Kedi ve köpeklerde giardiasis ve moleküler teşhisi
Giardiasis and moleculer diagnosis in cats and dogs
- Tez No: 910577
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ARİF ÇİLOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Veteriner Hekimliği, Parasitology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Assemblage, β-giardin, Giardia duodenalis, Nevşehir, PCR, Assemblage, β-giardin, Giardia duodenalis, Nevşehir, PCR
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Bu çalışmada, Nevşehir yöresinde çeşitli şikayetler ile özel veteriner kliniklerine getirilen sahipli kedi ve köpeklerde, Giardia duodenalis'in moleküler prevalansının araştırılması, genetik karakterizasyonlarının sağlanması, filogenetik yapılanmalarının belirlenmesi ve moleküler epidemiyolojik veriler kapsamında kedi ve köpeklerin halk sağlığı yönünden risk faktörlerinin ortaya konması amaçlanmıştır. Bu amaçla 2023 yılında Nevşehir yöresinde farklı yaş ve cinsiyetteki sahipli 100 kedi ve 100 köpekten tekniğine uygun olarak toplam 200 adet dışkı örneği toplanmıştır. Takiben toplanan dışkı örneklerinden genomik DNA izolasyonu gerçekleştirilmiş ve sonrasında elde edilen genomik DNA izolatları, β-giardin gen bölgesini amplifiye eden spesifik primerlerle nested PCR analizine tabi tutulmuştur. PCR analizleri sonucu ikisi kedi ve biri köpek olmak üzere toplam üç (%1,5) örnek G. duodenalis DNA'sı yönünden pozitif belirlenmiştir. Pozitif belirlenen amplikonlar, jel pürifikasyon işlemlerinden sonra 2. PCR primerleri ile sekans analizlerine tabi tutulmuş ve hedef gen bölgesi dizilimleri elde edilmiştir. Nükleotid dizileri belirlenen izolatların üç farklı genotip olarak gruplandığı tespit edilmiş ve GenBank veri tabanı kayıtları gerçekleştirilmiştir (PQ514072-4). Elde edilen izolatların Dünya'daki diğer G. duodenalis izolatları ile çoklu hizalamaları yapılarak filogenetik analizleri gerçekleştirilmiştir. Yapılan çoklu hizalama ve filogenetik analizler sonucunda sahipli kedilerden elde edilen izolatların zoonotik Assemblage B ile Assemblage C ve sahipli köpekten elde edilen izolatın Assemblage D'de yer aldığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak bu tez çalışması ile Nevşehir yöresinde sahipli kedi ve köpeklerde ilk kez G. duodenalis'in moleküler karakterizasyonu yapılmış, filogenetik yapılanmaları belirlenmiş ve G. duodenalis'in zoonotik genotipleri temelinde sahipli kedi ve köpeklerin halk sağlığı yönünden oluşturabileceği risk potansiyelleri ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
This study aimed to investigate the molecular prevalence of Giardia duodenalis in owned cats and dogs presented to private veterinary clinics in the Nevşehir region with various clinical complaints. The objectives included determining the genetic characterization and phylogenetic relationships of the isolates and evaluating the potential public health risks posed by cats and dogs in the context of molecular epidemiological data. For this purpose, 200 fecal samples were collected in 2023 from 100 owned cats and 100 owned dogs of different ages and sexes in the Nevşehir region. Fecal samples were collected in accordance with proper sampling techniques. Genomic DNA was subsequently isolated from the fecal samples. The extracted DNA was then subjected to nested PCR using specific primers targeting the β-giardin gene region. PCR analysis identified G. duodenalis DNA in three samples (1.5%): two from cats and one from a dog. Positive amplicons were purified using gel purification and sequenced with second-round PCR primers to obtain nucleotide sequences. Sequence analysis revealed three distinct genotypes among the isolates. These genotypes were submitted to the GenBank database with accession numbers PQ514072-4. Phylogenetic analyses were performed by aligning the sequences with those of other G. duodenalis isolates globally. Multiple sequence alignment and phylogenetic tree construction indicated that the isolates obtained from cats belonged to zoonotic Assemblage B and Assemblage C, whereas the isolate from the dog was classified as Assemblage D. This study represents the first molecular characterization and phylogenetic analysis of G. duodenalis in owned cats and dogs in the Nevşehir region. It highlights the potential public health risks posed by owned cats and dogs based on the zoonotic genotypes of the pathogen.
Benzer Tezler
- Kedi ve köpeklerde üriner sistemin cerrahi hastalıkları üzerinde karşılaştırmalı araştırmalar
Başlık çevirisi yok
METİN KAYA
Doktora
Türkçe
1985
Veteriner Hekimliğiİstanbul ÜniversitesiCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AKIN FİNCİ
- Kedi ve köpeklerde periodontal hastalıkların klinik ve radyografik değerlendirilmesi
A Study of periodontal diseases in pets according to their clinical and radiographical characteristics
LEYLA GENCER
Doktora
Türkçe
1999
Genel Cerrahiİstanbul ÜniversitesiCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. S. ERDEM ACER
- Kedi ve köpeklerde genişlemiş spektrumlu beta laktamaz, AMPC beta laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella pneumoniae izolatlarının prevalansı ve moleküler tiplendirmesi
The prevalence and molecular typing of extended spectrum beta lactamase and ampc beta lactamase producer escherichia coli and klebsiella pneumoniae isolates of cats and dogs
MERVE GİZEM SEZENER
Doktora
Türkçe
2022
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU FINDIK
- Kedi ve köpeklerde ekstiremite kırıklarının minimal invaziv plak osteosentezi (MİPO) ile klinik sağaltımının değerlendirilmesi
Clinical evaluation of minimally invasive plate osteosynthesis (MİPO) treatment of extremity fractures in cats and dogs.
BAHADIR KARAN
Doktora
Türkçe
2021
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KÜRŞAT ÖZER
- Kedi ve köpeklerde pleural efüzyonun tanısal değerlendirilmesinde radyografik, ultrasonografik ve torakoskopik yaklaşım
Radiographic, Ultrasonographic, Thoracoscopic Approach in Diagnostic Evaluation of Pleural Effusion in Dogs and Cats.
YUSUF ŞEN
Doktora
Türkçe
2011
Genel CerrahiAnkara ÜniversitesiCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ BUMİN