Analysis of HLA and receptor gene polymorphisms in multiple myeloma
Multipl myelomda HLA ve reseptör gen polimorfizmlerinin analizi
- Tez No: 908447
- Danışmanlar: PROF. DR. NÜLÜFER TÜLÜN GÜRAY, PROF. DR. MERAL BEKSAÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Hematoloji, Genetik, Biyoistatistik, Hematology, Genetics, Biostatistics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Multipl miyelom (MM), özellikle yaşlıları ve erkekleri etkileyen ve Afrika kökenlilerde daha sık görülen, tedavi edilebilen ancak nadiren iyileştirilebilen bir neoplastik plazma hücre hastalığıdır. Doğal öldürücü (NK) hücreler, enfeksiyonlara ve kansere karşı bağışıklık yanıtında rol oynarlar. Tümörlerin tanınması, NK hücre üzerindeki KIR reseptörleri ile hedef hücrelerdeki ligandlar aracılığıyla gerçekleşir. Polimorfik yapıları nedeniyle çok sayıda olan KIR-HLA kombinasyonları nedeniyle ilişkilendirme çalışmalarında istatistiksel güç zayıf kalmaktadır. Birkaç çalışmada KIR/HLA ligandları ile MM yatkınlığı arasında çelişkili sonuçlar rapor edilmiştir. Bu çalışmada, alternatif bir yaklaşımla örneklem büyüklüğünü arttırmak için çeşitli çalışmaların mevcut genomik verileri kullanılarak KIR ve HLA ligandlarının MM hastalarına etkisinin farklı popülasyonlarda araştırılması amaçlanmıştır. Yerel MM hastalarına ek olarak, en büyük MM veri tabanlarından birine ait tüm ekzom dizileme verisinden KIR ve HLA genleri impute edilmiştir. Yerel hastalarda yapılan ön çalışmada aktivatör KIR'ların koruyucu etkisi ve KIR/HLA ligandları ile MM tanı yaşı arasında ilişki saptanmıştır. Arttırılan örneklem büyüklüğü sayesinde önceki çalışmalarda rastlanmayan Bw4 ligandının (HLA-B moleküllerinin genel epitoplarından biri) MM yatkınlığına etkisi ve KIR 3DL1 ve 3DS1 genlerinin karşılık gelen HLA ligandı Bw4 ile iki yönlü bir etkileşim gösterdiği saptanmıştır. Dahası, Afrikalı Amerikalılarda koruyucu genotiplerin düşük frekansta ve yüksek riskli genotiplerin ise daha sık görülmesi, KIR/HLA ligandları ile etnik farklılıklar arasında bir ilişki olabileceğine işaret etmektedir. Son olarak, bu çalışmada KIR/HLA-MM ilişkilendirme çalışmaları için bir referans model sunulmakta, ilaveten KIR ve HLA allotiplerinin çeşitli hastalıklar üzerindeki etkilerini araştırmaya yönelik dünya genelindeki büyük genomik veri setlerinin kullanılabilmesinin önünü açan valide edilmiş bir metodoloji ortaya konmaktadır.
Özet (Çeviri)
Multiple myeloma (MM) is a treatable but rarely curable neoplastic plasma-cell disorder, primarily effecting elderly with a male predilection with a higher incidence rate in African ancestry. Natural killer (NK) cells are regulators of immune response against infections and cancer. Tumor cells are recognized through their human leukocyte antigen (HLA) ligands by killer cell immunoglobulin-like (KIR) receptors on NK cells. Due to their highly polymorphic structure, numerous combinations of KIR-HLA pairs result in underpowered statistical significance in KIR/HLA association studies. A few studies reported conflicting associations between KIR/HLA ligands and MM, due to the limited number of participants. In this study, an alternative approach was conducted to increase the sample size by using large existing data from various studies aiming to investigate the effect of KIR and HLA ligands on MM in different populations. Along with the local patients, KIR and HLA genes were imputed from the whole exome sequencing data belong to one of the largest MM datasets. The preliminary findings on a local cohort have revealed the protective role of activating KIR as well as an association between KIR/HLA ligands and age of MM onset. Remarkably, increasing the sample size uncovered the predisposing effect of Bw4 ligand (one of the public epitopes of HLA-B molecules), and a bidirectional interaction between KIR genes 3DL1, 3DS1 and their cognate ligand Bw4, that had not been reported in prior studies. Moreover, low frequencies of the protective genotypes and high frequencies of the predisposing genotypes among African Americans suggests a relationship between KIR/HLA ligands and ethnic disparities in MM. Finally, this study provides a reference model for the association between KIR/ligand genotypes and MM. It also presents a validated methodology for the global integration of large genomic datasets, enabling accurate evaluation of KIR and HLA allotypes across various disease courses.
Benzer Tezler
- Çimentonun sertleşmesi üzerinde kimyasal komponentlerin etkisi
Başlık çevirisi yok
NACİYE TÜRKEL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CEBE
- Nükleer rezonasta moleküler yapıların incelenmesi (yapısal faz geçiş kuramları üzerine bir inceleme)
Başlık çevirisi yok
ABDURRAHMAN ANDİÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Fizik ve Fizik MühendisliğiUludağ ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTAÇ YALÇINER
- Makro besin elementlerinin (NPK) İzmir'de Mayıs ayında açığa dikilen 4-6 cm çevre büyüklüğündeki Gladiolus cinsine ait“hunting song”ve“Novalüx”kültür çeşitlerinin yumrularının gelişmeleri üzerine etkileri
Başlık çevirisi yok
TAHA ALİ AMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
ZiraatEge ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN HATİPOĞLU
- Dokuma kumaşlarda örgü tipinin ham kumaşın boyutları ve geometrik özellikleri üzerindeki etkilerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
EMEL ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNGÖR BAŞER
- İki katlı pamuk ipliklerinden dokunan kumaşlarda örgüye bağlı olarak maksimum atkı sıklığının değişimi üzerinde bir araştırma
Başlık çevirisi yok
MELTEM ASLI NARTER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNGÖR BAŞER