Molecular cloning and bioinformatic analysis of centromeric histone H3 (CenH3) gene in species of onobrychis
Onobrychis cinsine ait türlerde sentromerik histon H3 (CenH3) geninin moleküler klonlaması ve biyoinformatik analizi
- Tez No: 900433
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET LATİF TEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoenformatik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Bu çalışmada Onobrychis cinsine ait farklı türlerinin CenH3 genomik lokusunun karakterizasyonu yapılmıştır. Yapılan çalışma moleküler klonlama yöntemi ile gerçekleştirilmiştir ve elde edilen bulgular biyoenformatik yöntemlerle analiz edilmiştir. Onobrychis cinsindeki CenH3 varyantları, CenH3-α ve CenH3-β olmak üzere iki ana grupta in silico olarak tespit edilmiştir. CenH3-α grubu 3 farklı varyant içerirken, CenH3-β grubu 2 farklı varyant içermektedir. O. hajastana (2n=2×=14) türü CenH3-α varyantına ve CenH3-β varyantlarından birisine sahipken, O. altissima (2n=2×=14 / 2n=4×=28), O. biebersteinii (2n=4×=28), O. oxydanta (2n=2×=14) CenH3-β grubunun diğer varyantına sahiptir. Elde edilen sonuçlar kültürü yapılan tür olan O. viciifolia'nın (2n=4×=28) allotetraploid olduğu yönündeki bulguları desteklemektedir ve atalarının O. hajastana ve O. oxydanta olabileceğini işaret etmektedir. Onobrychis cinsinde yapılan genetik çalışmaların eksikliği önem taşımaktadır. Filogenetik analiz çalışmaları ve sentromerin evrimsel sürecinin aydınlatılması için Onobrychis cinsi bazında yapılan özgün ve öncü bir çalışmadır.
Özet (Çeviri)
In this study, the CenH3 genomic locus of different species of the genus Onobrychis was characterized. The study was carried out by molecular cloning method and the results were analyzed by bioinformatic methods. CenH3 variants of Onobrychis genus were into two main groups, CenH3-α and CenH3-β in silico. CenH3-α group contains 3 different variants, while CenH3-β group contains 2 different variants. The species O. hajastana (2n=2×=14) has the CenH3-α variant and one of the CenH3-β variants, while O. altissima (2n=2×=14 / 2n=4×=28), O. biebersteinii (2n=4×=28), O. oxydanta (2n=2×=14) have the other variant of the CenH3-β group. The results support the findings that the cultivated species O. viciifolia (2n=4×=28) may be allotetraploid and suggest that its ancestors may be O. hajastana and O. oxydanta. There is important defects of genetic studies in the Onobrychis genus. So, this is an original and pioneering study in the Onobrychis genus for phylogenetic analysis and elucidation of the evolutionary process of the centromere.
Benzer Tezler
- Yabani soya türlerinde CenH3 geninin cDNA moleküler klonlanması
cDNA molecular cloning of CenH3 gene in wild soybean species
HÜMEYRA YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
GenetikNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
- SMN2 geni promotorunun klonlanması ve karakterizasyonu
Cloning and characterization of the SMN2 gene promotor
MERVE DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikBalıkesir ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA TOKAY
PROF. DR. FERAY KÖÇKAR
- Yüksek tuz toleransına sahip fasulye genotipinde tolerans ile ilgili transkripsiyon faktörlerinin belirlenmesi
Determi̇nati̇on of transcri̇pti̇on factors related to tolerances i̇n bean genotype wi̇th hi̇gh salt tolerances
GÖKHAN GÖKDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSA KAVAS
- Molecular and bioinformatic identification of two sterol methyltransferases which are involved in plant sterol biosynthesis in olive (Olea europaea L.)
Bitki sterol biyosentezinde görev alan iki sterol metiltransferaz geninin moleküler ve biyoinformatik olarak zeytin (Olea europaea L.) genomunda tanımlanması
KÜBRA ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL MELİH TAŞKIN
- Glukoz-6-fosfat-1-epimeraz ve mikrotübül ilişkili protein genlerinin biyoinformatik analizi
Bioinformatic analysis of protein genes related to glucose-6-phosphate-1-epimerase and microtubula
SUNA SANCAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiBalıkesir ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLENDAM TÜMEN