Boy kısalığı patofizyolojisinde rol oynayan shox gen mutasyonlarının klasik ve güncel tekniklerin kullanımı ile araştırılması
Investigation of shox gene mutations playing a role in the pathophysiology of short stature with the use of classical and current techniques
- Tez No: 882863
- Danışmanlar: PROF. DR. BİRSEN KARAMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
Boy kısalığı, genel popülasyonun %2-3'ünde görülen, hem çevresel hem de genetik faktörlerin etkili olduğu kompleks bir fenotiptir. Boy kısalığı ile ilişkilendirilmiş The short-stature homeobox gene (SHOX) geni, X ve Y kromozomlarının psödootozomal bölgesinde (PAR1) bulunan, erken embriyonik gelişim döneminde birçok organın oluşumunu ve üst-alt ekstremitelerdeki kemiklerin büyüme ve gelişmesinde önemli rol oynayan bir gendir. Geniş varyant spekturumu bulunan SHOX geni defektleri, normalden ağır klinik bulgulara sahip mezomelik boy kısalığına kadar değişken bir fenotip göstermektedir. Bu çalışmada, idiyopatik boy kısalığı tanılı 125 olguda sitogenetik, moleküler sitogenetik ve moleküler teknikler kullanılarak SHOX geninin etiyolojisi araştırıldı. Sitogenetik yöntemlerle yapılan incelemelerde olguların %4,8 (n=6) ve FISH incelemesinde %6,6'sında (n=8) SHOX geni delesyonu ile sonuçlanan anomaliler saptandı. Yirmi iki olguda yapılan a-CGH çalışmasında ise olguların %18,18'inde (n=4) bir anomali saptandı. On olguya yapılan boy kısalığı gen paneli testinde bir olguda (%10) SHOX geninde c.412G>T heterozigot novel varyant saptandı. Klinik öneme sahip olduğu belirlenen novel varyant Sanger dizileme ile doğrulandı ve aile segregasyon analizi yapılarak varyantın de novo oluştuğu saptandı. Boy kısalığı olgularında SHOX geni patofizyolojisini araştırmak amacıyla yapılan çalışmamızın, SHOX geninin fenotip-genotip ilişkisini açıklanmasına ve özgün genetik danışma için aydınlatıcı olarak literatüre katkı sağlaması beklenmektedir. Ancak, SHOX geni defektlerinin geniş bir fenotipik spektruma sahip olması nedeniyle tüm genom dizileme teknikleriyle, indeks ve ailesinin birlikte bulunduğu olgu havuzunda araştırma yapılmasının çalışmayı ilerletmek açısından doğru bir yaklaşım olacağı sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Short stature (SS) is a complex phenotype that occurs in 2-3% of the general population. The short-stature homeobox gene (SHOX) gene is located in the pseudootosomal region (PAR1) of the sex chromosomes and plays an important role in the formation of many organs during early embryonic development and in the growth of bones in the upper and lower extremities. Defects in the SHOX gene, which has a wide variant proband, show a variable phenotype ranging from normal to mesomelic short stature with severe clinical findings. In this study, we investigated the etiology of the SHOX gene in 125 patients with idiopathic SS using cytogenetic, molecular cytogenetic and molecular techniques. Anomalies in SHOX gene deletion were found in 4.8% (n=6) by cytogenetic methods and 6.6% (n=8) by FISH. In a-CGH study performed in 22 cases and 18.18% (n=4) with anomaly. In the gene-panel sequencing of SS performed in ten patients, a c.412G>T heterozygous novel variant in the SHOX gene was detected in one case (10%). The novel variant was confirmed by Sanger sequencing and with family segregation analysis that the variant occurred de novo. Our study, which was conducted to investigate the pathophysiology of the SHOX gene in cases of SS, is expected to contribute to the literature by explaining the phenotype-genotype relationship of the SHOX gene. However, since SHOX gene defects have a wide phenotypic spectrum, it was concluded that it would be the right approach to advance the study by using whole-genome sequencing techniques.
Benzer Tezler
- Çocuk genetik hastalıkları polikliniğine son 10 yılda boy kısalığı öntanısı ile başvuran hastaların klinik ve laboratuvar özellikleri
Clinical and laboratory characteristics of patients presenting to the pediatric genetic diseases polyclinic with a prediagnosis of short stature in the last 10 years
SHABNAM BAGHIRLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PELİN ÖZLEM ŞİMŞEK KİPER
- Boy kısalığı olan çocukların uyku alışkanlıklarının değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
EBUBEKİR DEMİRELOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. AYŞE DERYA BULUŞ
- Boy kısalığı olan okul çağı çocuklarda akran zorbalığı sıklığının ve bu durumun emosyonel ve fiziksel sağlık ile ilişkisinin incelenmesi
Study the frequency of peer bullying in school age children with short stature and its effect to emotional and physical health
VEFA ŞİPAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA DENİZ PAPATYA ÇAKIR
DR. SEMRA YILMAZ
- Boy kısalığı olan çocuklarda kaygı bozukluğu ve dikkat eksikliği/ hiperaktivite bozukluğunun değerlendirilmesi
The evaluation of anxiety disorder and attention deficit/ hyperactivity disorder in children with short stature
AYŞE HANDE ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
PsikiyatriSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESUT KOÇAK
- Boy kısalığının genetik etiyolojisinin araştırılması
Investigation of genetic etiology of short stature
ADAM NAJAFLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Genetikİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİRSEN KARAMAN
DR. GÜVEN TOKSOY