Recombinant production of GLP-1 analogue using escherichia coli host organism
Escherichia coli konak organizmada GLP-1 analoğunun rekombinant üretimi
- Tez No: 891810
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZKAN FİDAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: T2DM, GLP-1 analoğu, rekombinant DNA teknolojisi, protein ekspresyonu, E. coli, T2DM, GLP-1 analogue, recombinant DNA technology, protein expression, E. coli
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Abdullah Gül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 58
Özet
Diyabet, obezite, hipertansiyon ve kardiyovasküler hastalıklarla ilişkilendirilen en ciddi metabolik bozukluktur. Özellikle Tip II Diyabet'in yüksek prevalansı, buna karşı yeni ilaç geliştirme ihtiyacını işaret etmektedir. Geliştirilen ilaçlarda öncelikle daha yüksek verimlilik ve daha az yan etki hedeflenmektedir. Rekombinant protein temelli biyoteknolojik ilaç molekülleri bu amaç için umut vericidir. Özellikle GLP-1 analogları, kendi kendini sınırlayan mekanizmaları ve insülinotropik etkileriyle bilinmektedir. Bu çalışmada, rekombinant E. coli kullanılarak artırılmış stabilite ve verimliliğe sahip yeni bir GLP-1 analoğu üretilmiştir. Ekspresyon plazmidi, restriksiyon-ligasyon yöntemi ile oluşturulmuş ve tüm plazmit dizilimi ile doğrulanmıştır. Daha sonra, GLP-1 analoğunun verimini en üst düzeye çıkarmak için optimize edilmiş lizis, büyüme ve ekspresyon koşulları izlenerek çeşitli E. coli suşlarına transform edilmiştir. Ön indüksiyon süresi, indüksiyon noktası, indüksiyon IPTG konsantrasyonu ve indüksiyon sonrası sıcaklık gibi çeşitli parametreler, maksimum verimle başarılı ifade için test edilmiştir. Sonuç olarak, E. coli BL21(DE3) suşu, 0.6 OD600nm'de 0.2 mM IPTG indüksiyonu ve 18 °C'de gece boyunca indüksiyon sonrası büyümenin en verimli koşullar olduğu sonucuna ulaşıldı. Bu koşullar altında hedef protein GLP-1 analoğu, çözünmeyen fraksiyon halinde elde edildi. Protein analizi ve saflaştırmanın ardından kantifikasyon yapıldı ve GLP-1 analoğunun en yüksek titresi 626 µg/ml olarak ölçüldü. Gelecekteki beklentiler olarak, başka bir konak organizma kullanmak ve büyüme koşullarını değiştirmek, hedef proteinin çözünür formda elde edilmesini sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Diabetes is the most serious metabolic disorder correlated with obesity, hypertension and cardiovascular conditions. High prevalence of Type II Diabetes Mellitus (T2DM) indicates the need for new medication development. In developing therapeutics, higher efficiency and fewer adverse effect features are targeted primarily. Recombinant protein-based biotechnological drug molecules have been developed and used for the treatment of T2DM. Especially, GLP-1 analogues are known by their self-limiting mechanism and insulinotropic effect. In this study, a novel GLP-1 analogue with increased stability and efficiency is produced using recombinant E. coli. The expression plasmid was constructed and confirmed by restriction digestion and whole plasmid sequencing. Then, itwas transformed into various E. coli strains followed by optimized lysis, growth and expression conditions to maximize the yield of the GLP-1 analogue. Various parameters such as pre-induction time, induction point, induction IPTG concentration and post-induction temperature were tested for the succesfull expression with maximum yield. Consequently, it was achieved that E. coli BL21(DE3) as strain, 0.2 mM IPTG induction at OD600nm of 0.6 and 18 °C overnight post-induction growth was the most promising conditions. Under these conditions, the GLP-1 analogue was obtained in the insoluble fraction. Following protein analysis and purification, quantification was performed and the highest titer of GLP-1 analogue was measured as 626 µg/ml. As future prospect, using another host organism and changing growth conditions can provide obtaining target protein in the soluble form.
Benzer Tezler
- Caretta caretta kaynaklı defensin benzeri TEWP peptidi ve analoglarının Pichia pastoris ekspresyon sisteminde rekombinant üretimi
Recombinant production of TEWP defensin-like peptide from Caretta caretta and its analogues in Pichia pastoris expression system
SAİME GÜLSÜM BATMAN
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiErciyes ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL KESMEN
- Azurinin Lactococcus lactis'te rekombinant üretimi, antimikrobiyal ve sitotoksik etkisinin araştırılması
Recombinant production of azurin in Lactococcus lactis, investigation of its antimicrobial and cytotoxic effects
MELİKE YILDIZ
Doktora
Türkçe
2018
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN AŞKIN
- İstiridye kaynaklı defensin ve prolince zengin antimikrobiyal peptidlerin pichia pastoris'te rekombinant olarak üretimi
Recombinant production of oyster defensin and proline rich antimicrobial peptides in pichia pastoris
MİNE ERDEM BÜYÜKKİRAZ
Doktora
Türkçe
2019
BiyoteknolojiErciyes ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL KESMEN
- Pectobacterium chrysanthemi pektin metilesteraz enziminin Pichia pastoris ile rekombinant üretimi
Recombinant production of pectin methylesterase from Pectobacterium chrysanthemi by Pichia pastoris
MELEK ACAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAĞMUR ÜNVER
- Streptococcus pyogenes virulans enziminin rekombinant üretimi ve spesifik DNA aptamerlerinin geliştirilmesi
Recombinant production of the virulence enzyme from streptococcus pyogenes and development of specific DNA aptamers
MERVE GÜLTAN