI-TOF (Bruker Microflex). Antibiotic susceptibilities of the isolated and identified bacteria were determined by disk diffusion method using ampicillin (10µg), tetracycline (30 µg), trimethoprim-sulfamethoxazole (1.25µg/23. 75µg), chloramphenicol (30µg), nalidixic acid (30µg), ciprofloxacin (5µg), ceftazidime (30µg), gentamicin (10µg), and cefotaxime (30µg) antibiotics. The bacteria used in this study were susceptible to tetracycline (30µg), trimethoprim-sulfamethoxazole (1.25µg/23.75µg), chloramphenicol (30µg), nalidixic acid (30µg), ciprofloxacin (5µg), ceftazidime (30µg), gentamicin (10µg), and cefotaxime (30µg) antibiotics and resistant to ampicillin (10µg) antibiotic. It is observed that antibiotic resistance genes were not detected among isolated Vibrio alginoticus and Vibrio parahaemoliticus strains.
Benzer Tezler
- Türk turizm ekonomisine katkıları doğrultusunda rafting sporu ve geleceğinin değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
COŞKUN ÇANKAYA
- Köprüçay havzası ve dolayının (Antalya) karst hidrojeolojisi incelemesi
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA DEĞİRMENCİ
Doktora
Türkçe
1989
Jeoloji MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. GÜLTEKİN GÜNAY
- Köprüçay ırmağının Eğirdir Gölü'ne dökülen kolunda su kalitesi değişimi üzerinde bir araştırma
Başlık çevirisi yok
SEVGİ SAVAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1992
Su ÜrünleriAkdeniz ÜniversitesiSu Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. MUSTAFA CENGİZ
- Türkiye'nin turizm ve tanıtımında Çamlıhemşin
Başlık çevirisi yok
ŞAFAK GÜLAY
Yüksek Lisans
Türkçe
1994
Coğrafyaİstanbul ÜniversitesiHalkla İlişkiler ve Tanıtım Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖNGÖREN GÜNDEŞ SİMTEN