Geri Dön

HIV pozitif bireylerde JC polyomavirüs varyantlarının araştırılması

Investigation of the JC polyomavirus variants in hiv-positive individuals

PDF İndir

  1. Tez No: 911953
  2. Yazar: OKAN AYDOĞAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM GÜVEN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Medipol Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 104

Özet

Çalışmamızın amacı, HIV pozitif bireylerden ve sağlıklı bireylerden alınan idrar örneklerinde JCPyV-DNA prevalansının saptanması ve HIV/JCPyV pozitif örneklerde PML ile ilişkili olduğu bildirilen JCPyV'nin VP1-BC loop bölgesindeki aminoasit değişimlerinin varlığını saptamaktır. Dizileme sonucu ayrıca JCPyV genotiplerinin belirlenmesi de amaçlanmıştır. Klinik örnekler 107 HIV-pozitif, 1 HIV-negatif PML hastası ve 77 sağlıklı bireyden alınmıştır. PML tanısı alan 3 hasta idrar, plazma ve BOS örnekleriyle çalışmaya dahil edilmiştir. Örnekler JCPyV için kantitatif PCR ile test edilmiştir. PML hasta örnekleri ayrıca dijital PCR ile test edilmiştir. HIV-pozitif hastaların 46/100'ünde (%46) ve sağlıklı bireylerin 14/77'sinde (%18,18) JCPyV virürisi tespit edildi. HIV pozitif bireylerin 4/107'sinin (%3,73) plazma örneklerinde JCPyV DNA'sı saptandı. HIV pozitifliği ve erkek cinsiyet JCPyV virürisi için risk faktörleri olarak belirlendi (p0.05). JCPyV DNA saptanan 16 idrar örneği ile gerçekleştirilen VP1 dizileme çalışmasında 1 örnekte, 74. pozisyonda K, R değişimi; 1 örnekte 92. pozisyonda E, D değişimi; 2 örnekte 116. pozisyonda T, S değişimi; 5 örnekte 127. pozisyonda T, A değişimi; 9 örnekte 133. pozisyonda G, A değişimi saptandı. Literatürde kritik aminoasitler olarak bildirilen 54. pozisyondaki L ve 59. pozisyondaki K aminoasitlerinde bir değişim saptanmadı. Yapılan filogenetik analizde 1 GI.1-e, 4 GI.2-c, 5 GII-a/b, 1 GIV-a, 1 GIV-b ve 4 GIV-f JCPyV genotipi saptanmıştır. Analiz sonucu literatürde bildirilen JCPyV'nin coğrafi dağılım verileriyle uyumludur.

Özet (Çeviri)

The aim of our study was to determine the prevalence of JCPyV-DNA in urine samples obtained from HIV-positive individuals and healthy individuals and to determine the presence of amino acid changes in the VP1-BC loop region of JCPyV, which has been reported to be associated with PML. The sequencing also aimed to identify JCPyV genotypes. Clinical samples were obtained from 107 HIV-positive, 1 HIV negative, PML patient and 77 healthy individuals. Three patients diagnosed with PML were included in the study with urine, plasma and CSF samples. Samples were tested for JCPyV by quantitative PCR. PML patient samples were also tested by digital PCR. JCPyV viruria was detected in 46/100 (46%) of HIV-positive patients and 14/77 (18.18%) of healthy individuals. JCPyV DNA was detected in plasma samples of 4/108 (3.73%) of HIV-positive individuals. HIV positivity and male gender were determined as risk factors for JCPyV viruria (p0.05). In the VP1 sequencing study performed with 16 JCPyV positive urine samples, K, R substitution at position 74 in 1 sample; E, D substitution at position 92 in 1 sample; T, S substitution at position 116 in 2 samples; T, A substitution at position 127 in 5 samples; G, A substitution at position 133 in 9 samples were detected. No change was detected in the amino acids L at position 54 and K at position 59, which are reported as critical amino acids in the literature. Phylogenetic analysis revealed 1 GI.1-e, 4 GI.2-c, 5 GII-a/b, 1 GIV-a, 1 GIV-b and 4 GIV-f JCPyV genotypes. The results of the analysis are consistent with the geographical distribution data of JCPyV reported in the literature.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    663544

    HIV pozitif bireylerde dikkat eksikliği ve hiperaktivite bozukluğu yaygınlığı

    Prevalance of attenti̇on defi̇ci̇t hyperacti̇vi̇ty di̇sorder i̇n pati̇ents i̇nfected wi̇th HIV

    RABİA ERDOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    PsikiyatriSakarya Üniversitesi

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ SAVAŞ ÇİLLİ

  2. Tez No

    501422

    Nutritional assessment of hiv positive individuals

    Hıv pozitif bireylerde beslenme durumumun saptanması

    BURCU YAVUNÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Beslenme ve DiyetetikYeditepe Üniversitesi

    Beslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İSKENDER KARALTI

  3. Tez No

    622071

    HIV pozitif bireylerde travma sonrası stres bozukluğu ve depresyon belirti düzeylerinin incelenmesi

    Investigation of post-traumatic stress disorder and depression symptom levels in HIV positive individuals

    DELİL YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Psikolojiİstanbul Gelişim Üniversitesi

    Psikoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RECEP EMRE TAN

  4. Tez No

    433258

    HIV enfeksiyonlularda ishalsiz ve ishalli dönem dışkılarında cryptosporidium, ısospora, giardia ve blastocystis parazitlerinin araştırılması

    Investigation of cryptosporidium, isospora, giardia and blastocystis in stool samples in hiv i̇nfected patients at periods with and without diarrhea

    HATİCE YAŞAR ARSU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA SAMASTI

  5. Tez No

    806321

    Art alan hiv pozitif bireylerde inflamatuvar parametrelerin değerlendirilmesi

    Evaluation of inflammatory parameters in HIV positive individuals with background

    İBRAHİM ÇETİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMersin Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF ŞAHİN HORASAN

Geri Dön