Sarkomlarda yeni bir yaklaşım olarak URGCP geninin nörotrofik tirozin kinaz 1,2,3 ve MAPK sinyal iletim yolaklarındaki gen ekspresyonları ile korelasyonunun araştırılması
Correlation of URGCP gene with gene expression in neurotrophic tyrosin kinase 1,2,3 and MAPK signal transduction pathways as a new approach in sarcomas
- Tez No: 898474
- Danışmanlar: PROF. DR. YAVUZ DODURGA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 67
Özet
Sarkom, mezenkimal kökenli heterojen malignite grubuna ait kemik, kas ve yağ doku gibi bağ doku tiplerinde ortaya çıkan bir kanser türüdür. Yaklaşık %20'sini kemik, %80'nini yumuşak doku sarkomları oluşturur. Yumuşak doku sarkomları (STS) tüm malign kanser türlerin % 1'ni kapsayan nadir kanser türlerinden biridir. Gen füzyonları birçok kanser türünde moleküler bir hedef olarak yer aldığı bilinmektedir. Bu gen füzyonlarından biri olan nörotrofik tropomiyozin reseptör kinaz (NTRK)'lar, tropomiyozin reseptör kinaz (TRK) ailesine ait nöral hücrelerin gelişimi ve farklılaşması ile etkili önemli faktörlerdir. Hücre proliferasyonunda önemli bir yeri olan MAPK sinyal yolağı kaskadlarının basamaklarından herhangi birinde gerçekleşen anormali kanser gelişimini etkileyebilir. Ayrıca MAPK sinyal yolu, tümör hücre göçü, invazyonu ve metastazı gibi çeşitli sonuçlara sebep olabilir. Hücre proliferasyonunun yukarı regüle geni 4 (URGCP), hepatosellüler karsinom, osteosarkom dahil birçok kanser türünde tümör gelişimi ve oluşumunda rol oynayan bir onkogendir. MAPK, PI3K, NF-kappa B sinyal yolakları ile hücre proliferasyonunu desteklese de yumuşak doku sarkomlarına olan etkisi ve moleküler mekanizması bilinmemektedir. Yapılan bu çalışmada yumuşak doku sarkomu alt tiplerinde NTRK1,2 ve 3 gen füzyonlarının, MAPK sinyal yolağında ki genlerin ve URGCP onkogeninin ekspresyonları ve korelasyonları araştırılmıştır. Öncelikle 80 STS hastadan elde edilen parafine gömülü formalin fikse edilmiş (FFPE) dokudan örnekler alınarak RNA izolasyonu gerçekleştirdik. Ardından NTRK1,2,3 ve MAPK sinyal yolağından MEK1,2 ve ERK1 genleri ve ayrıca URGCP onkogeni ile ekspresyon seviyelerine bakmak için qPCR ile incelenmiştir. Daha sonrasında bu genlerin birbirleriyle ve STS ile olan korelasyonları analiz edilerek sonuçlandırılmıştır.
Özet (Çeviri)
Sarcoma is a type of cancer that occurs in connective tissue types such as bone, muscle and adipose tissue belonging to the heterogeneous malignancy group of mesenchymal origin. Approximately 20% are bone and 80% are soft tissue sarcomas. Soft tissue sarcomas are one of the rare types of cancer, accounting for 1% of all malignant cancers. Gene fusions are known to be involved as a molecular target in many cancer types. Neurotrophic tropomyosin receptor kinases (NTRKs), one of these gene fusions, are important factors involved in the development and differentiation of neural cells belonging to the tropomyosin receptor kinase (TRK) family. Abnormalities in any of the steps of the MAPK signalling cascades, which have an important role in cell proliferation, may affect cancer development. In addition, the MAPK signalling pathway can cause various consequences such as tumour cell migration, invasion and metastasis. Cell proliferation up-regulated gene 4 (URGCP) is an oncogene involved in tumour development and formation in many cancer types including hepatocellular carcinoma and osteosarcoma. Although it promotes cell proliferation via MAPK, PI3K, NF-kappa B signalling pathways, its effect on soft tissue sarcomas and its molecular mechanism is unknown. In this study, the expression and correlations of NTRK1,2 and 3 gene fusions, MAPK signalling pathway genes and URGCP oncogene in soft tissue sarcoma subtypes were investigated. Firstly, paraffin-embedded paraffin samples obtained from 80 STS patients RNA isolation was performed by taking samples from formalin-fixed (FFPE) tissue. Then NTRK1,2,3 and MEK1,2 and ERK1 genes from the MAPK signalling pathway and also URGCP oncogene were examined by qPCR to look at their expression levels. The correlations of these genes with each other and with STS were then analysed and concluded.
Benzer Tezler
- Defending the boundaries: Understanding identity and the interpretation of events in Kosova vilayet between 1877-1880 through folk music
Sınırları savunmak: Halk müziği üzerinden kimlik ve Kosova vilayetinde 1877-1880 yılları arasında cereyan eden olayların yorumlanması
ABDULNENTOR MUSLIU
- Paying for premium: A critical look into technical audio quality in streaming services
Müzik akış platformlarındaki teknik ses kalitesine eleştirel bir bakış
MUSTAFA KEMAL ÖZTÜRK
- Yuvarlak hücreli sarkomlarda güncel moleküler sınıflama ve klinikopatolojik korelasyon
Current molecular classification of round cell sarcoma and clinicopathological correlation
ZEHRA ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Patolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİL ÇOMUNOĞLU
- Yuvarlak hücreli sarkomlarda güncel klinikopatolojik sınıflama ve prognostik önemi
Contemporary clinicopathological classificationof round cell sarcoma and its prognostic significance
GAMZE GÖKTÜRK ÖZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Patolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİL ÇOMUNOĞLU
- A computational model of social dynamics of musical agreement
Müzikal anlaşmanın toplumsal dinamiklerinin sayısal bir modeli
İSMET ADNAN ÖZTÜREL
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBilişsel Bilim Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN CEM BOZŞAHİN