Geri Dön

Parkinson hastalığı ile ilişkili bazı genlerdeki yüksek riskli zararlı snp'lerin etkilerinin in siliko yöntemlerle belirlenmesi

Determination of the effects of high-risk deleterious snps in some genes associated with parkinson's disease by in silico methods

PDF İndir

  1. Tez No: 905241
  2. Yazar: AHU TUNÇ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ORÇUN AVŞAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hitit Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Nörodejeneratif bir hastalık olan Parkinson hastalığı oldukça kompleks bir etiyolojiye sahiptir. Belli çevresel faktörlere karşı genetik yatkınlığı olan bireylerde, maruz kalınan çevresel faktörlerin kliniği ortaya çıkardığı düşünülebilir. Bununla birlikte genetik faktörlerin tek başına hastalığın etiyolojisinde çok önemli bir rol oynadığı bilinmektedir. Parkinson hastalığı için belirtilmiş genetik faktörler arasında mutasyonlar ve polimorfizmler yer almaktadır. Bu tez çalışmasında,Parkinson hastalığı ile ilişkili olduğu düşünülen SNCA, CD38, GBA, LRP10, EIF4G1, VPS35, PLA2G6, PINK1, LRRK2, UQCR1 ve MMRN1 genlerinde bulunan tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP) çeşitli biyoinformatik araçlar kullanılarak proteinlerin fonksiyonu, yapısı, stabilizasyonu, evrimsel korunumu üzerine olan olası etkilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Sonuç olarak MMRN1 geni için rs1046993 (L982S), rs61734879 (N1075K), rs1432306000 (8G274), rs147438202 (R1057M), rs147438202 (G16R), rs147451161 (R1227L), rs148141919 (Q394R), rs149261966 (S1155R), rs189386556 (S414P), rs199716183 (Y1097H), rs200526047 (P651H), rs201006967 (P1140L), rs201761344 (N1084S), rs369001499 (M1100K), rs370732997 (D726Y), rs373754512 (D225G), rs374677318 (C592Y), rs376506594 (C211Y) polimorfizmlerinin zararlı etkili olabileceği belirlendi. UQCR1 geni için rs201911056 (R276C), rs145869559 (G312S), rs191821836 (R165S), rs200354059 (R378C) varyantlarının ve LRRK2 geni için ise rs4640000 (P1262A), rs33995463 (L119P), rs150050676 (N246H) varyantlarının zararlı olabileceği belirlendi. Belirlenen zararlı etkili SNP'lerin çeşitli biyolojik süreçlerde rol alan proteinlerin yapısal ve fonksiyonel değişikliklerine neden olabileceği ve bu değişikliklerin sonucunda biyolojik süreçleri olumsuz olarak etkileyebilecekleri tahmin edildi. Bu çalışmada patojenik olarak tanımlanan missense SNP'ler Parkinson hastalığı için risk faktörü olarak değerlendirilmiştir.Bu patojenik missense SNP'lerin biyobelirteç olarak kullanılma potansiyelleri teşhis ve tedavi için bir temel oluşturabilir. Bu tez çalışmasından elde edilen sonuçların Parkinson hastalığı ile ilgili yapılacak in vitro ve in vivoileriçalışmalar tarafından doğrulanması gerekmektedir.

Özet (Çeviri)

Parkinson's disease, which is a neurodegenerative disease, has a very complex etiology. In individuals with a genetic predisposition to certain environmental factors, it is conceivable that the environmental factors they are exposed to lead to the clinic. However, it is known that genetic factors alone play a significant role in the etiology of the disease. Mutations and polymorphisms are among the genetic factors specified for Parkinson's disease. It was aimed to determine the possible effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in SNCA, CD38, GBA, LRP10, EIF4G1, VPS35, PLA2G6, PINK1, LRRK2, UQCR1, MMRN1 genes on the function, structure, stabilization, and evolutionary conservation of proteins using various bioinformatics tools. For theMMRN1 gene, it was determined that rs1046993 (L982S), rs61734879 (N1075K), rs1432306000 (8G274), rs147438202 (R1057M) rs147438202 (G16R), rs147451161 (R1227L), rs148141919 (Q394R), rs149261966 (S1155R), rs189386556 (S414P), rs199716183 (Y1097H), rs200526047 (P651H), rs201006967 (P1140L), rs201761344 (N1084S), rs369001499 (M1100K), rs370732997 (D726Y), rs373754512 (D225G), rs374677318 (C592Y), rs376506594 (C211Y) polymorphisms may have damaging effects.It was determined that rs201911056 (R276C), rs145869559 (G312S), rs191821836 (R165S), rs200354059 (R378C) variants for theUQCR1 gene and rs4640000 (P1262A), rs33995463 (L119P), rs150050676 (N246H) variants for the LRRK2 gene might be pathogenic.It was predicted that the identified missense SNPs may cause structural and functional changes in proteins involved in various biological processes and, as a result of these changes, adversely affect biological processes. In this study, the missense SNPs identified as pathogenic were evaluated as risk factors for Parkinson's disease. The potential use of these pathogenic missense SNPs as biomarkers may provide a basis for diagnosis and treatment. The results of this studyneed to be confirmed by further in vitro and in vivo studies in Parkinson's disease.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    818583

    Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study

    Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma

    DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaSüleyman Demirel Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU

  2. Tez No

    779059

    Parkinson hastalığında GRIN2B gen polimorfizmlerinin dürtü kontrol bozukluğu ile ilişkisi

    Association of impulse control disorder with GRIN2B gene polymorphisims in Parkinson's patients

    GHAZAL MEMARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU ERZURUMLUOĞLU GÖKALP

  3. Tez No

    751034

    LPS indüklü HMC3 mikroglia nöroinflamasyon modelinde Topo IIß gen ifadesinin susturulmasının incelenmesi

    Investigation of silencing of Topo IIß gene expression in LPS-induced HMC3 microglia neuroinflammation model

    MELİKE CANSEL EREN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikÜsküdar Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVİM IŞIK

  4. Tez No

    301245

    Dopamin replasman tedavisi alan idiopatik parkinson hastalarında dürtü kontrol bozukluğu sıklığı ve bu sendromlarla ilişkili olabilecek bazı risk faktörlerinin belirlenmesi

    Dopamin replasman tedavisi alan idiopatik parkinson hastalarında dürtü kontrol bozukluğu sıklığı ve bu sendromlarla ilişkili olabilecek bazı risk faktörlerinin belirlenmesi

    SELDA ÖZŞAHİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    NörolojiMarmara Üniversitesi

    Nörolojik Bilimler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK İNCE GÜNAL

  5. Tez No

    141834

    Entakaponun parkinson hastalığında gözlenen uyku bozuklukları üzerine etkisi

    The effect of entacapone on sleep disorders observed in parkinson disease

    BETÜL ZANTUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    NörolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GALİP AKHAN

Geri Dön