Geri Dön

Genetik kodlanmış floresans biyosensörlerin tasarımı ve optimizasyonu

Design and optimization of genetically encoded fluorescent biosensors

PDF İndir

  1. Tez No: 909849
  2. Yazar: GÖZDE ÜLKER
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SERAP EVRAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ CANAN ÖZYURT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 58

Özet

p-Kumarik asit, flavonoidler ve polifenoller gibi önemli metabolitlerin biyosentezinde öncü rol oynayan bir bileşiktir. Bu molekülün metabolizmadaki işlevini anlamak ve mikroorganizmalarda üretilen miktarını belirlemek için, hücre içinde gerçek zamanlı analiz yapabilen biyosensörlere ihtiyaç vardır. HPLC gibi geleneksel yöntemler hücre içinde gerçek zamanlı görüntüle çalışmaları için uygun değildir. Bu tez kapsamında p-kumarik asidin tayini için floresans protein temelli, genetik olarak kodlanabilir bir biyosensör geliştirildi. p-Kumarik aside özgü bir protein olan PadR ile floresans özelliği taşıyan mCherry proteinlerini kodlayan gen fragmentlerinin füzyonu yoluyla biyosensör proteini tasarlanarak p-kumarik asit varlığında sinyal veren bir biyosensör geliştirildi. Genetik olarak kodlanmış biyosensörler in vivo uygulamalarda kullanım için uygundur. Tez çalışmasında geliştirilen genetik kodlanmış p-kumarik asitin hücre içinde gerçek zamanlı tayininde kullanılabileceği öngörülmektedir.

Özet (Çeviri)

p-Coumaric acid is a compound that plays a leading role in the biosynthesis of important metabolites such as flavonoids and polyphenols. To understand the function of this molecule in metabolism and to determine the amount produced in microorganisms, biosensors that can perform real-time analysis within the cell are needed. Conventional methods, such as HPLC are not suitable for real-time imaging studies within cells. Within the scope of this thesis, a fluorescent protein-based, genetically encodable biosensor was developed for the determination of p-coumaric acid. A biosensor that gives a p-coumaric acid-specific signal was developed by designing a biosensor protein by fusion of PadR, a p-coumaric acid-specific protein, with gene fragments encoding fluorescent mCherry proteins. Genetically encoded biosensors are appropriate for in vivo applications. It is proposed that the genetically encoded p-coumaric acid developed in the thesis study can be used for real-time detection within the cell.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    371445

    Protein mühendisliği yoluyla ligand bağlayıcı protein ve fotoprotein temelli genetik kodlanmış sensörlerin tasarlanması

    Designing of ligand binding protein and photoprotein based genetically encoded sensors via protein engineering

    CANAN ÖZYURT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AZMİ TELEFONCU

    DOÇ. DR. SERAP EVRAN

  2. Tez No

    897066

    Investigation of conformational dynamics of single fluorescent protein-based biosensors by molecular dynamics simulations

    Tek floresan proteı̇n tabanlı bı̇yosensörlerı̇n konformasyonel dı̇namı̇klerı̇nı̇n moleküler dı̇namı̇k sı̇mülasyonlarıyla ı̇ncelenmesı̇

    MELİKE BERKSÖZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyofizikSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CANAN ATILGAN

  3. Tez No

    759551

    Computational design of a protein-based coenzyme A biosensor

    Protein temelli bir koenzim A biyosensörünün hesaplamalı dizaynı

    DİLŞAH NUR ELMACI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyofizikSabancı Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CANAN ATILGAN

  4. Tez No

    643494

    Shedding new light on intracellular signaling pathways -establishing live-cell fluorescence imaging techniques using genetically encoded fluorescent biosensors

    Genetik kodlanmış floresan biyosensörler yardımıyla floresan görüntüleme teknikleri kullanılarak tek hücre analiz yaklaşımları

    HAMZA YUSUF ALTUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyokimyaSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. EMRAH EROĞLU

  5. Tez No

    819171

    Three dimensional micro/nano-patterning of biomolecules for high throughput physiological sensing

    Yüksek verimli fizyolojik teşhis için biomoleküllerin üç boyutlu mikro/nano-modellenmesi

    LEYLA NESRİN KAHYAOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyomühendislikPurdue University

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. JENNA L RICKUS

Geri Dön