Bitki büyümesini teşvik edici markörler barındıran bakteriyel izolatların bazı abiyotik stres koşullarına dayanıklılığının ın vıtro koşullarda incelenmesi
In vitro investigation of the resistance of bacterial isolates harboring plant growth promoting markers to some abiotic stress conditions
- Tez No: 899412
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BİLGİN TAŞKIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Bitki büyümesini teşvik eden rizobakteriler (PGPR), bitki büyümesinin arttırılması ve bitki hastalıklarının yönetimi için biyokontrol ajanları olarak kullanılan mikroorganizma grubu olarak tanımlanmıştır. Endofitler ise, bitkilerin doku aralarında/içlerinde yaşayan ancak konukçusunda gözle görülen bir hastalık belirtisine neden olmayan bakteriyel veya fungal mikroorganizmaları kapsar. Bu çalışmada daha önce laboratuvarımızda yürütülen farklı çalışmalarda fosfat çözünürlüğü, indol asetik asit üretimi, siderofor üretimi, azot fiksasyonu gibi PGP (bitki gelişimini destekleyici) markörler açısından kayda değer sonuçlar veren 5 adet izolatın sıcaklık, pH, tuz, kuraklık ve cıva, lityum ve kobalt ağır metallerine karşı toleransları in vitro koşullarda incelenmiştir. Çalışmada, G96Y1, G105K2, G106K1-SV, V14G3 ve V27K3 kod numaralı endofit bakteri izolatları 25oC, 30oC, 35oC, 40oC ve 45oC'de, V14G3 izolatı ise 45oC sıcaklıkta dahi optimum büyüme göstererek en başarılı izolatlar olmuştur. V27K3 izolatı kontrole göre %5 (w/v) tuz konsantrasyonunda optimum derecede büyüme gösterdiği belirlenmiştir. In vitro kuraklık denemelerinde V14G3, G105K2 ve G106Y1 izolatlarının kuraklık stresine karşı en başarılı izolatlar olduğu görülmüştür. Her üç izolatın kontrol gruplarına göre %25 (w/v) PEG konsantrasyonunda dahi kayda değer derecede büyüme gösterdiği ortaya konmuştur. Ağır metal stres denemelerinde, G96Y1 ve V14G3 izolatları 0.05 mM Cıva (Hg) içeren NB sıvı besi ortamında büyüme göstererek Cıvaya karşı en dayanıklı izolatlar olarak değerlendirilmişlerdir. İzolatların Lityum (Li) metalinin farklı konsantrasyonlarındaki büyüme profilleri incelendiğinde 15 mM Lityum içeren NB sıvı besi ortamlarında dahil güçlü bir büyüme ortaya koymuşlardır. Kontrol ile kıyaslama yapıldığında izolatların tümünün Kobalt (Co) metaline karşı hassas olduğu ve test edilen konsantrasyonlarda büyüme gösterememişlerdir. Ayrıca yapılan 16s rRNA dizilemesi sonucunda G96Y1, V14G3, V27K3, G106K1-SV izolatları sırası ile %99.80, %100, %99.58 ve %99.55 benzerlik oranları ile Acinetobacter calcoaceticus, Bacillus halotolerans, Bacillus zhangzhouensis ve Pseudomonas kilonensis suşları ile eşleşmişlerdir.
Özet (Çeviri)
Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) are defined as a group of microorganisms used as biocontrol agents for plant growth promotion and plant disease management. Endophytes include bacterial or fungal microorganisms that live between/inside plant tissues but do not cause visible disease symptoms in their host. In this study, the tolerance of 5 isolates, which gave remarkable results in terms of PGP (plant growth promoting) markers such as phosphate solubility, indole acetic acid production, siderophore production, nitrogen fixation in different studies carried out in our laboratory, to temperature, pH, salt, drought and mercury, lithium and cobalt heavy metals were investigated under in vitro conditions. In the study, endophyte bacterial isolates with code numbers G96Y1, G105K2, G106K1-SV, V14G3 and V27K3 showed optimum growth at 25oC, 30oC, 35oC, 40oC and 45oC, and V14G3 isolate was the most successful isolates even at 45oC. V27K3 isolate showed optimum growth up to 5% (w/v) salt concentration (including 5%) compared to the control tube. In vivo drought experiments showed that V14G3, G105K2 and G106Y1 isolates were the most successful isolates against drought stress. It was revealed that all three isolates showed significant growth up to 25% (w/v) PEG concentration (up to and including 25%) compared to the control tube. In heavy metal stress experiments, G96Y1 and V14G3 isolates showed growth on NB liquid medium containing 0.05 mM mercury (Hg) and were evaluated as the most resistant isolates against Mercury. When the growth profiles of the isolates at different concentrations of Lithium (Li) metal were examined, they showed a strong growth including NB liquid media containing 15 mM Lithium. When compared with the control tube, it was observed that all isolates were sensitive to Cobalt (Co) metal. They failed to grow at the concentrations tested. In addition, as a result of 16s rRNA sequencing, G96Y1, V14G3, V27K3, G106K1-SV isolates were matched with Acinetobacter calcoaceticus, Bacillus halotolerans, Bacillus zhangzhouensis and Pseudomonas kilonensis strains with 99.80%, 100%, 99.58% and 99.55% similarity rates, respectively.
Benzer Tezler
- Endofit bakteri G15S1 izolatının tüm genom dizilemesi, biyokimyasal karakterizasyonu ve bazı ağır metallere karşı duyarlılığının incelenmesi
Whole genome analysis, biochemical characterization and investigation of resistance to some metals of G15S1 endophyte bacterial isolate
RÜMEYSA GÖK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BİLGİN TAŞKIN
- Endofit bakteri izolatlarının tüm genom dizilemesi ve polifazik karaterizasyonu ile biyoaktif metabolit üretme potansiyellerinin açığa çıkarılması
Elucidation of bioactive metabolite production potential of endophyte bacterial isolates by whole genome sequencing and polyphasic characterisation
TÜLAY ORUÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BİLGİN TAŞKIN
- Bitki büyümesini teşvik edici özelliğe sahip bakterilerin buğday rizosferinden izolasyonu, saflaştırılması, biyokimyasal ve moleküler biyolojik yöntemlerle tanımlanması
Isolation, purification and identification of plant growth promoting bacteria from wheat rhizosphere by biochemical and molecular biological methods
SENANUR ACET
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
MikrobiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MİNE GÜL ŞEKER
- Bitki büyüme düzenleyici bakterilerin karakterizasyonu
Plant growth promoting bacteria characterization
ALPER DEDE
- Bitki büyümesini arttırıcı bazı rhizobakteri türlerinin sulu ve susuz koşullarda yetiştirilen kavunlarda bitki gelişimi ve meyve kalitesi üzerine etkileri
The effects of some rhizobacteria species on plant developement and fruit quality in melons grown under irrigated and non-irrigated conditions
İBRAHİM KUTALMIŞ KUTSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Ziraatİnönü ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM ALTUNTAŞ