Metastatik prostat kanseri gelişiminde enflamasyon ilişkili epitelyal mezenkimal geçiş mekanizmasının araştırılması
Investigation of inflammation related epithelial-mesencymal transition mechanism in metastatic prostate cancer progression
- Tez No: 912703
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BİLGE DEBELEÇ BÜTÜNER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 209
Özet
Bu tez çalışmasında, prostat hücreleri için kritik öneme sahip olan tümör baskılayıcı NKX3.1 proteininin, enflamatuvar mikroçevre koşullarında, prostat kanseri hücre hatlarında, EMT mekanizması üzerindeki moleküler etkisi incelenmiştir. Çalışmalarımızda LNCaP, PC-3 ve DU 145 hücreleri ile in vitro enflamatuvar mikroçevreyi temsil eden hücre kültürü modelleri tasarlanmıştır. Enflamasyon ilişkili NKX3.1 protein kaybı ve enflamatuvar ortamda EMT'nin indüklenmesinin hücre kültüründe temsil edilmesi amacıyla TNF-α, TGF-β1 sitokin uygulamaları yapılmış, ayrıca hücrelere NKX3.1 ekspresyonu kazandırılarak EMT proteinlerinin seviyeleri ve hücre lokalizasyonlarının NKX3.1'e bağlı olarak farklılık gösterip göstermediği, hücrelerin anoikis direncine olan etkisi, migrasyona olan etkisi ve epitelyal-stromal etkileşimler üzerindeki etkileri araştırılmıştır. LNCaP hücrelerinde NKX3.1 ekspresyonuna ve enflamasyona bağlı olarak hem transkripsiyon seviyesinde hem protein seviyesinde değişiklik gösteren EMT ilişkili genler, DU 145 hücrelerinde NKX3.1 ekspresyonuna ve enflamasyona bağlı değişen genler global transkriptom analizleri ile incelenmiştir. NKX3.1, normal prostatın sağkalımında gerekli olan ve embriyonezisinde kök hücre fonksiyonu gösteren, gelişimsel açıdan kritik öneme sahip bir gendir. EMT fenotipi ile kanser kök hücresi fenotipi özdeş özelliklere sahiptir. Ektopik NKX3.1 seviyesi kazandırılan prostat kanseri hücrelerinde, NKX3.1 ile EMT ilişkili proteinlerin seviyesindeki artış korelasyon göstermektedir. NKX3.1'in normal koşullarda ve düşük dozdaki enflamatuvar koşullarda tümör baskılayıcı rolü ile hücre canlılığı, anoikis direnci ve migrasyonu baskıladığı, daha yüksek dozdaki, uzun süreli enflamatuvar koşullarda mezenkim benzeri hücre morfolojisini desteklediği ve EMT proteinlerinin seviyesel artışında bir rolü olduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, the molecular effect of the tumor suppressor NKX3.1 protein, which is critical for prostate cells, on the EMT mechanism in prostate cancer cell lines under inflammatory microenvironmental conditions was examined. In our studies, cell culture models representing the in vitro inflammatory microenvironment were designed with LNCaP, PC-3 and DU 145 cells. In order to represent inflammation-related NKX3.1 protein loss and the induction of EMT in the inflammatory environment in cell culture, TNF-α/TGF-β1 cytokine induction were performed, and NKX3.1 expression was introduced into the cells to determine whether the levels of EMT proteins and cell localizations differ depending on NKX3.1. Its effect on the anoikis resistance of cells, migration and epithelial-stromal interactions were investigated. EMT-related genes that changed at both transcription and protein levels due to NKX3.1 expression and inflammation in LNCaP cells, and genes that changed due to NKX3.1 expression and inflammation in DU 145 cells were examined by global transcriptome analysis. NKX3.1 is a developmentally critical gene that is required for normal prostate survival and functions in stem cell embryogenesis. The EMT phenotype and the cancer stem cell phenotype have identical characteristics. In prostate cancer cells having ectopic NKX3.1, there is a correlation between increased NKX3.1 and increased EMT-related proteins. In conclusion, NKX3.1 suppresses cell viability, anoikis resistance and migration due to its tumor suppressor role in normal conditions and low-dose inflammatory conditions however, supports mesenchyme-like cell morphology in higher-dose, long-term inflammatory conditions and has a role of increasing level of EMT proteins.
Benzer Tezler
- Protein profiling of inflammation-mediated migration in prostate cancer
Prostat kanseri gelişiminde inflamasyon aracılıklı migrasyonun protein profilinin tanımlanması
IRODA SAYDULLAEVA
Doktora
Türkçe
2020
Bilim ve TeknolojiEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ
- Insan prostat kanser hücre kültüründe matriks metalloproteinaz enzim ekspresyonunun düzenlenmesinde NF-KB sinyalizasyonunun rolünün incelenmesi
Investigation of the role of NF-KB signaling in the regulation of matrix metalloproteinase enzyme expression in human prostate cancer cell culture
DENİZ ÖĞÜT
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BUKET REEL
- Metastatik prostat kanser tedavisinde prognostik genetik belirteçler
Prognostic genetic markers in metastatic prostate cancer treatment
YAKUP ALTUNDAŞ
- Prostat kanseri hücrelerinde bor bileşiklerinin serin proteazlara etkisinin incelenmesi
Investigating the effect of boron compounds on serin proteases in prostate cancer cells
AMINA MUJALA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiBursa Uludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURCU ERBAYKENT
- CDK inhibitörlerinin mTOR susturması gerçekleştirilen LNCaP, DU145 ve PC3 prostat kanseri hücrelerinde terapotik etkisinin incelenmesi
Investigation of therapeutic effects of the CDK inhibitors on mTOR-silenced LNCaP, DU145 and PC3 prostate cancer cells
ÇAĞRI GÜMÜŞKAPTAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Biyokimyaİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF DAMLA ARISAN