Geri Dön

Ekstrasellüler genom materyallerinin meme kanseri üzerine etkisi

The effect of extracellular genome materials on breast cancer

  1. Tez No: 911606
  2. Yazar: BÜŞRA YAŞA ÇEVİK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 163

Özet

Amaç: Meme kanseri, her yıl 2 milyondan fazla yeni vaka ile kadınlar arasında en yaygın görülen kanser türüdür. Kanser hücrelerinde gözlemlenen genomik kararsızlık kanserin ilerlemesinde kritik bir rol oynar. Kanser hücrelerinin kan ve lenfatik sistemler aracılığıyla sağlıklı hücrelere yayılıp onları etkileme süreci metastaz olarak adlandırılır. Bu süreçte, kanser hücreleri tarafından salgılanan ekstraselüler veziküller ve hücre dışı DNA (hdDNA) gibi ekstrasellüler genom materyallerin (EGM), sağlıklı hücrelerde genomik kararsızlık oluşturma potansiyeli ve metastazdaki rolü büyük ölçüde bilinmemektedir. Bu bağlamda, hipotezimiz“Meme kanseri hücrelerinden kaynaklanan EGM'lerin genometastaz mekanizmasıyla sağlıklı hücrelerde genomik kararsızlığı tetiklediği”yönündedir. Yöntem: Çalışmamızda, meme kanseri MCF-7, SKBR3 ve MDA-MB231 hücre hatları ile Luminal A, HER2 pozitif (HER2+) ve Üçlü Negatif alt gruplara ait hastaların ameliyat öncesi ve sonrası perifer kan örnekleri ile ameliyat sonrası alınan doku örneklerinden izole edilen EGM'ler kullanılarak bir in-vitro sağlıklı hücre-kanserleşme modeli oluşturulmuştur. Çalışmada, Luminal A tanısı almış 13 hasta, HER2(+) tanısı almış 5 hasta ve Üçlü negatif tanısı almış 2 hasta kullanılmıştır. Bu kurguda, hücre hatlarından ve hastalardan elde edilen EGM'ler için optimum miktar tespit edilmiş ve akabinde eksozom (5 mg/ml), hdDNA (2 ng/µl) ve toplam serum (100 µl) sağlıklı meme epitel hücre hattı MCF10A (5x104 hücre) üzerine pasif transfekte edilmiş ve transfekte edilmemiş kontrol MCF10A hücreleriyle kıyaslanmıştır. Çalışma kapsamında, apoptoz tayini, hücre göçünü değerlendirmek için migrasyon analizi, iki katına çıkma süresi ölçümleri, mRNA transkriptom analizi ve bu analizlerden elde edilen verilere dayanarak seçilen genomik kararsızlıkla ilişkili genlerin anlatım deneyleri gerçekleştirilmiştir. Bulgular: İn-vitro deneylerde hücre hatlarından ve hastalardan elde edilen EGM'lerin MCF10A hücrelerinde kontrol hücrelerine kıyasla apoptoz ve migrasyon seviyelerinde anlamlı bir artışa yol açtığı gözlemlenmiştir (p0.91). Ayrıca, hücre hatlarından elde edilen eksozom ve total serum ile MDA-MB231 hücre hattından elde edilen hdDNA'nın ve hasta örneklerinden elde edilen eksozom ve total serumun pasif transfeksiyonu, MCF10A hücrelerinde ikiye katlanma süresinin anlamlı şekilde azaldığını ortaya koymuştur (p

Özet (Çeviri)

Objektive: Breast cancer is the most common type of cancer among women, with over 2 million new cases diagnosed annually. Genomic instability observed in cancer cells plays a critical role in cancer progression. The process by which cancer cells spread through the blood and lymphatic systems to healthy cells is referred to as metastasis. In this process, extracellular genomic materials (EGMs) such as extracellular vesicles secreted by cancer cells and cell-free DNA (cfDNA) have the potential to induce genomic instability in healthy cells; however, their role in metastasis remains largely unknown. In this context, our hypothesis is that "EGMs derived from breast cancer cells trigger genomic instability in healthy cells through the genometastasis mechanism. Methods: In our study, an in vitro healthy cell-cancer model was created using pre- and postoperative peripheral blood samples and EGMs isolated from postoperative tissue samples of patients with breast cancer MCF-7, SKBR3 and MDA-MB231 cell lines and Luminal A, HER2 positive (HER2+) and Triple Negative subgroups. The study included 13 patients diagnosed with Luminal A, 5 patients with HER2(+), and 2 patients with Triple-Negative breast cancer. In this framework, the optimal amounts of EGMs obtained from cell lines and patients were determined. Subsequently, exosomes (5 mg/ml), cfDNA (2 ng/µl), and total serum (100 µl) were passively transfected onto a healthy breast epithelial cell line, MCF10A (5x10⁴ cells), and compared with non-transfected control MCF10A cells. The study included apoptosis assays, migration analyses to evaluate cell motility, doubling time measurements, mRNA transcriptome analysis, and expression studies of genes associated with genomic instability, selected based on the transcriptome data. Results: In in vitro experiments, EGMs obtained from cell lines and patients were observed to cause a significant increase in apoptosis and migration levels in MCF10A cells compared to control cells (p0.91). Furthermore, the passive transfection of exosomes and total serum obtained from cell lines, hdDNA from the MDA-MB231 cell line, and exosomes and total serum from patient samples significantly reduced the doubling time of MCF10A cells (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    547167

    Molecular cloning and production of recombinant hODF extracellular domain

    Rekombinant hODF ekstrasellüler domain'in moleküler klonlanması ve üretimi

    MUHAMMET MEMON

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUHAMMED KASIM DİRİL

  2. Tez No

    685679

    Recombinant production and characterization of matrix metalloproteinases- 1 and -13 for treatment of macular corneal dystrophy

    Matriks metalloproteinaz -1 ve -13'ün maküler kornea distrofisi tedavisi için rekombinant üretimi ve karakterizasyonu

    SANİYE GÜL KAYA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN KARAKÜLAH

    DR. SİBEL KALYONCU UZUNLAR

  3. Tez No

    447511

    Larenks kanserlerinde tüm genom ekspresyon farklılığının belirlenmesi ve klinik önemi

    Determination of whole genome expression differences inlarynx cancers and clinical significance

    EMİNE GÖKTAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    GenetikNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. MAHMUT SELMAN YILDIRIM

  4. Tez No

    242508

    Sülfidril grubu içeren bileşiklerin tat-proteini (Transkripsiyon transaktivatörü) üzerine etkileri

    Effects of compounds containing sulphydrile group on tat protein (Transcription transactivator)

    BUKET KARAMANOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyokimyaErciyes Üniversitesi

    Eczacılık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN DEMİRHAN

  5. Tez No

    786846

    Polihidroksibütirat üretimi için entegre multi-omik, mekanistik makina ögrenmesi ve CRISPR yaklaşımı

    An integrated multi-omics, mechanistic machine learning and CRISPR approach for polyhydroxybutyrate production

    BLAISE MANGA ENUH

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Bilim ve TeknolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Biyogüvenlik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK

Geri Dön