Çölyak hastalığında BACH2 gen varyantlarının analizi
Analysis of BACH2 gene variants in celiac disease
- Tez No: 911632
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDE KÜÇÜK KURTULGAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
Çölyak Hastalığı (ÇH), genetik olarak duyarlı bireylerde gluten alımıyla oluşan ve esas olarak ince bağırsağı etkileyen otoimmün bir bozukluktur. Glutenle aktive olan bağışıklık hücrelerinin ince bağırsak mukozal hücrelerine saldırması sonucu başlıca malabsorbsiyon, diyare, karın şişkinliği, kilo kaybı ve çocuklarda büyüme geriliği gibi bulgular ortaya çıkabilmektedir. Etiyolojisinde immünolojik, genetik ve çevresel faktörlerin birlikte rol aldığı multifaktöriyel ve multisistemik bir hastalıktır. BACH2 vücutta immünite ve tolerans arasındaki dengenin korunmasında etkili olduğu bilinen bir gen olup, CD4+ T hücre alt gruplarındaki hücreye özgü düzenlemeleri sayesinde immün regülasyonu korumaktadır. Son dönemlerde BACH2'nin ÇH dahil olmak üzere otoimmün hastalıklar ile ilişkisine dikkat çekilmiştir. Bu çalışmada Çölyak hastaları ile kontrol grubunun BACH2 rs11755527 ve rs2474619 gen varyantları açısından karşılaştırılması ve hasta grubunda histopatolojik Marsh grupları ve HLA haplotiplerinin hastalıkla ve ilgili gen varyantlarıyla ilişkisinin değerlendirilmesi ve bu bağlamda, elde edilecek sonuçlarla ÇH'nın etiyopatogenezinin aydınlatılmasına ve olası yeni tedavi protokollerine katkı sağlanması amaçlandı. Çalışmamıza 100 Çölyak tanılı hasta ve 100 sağlıklı kontrol dahil edildi. Katılımcıların yaş, cinsiyet, aile öyküsü, Marsh skorları, HLA genotipleri ve VKİ bilgileri kaydedildi. Hasta ve kontrol grubumuzdan DNA izolasyonu yapıldı ve real time-PCR yöntemi ile rs11755527, rs2474619 polimorfizmleri tarandı. Hasta ve kontrol grupları arasında BACH2 geni rs11755527 ve rs2474619 polimorfizmlerinin genotip ve allel frekansları açısından istatistiksel olarak anlamlı farklılık yoktu (p>0,05). Hasta grubunda her iki polimorfizmin genotip dağılımları; Marsh skoru ve cinsiyet açısından incelendiğinde istatistiksel farklılık anlamlı değildi (p>0,05). Hasta grubunda her iki polimorfizmin genotip dağılımları HLA haplotip taşıyıcılıklarına göre incelenmiş olup; rs11755527 ve rs2474619 polimorfizmleri ile HLA haplotip taşıyıcılıkları arasında anlamlı bir ilişki saptanmadı (p>0,05). Hasta grubunda HLA haplotip taşıyıcılıkları Marsh skorları açısından incelenmiş olup; yalnızca HLA DQ2.5 haplotip taşıyıcılık oranları ile yüksek Marsh skorları arasında bir korelasyon saptandı. Diğer gruplara kıyasla bu farklılık istatistiksel olarak anlamlıydı (p=0,003). Sonuçlarımıza göre BACH2 geni rs11755527, rs2474619 polimorfizmleri ile ÇH arasında anlamlı bir ilişki tespit edilemedi. Literatür verileri ilgili genin ÇH da ekspresyon düzeylerinin düştüğünü göstermektedir. Hastalık patogenezinde etkili olacağı düşünülen ekspresyon seviyesi düşüklüğünün sebebi henüz açıklanabilmiş değildir. Farklı popülasyonlarda yapılacak geniş kapsamlı genetik varyantlar ve bu varyantlarla birlikte ekspresyon çalışmaları BACH2 geni ile ÇH arasındaki ilişkiyi daha net aydınlatacaktır.
Özet (Çeviri)
Celiac Disease (CD) is an autoimmune disease that occurs due to gluten ingestion in genetically susceptible individuals and mainly affects the small intestine. As a result of gluten-activated immune cells attacking the small intestinal mucosal cells, symptoms such as malabsorption, diarrhea, abdominal bloating, weight loss, and growth retardation in children may occur. It is a multifactorial and multisystemic autoimmune disease in which immunological, genetic and environmental factors play a role in its etiology. BACH2 is a gene known to be effective in maintaining the balance between immunity and tolerance in the body, and it maintains immune regulation through cell-specific regulation of CD4+ T cell subsets. Recently, the association of BACH2 with autoimmune diseases, including CD, has been emphasized. In this study, we aimed to compare celiac patients and controls in terms of BACH2 rs11755527 and rs2474619 gene variants and to evaluate the association of histopathological Marsh groups and HLA haplotypes with the disease and relevant gene variants in the patient group, and in this context, to contribute to the elucidation of the etiopathogenesis of CD and possible new treatment protocols with the results obtained. Our study included 100 patients with celiac disease and 100 healthy controls. Participants' age, gender, family history, Marsh scores, HLA genotypes and BMI information were recorded. DNA was isolated from our patient and control groups and rs11755527, rs2474619 polymorphisms were screened with real-time PCR method. There was no statistically significant difference between the patient and control groups in terms of genotype and allele frequencies of BACH2 gene rs11755527 and rs2474619 polymorphisms (p>0.05). When the genotype distributions of both polymorphisms in the patient group were examined in terms of Marsh score and gender, the statistical difference was not significant (p>0.05). In the patient group, the genotype distributions of both polymorphisms were studied according to HLA haplotype carriers; no significant relationship was found between the rs11755527 and rs2474619 polymorphisms and HLA haplotype carriers (p>0.05). HLA haplotype carriers were examined in terms of Marsh scores in the patient group; a correlation was found only between HLA DQ2.5 haplotype carrier rates and Marsh scores. This difference was statistically significant compared to the other groups (p=0.003). Our results showed no significant relationship between BACH2 gene rs11755527, rs2474619 polymorphisms and CD. Literature data show that the expression levels of the relevant gene are decreased in CD. The reason for the low expression level, which is thought to be effective in the pathogenesis of the disease, has not been explained yet. Extensive genetic studies in different populations will further elucidate the relationship between the BACH2 gene and CD.
Benzer Tezler
- Çölyak hastalığında HLA-DQA1B1(*0501;*02) allel sıklığının ve genotip-fenotip ilişkisinin araştırılması
Investigation of the HLA-DQA1B1(*0501;*02) alleles frequency and the correlation between genotype and fenotype in celiac disease
BEYHAN TÜYSÜZ
Doktora
Türkçe
1999
Gastroenterolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TURGUT ULUTİN
PROF. DR. ASIM CENANİ
- Çölyak hastalığında duodenal mukozal patoloji spektrumunun değerlendirilmesinde intraepitelyal lenfositlerin değeri
The significance of intraepithelial lymphocytes in the evaluation of duodenal mucosal pathology spectrum in coeliac disease
EDA NUR KOZAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU ENSARİ
- Çölyak hastalığında themis ve RUNX3 genlerinin ekspresyonlarının incelenmesi
The investigation of themis and RUNX3 gene expressions in celiac disease
MUSTAFA KURTULUŞ
Doktora
Türkçe
2022
Tıbbi Biyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM PİRİM
- Çölyak hastalığında 'strain ekokardiyografi' yöntemi ile kardiyak fonksiyonların değerlendirilmesi
Evaluation of cardiac functions in celiac disease with the 'strain echocardiography' method
YASEMİN BOZDAĞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık BakanlığıÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
UZMAN ÖZKAN KAYA
- Çölyak hastalığında çift balon enteroskopinin yeri: 1. klinik ve/veya laboratuvar olarak çölyak hastalığı ön tanı/ayırıcı tanısı ile tetkik edilmiş olgularda çift balon enteroskopinin yeri; 2. refrakter çölyak hastalığı olan hastalarda çift balon enteroskopinin değeri
Place of double balloon enteroscopy in celiac disease: 1. the place of double balloon enteroscopy in the cases examined with preliminary diagnosis/differential diagnosis of celiac disease as clinically and/or laboratory; 2. the value of double balloon enteroscopy in patients with refractory celiac disease
MESUT AYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
GastroenterolojiKocaeli Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADETTİN HÜLAGÜ
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖKTUĞ ŞİRİN