Geri Dön

Mitokondriyal demir taşıyıcı genlerin kavak ağacında (Populus trichocarpa) genom düzeyinde belirlenmesi ve biyoinformatik analizleri

Genome-wide identification and bioinformatic analysis of mitochondrial iron transporter genes in poplar (Populus trichocarpa)

PDF İndir

  1. Tez No: 878673
  2. Yazar: ONUR POYRAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ERTUĞRUL FİLİZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ormancılık ve Orman Mühendisliği, Forestry and Forest Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Düzce Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 42

Özet

Demir (Fe) hemen hemen tüm organizmalar için gerekli bir mikro besindir ve özellikle fotosentez yapan canlılarda demir gereksinimi çok yüksektir. Bitkilerde, kloroplast ve mitokondri organellerinde demir elementi çok yoğun bir şekilde kullanılmaktadır. Mitokondrilere demir alınımında rol oynayan MIT (Mitochondrial Iron Transporter: mitokondriyal demir taşıyıcı) genlerinin keşfiyle, mitokondriyal demir dengesi ve önemi daha iyi anlaşılmıştır. Bu çalışma, kavak (Populus trichocarpa) bitkisinde MIT genlerinin genom çaplı belirlenmesi ve biyoinformatik analizlerle yapılarının ortaya konulması amaçlamıştır. Bu bağlamda, kavak bitkisinin genomunda üç adet MIT geni (Potri.001G282400.1, Potri.009G077600.1 ve Potri.016G125200.1) bulunmuştur. Moleküler ağırlık ve izoelektrik nokta değerlerinin ise 34.95-37.23 kDa ile 7.62-9.12 arasında olduğu bulundu. Kavak bitkisinin MIT protein dizilerinin amino asit kompozisyonu incelenmiş olup, yüzde olarak en fazla bulunan amino asit çeşidi ortalama %12.2 ile alanin (Ala) bulunmuştur. Yapılan filogenetik analizler sonucunda, monokot-dikot bitkilerin net bir şekilde birbirinden ayrıldığı tespit edildi. Özellikle, kavak MIT protein dizilerinin söğüt bitkisiyle gruplaştığı belirlendi. Ayrıca, kavak MIT genlerinin kuraklık stresi altında, gen çeşidine bağlı olarak ifade seviyelerinin çeşitlilik gösterdiği belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Iron (Fe) is an essential micronutrient for almost all organisms, and iron requirements are particularly high in photosynthetic organisms. In plants, iron is used intensively in the chloroplast and mitochondrial organelles. The discovery of the MIT (Mitochondrial Iron Transporter) genes, which are involved in the uptake of iron into the mitochondria, has led to a better understanding of the mitochondrial iron balance and its importance. The aim of this study was to determine the genome-wide MIT genes in poplar (Populus trichocarpa) and to reveal their structures by bioinformatic analyses. In this context, three MIT genes (Potri.001G282400.1, Potri.009G077600.1 and Potri.016G125200.1) were found in the genome of poplar plant. The amino acid composition of the MIT protein sequences of poplar plants was analyzed and the most abundant amino acid type was alanine (Ala) with an average of 12.2%. Phylogenetic analyses revealed a clear separation between monocot and dicot plants. In particular, it was found that poplar MIT protein sequences grouped with willow plants. It was also found that the expression levels of poplar MIT genes under drought stress varied according to gene type.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    242167

    Pediatrik obez olgularda mitokondriyal ATPaz Subünite 6 ve Sitokrom B genlerinde SNP (Tek Nükleotid Polimorfizm) analizi

    SNP (Single Nucleotide Polymorphism) Analysis of Mitochondrial ATPase Subunit 6 and Cytochrome B genes in pediatric obese cases

    DURKADIN DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    GenetikAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZGÜL ALPER

  2. Tez No

    361282

    Demir eksikliği ve demir eksikliği anemisi olan çocuklarda sitokrom c oksidaz, katalaz enzim aktivitelerinin ve bakır seviyelerinin değerlendirilmesi

    The evaluation of cytochrome c oxidase, catalase enzyme activity and copper levels in children with iron deficiency and iron deficiency anemia

    AYŞENUR BAHADIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    HematolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Dahili Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. EROL ERDURAN

  3. Tez No

    809556

    Anemisiz demir eksikliği olan bireylerin sirkadiyen kan basıncı varyasyonlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of circadian blood pressure variations in individuals with iron deficiency without anemia

    KERİMAN IŞIL ÜNSAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    İç HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SELMA KARAAHMETOĞLU

  4. Tez No

    811897

    Understanding the molecular interactions of Fe-S cluster proteins in liver regeneration

    Karaciğer yenilenmesinde demir-sülfür (Fe-S) küme proteinlerinin moleküler etkileşiminin anlaşılması

    FAWAZ MOHAMMED ABDULLAH

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEDİHA CANBEK

    DR. AYŞE ÖZMEN YAYLACI

  5. Tez No

    557689

    Evaluation of antiviral activities of different types of propolis extracts

    Farklı tip propolis ekstrelerinin antiviral aktivitelerinin değerlendirilmesi

    SEVDA DEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ KARAGÖZ

Geri Dön