Sudak (sander lucioperca ) ve kerevitte (pontastacus leptodactylus) viral nervöz nekrozis virusunun varlığının araştırılması
Investigation of the presence of viral nervous necrosis virus in pike perch (sander lucioperca) and crayfish (pontastacus leptodactylus)
- Tez No: 912192
- Danışmanlar: PROF. DR. SİBEL YAVRU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 130
Özet
Viral Nervöz Nekrozis (VNN) balık yetiştiriciliğinde, büyük ekonomik kayıplara neden olan önemli bir viral enfeksiyondur. Hem denizlerde hem de tatlı sularda yaşayan su canlılarında etkili olan Viral Nervöz Nekrozis virusu (VNNV) ile Türkiye'deki denizlerde birçok çalışma yapılmıştır. Ancak göl, gölet, akarsu gibi ülke iç sularında yaşayan canlılarda VNNV ile ilgili bir çalışma raporu henüz bildirilmemiştir. Bu çalışma; Türkiye'nin iç sularından olan, göçmen kuşların konaklama durakları arasında bulunan Eğirdir, Beyşehir ve Suğla göllerinde yaşayan, sudak (Sander lucioperca) ve kerevit (Pontastacus leptodactylus)'lerden alınan örneklerde, RNA-1 ve RNA-2 segmentine spesifik Real Real Time RT-PCR ile VNNV'nin genom varlığının araştırılması, genom pozitif örneklerden hücre kültürleri SSN-1 (Striped Snakehead) ve E-11 (SSN-1'den klonlanmış)'de virus izolasyonu ve izolatların kısmi sekans yöntemi ile identifikasyonu amacıyla yapıldı. 2022 yılında Eğirdir, Beyşehir ve Suğla göllerinden su sıcaklığının 15-20°C, 20-25°C ve 25-30°C olduğu 3 farklı su sıcaklığı döneminde, her bir dönemi temsilen ayrı ayrı 30 adet kerevit ve 30 adet sudak örneklenerek, 270'şer adet sudak ve kerevit olmak üzere toplamda 540 adet örneğin Real time RT-PCR ile VNNV genom varlığı araştırıldı. Sudak (beyin ve gözleri) ve kerevit (beyin, göz ve hepatopankreaslarından)'lerden örnekler alındı. Bu örnekler, VNNV genom varlığını ortaya koymak amacı ile Real Time RT-PCR ile test edildi. Real Time RT-PCR'da pozitif kontrol olarak, VNNV referans suş (475/198)'u kullanıldı. Real Time RT-PCR ile viral genom varlığı belirlenecek olan örnekler ve referans suş için, SSN-1 ve E-11 devamlı hücre kültürleri hazırlanarak, -80⁰C'da stoklandı. Çalışma sonunda toplanan örneklerin hiçbirinde VNNV genom varlığı tespit edilmedi. Sudak ve kerevit örneklerinden Real Time RT-PCR ile VNNV genom varlığı tespit edilemediği için SSN-1'e virus inokulasyonu yapılmadı. Ancak virusa karşı hassasiyeti yüksek olması nedeniyle E-11'e inokule edilen örnekler 3 kez pasajlandı. 3. pasajın sonunda süpernatatlar sıvılarından Real Time RT-PCR ile viral genom varlığı belirlenemedi. Çalışma ile Türkiye iç sularındaki yaban hayatta yaşayan su canlılarında VNNV varlığı ilk kez araştırıldı ve örneklenen sudaklar ve kerevitlerde VNNV tespit edilmedi. Buna rağmen, göçmen kuşların göç yolları üzerinde yer alan bu göllerin VNNV yönünden düzenli olarak incelenmesinin önemi arz ettiği ifade edilebilir.
Özet (Çeviri)
Viral Nervous Necrosis (VNN) is an important viral infection that causes great economic losses in fish farming. Viral Nervous Necrosis Virus (VNNV), which is effective in both marine and freshwater aquatic organisms, has been studied in the seas in Turkey. However, a study report on VNNV in inland waters such as lakes, ponds and rivers has not been reported yet. This study In the samples taken from the lakers (Sander lucioperca) and crayfish (Pontastacus leptodactylus) living in Eğirdir, Beyşehir and Suğla lakes, which are among the accommodation stops of migratory birds in Turkey's inland waters, Real Real Time RT-PCR specific for RNA-1 and RNA-2 segments was performed to investigate the presence of VNNV genome, virus isolation from genome positive samples in cell cultures SSN-1 (Striped Snakehead) and E-11 (cloned from SSN-1) and identification of isolates by partial sequence method. In 2022, 30 crayfish and 30 lobsters were sampled separately from Eğirdir, Beyşehir and Suğla lakes in 3 different water temperature periods of 15-20°C, 20-25°C and 25-30°C, representing each period, and a total of 540 samples (270 lobsters and crayfish) were investigated for the presence of VNNV genome by Real time RT-PCR. Samples were taken from lingcod (brain and eyes) and crayfish (brain, eyes and hepatopancreas). These samples were tested by Real Time RT-PCR for the presence of VNNV genome. VNNV reference strain (475/198) was used as a positive control in Real Time RT-PCR. SSN-1 and E-11 continuous cell cultures were prepared and stored at -80⁰C for the samples to be tested for viral genome presence by Real Time RT-PCR and the reference strain. At the end of the study, the presence of VNNV genome was not detected in any of the samples collected. Since the presence of VNNV genome could not be detected by Real Time RT-PCR in langoustine and crayfish samples, virus inoculation was not performed in SSN-1. However, the samples inoculated into E-11 were passaged 3 times due to its high sensitivity to the virus. At the end of the 3rd passage, the presence of viral genome could not be determined by Real Time RT-PCR from the supernatants. In this study, the presence of VNNV was investigated for the first time in wild aquatic organisms living in inland waters of Turkey and VNNV was not detected in the sampled lakers and crayfish. Nevertheless, it can be stated that it is important to regularly examine these lakes, which are located on the migration routes of migratory birds, for VNNV.
Benzer Tezler
- Eğirdir Gölü ve göldeki bazı su ürünleri türlerinde ağır metal düzeyleri ve stres parametrelerinin araştırılması
Investigation of heavy metal levels in water, sediment and some fishery species and stress parameters in Egirdir Lake
CAFER BULUT
Doktora
Türkçe
2015
Su ÜrünleriSüleyman Demirel ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEGÜL KUBİLAY
- Ankara ili içsularındaki balıkçılık alanlarının araştırılması
Research for the fishing grounds in inland waters of Ankara province
AYŞEGÜL ÖCAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Su ÜrünleriIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiSu Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAHRETTİN KÜÇÜK
- Beyşehir Gölü sudak (Sander lucioperca L., 1758) populasyonunun besinleri ve beslenme alışkanlıklarının incelenmesi
Investigations on food and feeding habits of pike perch population (Sander lucioperca L., 1758) living in the Lake Beyşehir
AYFER APAYDIN TARHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Su ÜrünleriSüleyman Demirel ÜniversitesiSu Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN ÇETİNKAYA
- Dondurularak depolanmış (-18 oC (-18 santigrat)) sudak (Sander lucioperca bogustkaya ve Naseka, 1996) filetolarında fiziksel, kimyasal ve mikrobiyolojik değişimler
Physical, chemical and microbiological changes of pike-perch fillets (Sander lucioperca bogustkaya and Naseka, 1996) during frozen storage (-18 oC)
İLKAN ALİ OLGUNOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Su ÜrünleriÇukurova ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ABDURRAHMAN POLAT
Y.DOÇ.DR. IŞIL VAR
- Sudak (sander lucioperca Bogustkaya & Naseka, 1996) salamurasının buzdolabı şartlarındaki kalite değişimi
The Quality changes of pike-perch (sander lucioperca Bogustkaya & Naseka, 1996) brine under refrigerator conditions
AHMET GEREK
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Su ÜrünleriÇukurova ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET ÇELİK