Geri Dön

Endofitik Methylobacterium spp. (PPFMs) türlerinin moleküler tanılaması ve mikrobiyal bitki büyütme ajanı olarak kullanılabilirliği

Molecular identification of endophytic Methylobacterium spp. (PPFMs) and their potential use as microbial plant growth-promoting agents

PDF İndir

  1. Tez No: 925466
  2. Yazar: FATMA AZGIN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SADIK DİNÇER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 99

Özet

Bu çalışmada, farklı tek yıllık bitkilerden izole edilen 40 Methylobacterium spp. (PPFM) suşunun bitki büyümesini teşvik edici özellikleri (PGPB), fosfat çözme, IAA üretimi, siderofor üretimi, ACC deaminaz aktiviteleri ve azot fiksasyonu açısından değerlendirilmiş ve TOPSIS analizi ile en yetenekli dört suş (M12, M15, M26, M34) seçilmiştir. M26 suşu, en yüksek fosfat çözme aktivitesini (253.23 µg/mL) gösterirken, M12 suşu en yüksek IAA üretimini (110.85 µg/mL) sergilemiştir. Tüm suşlar, metanolün ortamda azalmasıyla IAA üretimlerini artırmış ve bu durum, metanolün yalnızca bir karbon kaynağı değil, aynı zamanda bir sinyal molekülü olarak işlev gördüğünü ortaya koymuştur. M34 suşu, en yüksek ACC deaminaz aktivitesini (82.50 µmol α-ketobutirat/saat/mg protein) göstermiştir. Ayrıca, tüm suşlarda benzer seviyelerde azot fiksasyonu aktivitesi (14 µg/mL) gözlemlenmiştir. Çalışmamızda, 16S rRNA gen bölgesinin tür teşhisinde yetersiz olduğu, tür teşhisinde daha fazla çözünürlük sağlayabileceği düşünülen mxaF geninin filogenetik çözümlemede beklenen ayırt ediciliği sağlayamadığı ortaya konulmuştur. Tüm suşların tür teşhisinin tam yapılabilmesi için tam genom dizileme, kemotaksonomik analizler ve belirteç genlerle (örneğin gyrB, rpoD) multilokus dizi analizleri (MLSA) gibi ileri yöntemlerin uygulanması gerekmektedir. Saksı denemelerinde, M15 suşu bitki büyüme parametrelerinde (taze ağırlık, kuru ağırlık ve boy uzunluğu) en olumlu sonuçları vermiştir. Ayrıca, M15 ve M26 suşlarının rizosferik toprak mikrobiyotasının zenginliğini değiştirmezken, taksonomik kompozisyonunda göreceli bollukları değiştirdiği gösterilmiştir. Bu sonuçlar, Methylobacterium sp. suşlarının sürdürülebilir tarım uygulamalarında mikrobiyal bitki büyüme ajanı olarak kullanılma potansiyelini desteklemektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, the plant growth-promoting properties (PGPB) of 40 Methylobacterium spp. (PPFM) strains isolated from different annual plants were evaluated in terms of phosphate solubilization, IAA production, siderophore production, ACC deaminase activities, and nitrogen fixation. Using TOPSIS analysis, the four most promising strains (M12, M15, M26, M34) were selected. The M26 strain exhibited the highest phosphate solubilization activity (253.23 µg/mL), while the M12 strain showed the highest IAA production (110.85 µg/mL). All strains increased their IAA production as methanol levels in the medium decreased, indicating that methanol functions not only as a carbon source but also as a signaling molecule. The M34 strain demonstrated the highest ACC deaminase activity (82.50 µmol α-ketobutyrate/hour/mg protein). Additionally, all strains exhibited similar levels of nitrogen fixation activity (14 µg/mL). In our study, it was revealed that the 16S rRNA gene region was insufficient for species identification, and the mxaF gene, which was considered to provide higher resolution for species identification, also failed to deliver the expected phylogenetic distinction. For the accurate identification of all strains, advanced methods such as whole-genome sequencing, chemotaxonomic analyses, and multilocus sequence analyses (MLSA) using marker genes (e.g., gyrB, rpoD) need to be applied. In pot experiments, the M15 strain showed the most positive results in plant growth parameters (fresh weight, dry weight, and plant height). Furthermore, it was demonstrated that while the M15 and M26 strains did not alter the richness of the rhizospheric soil microbiota, they changed the relative abundance in the taxonomic composition. These findings support the potential use of Methylobacterium spp. as microbial plant growth-promoting agents in sustainable agricultural practices.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    630991

    Utilization of endophytic fungi and their enzymes for transformation to obtain bioactive compounds

    Endofitik fungusların ve enzimlerinin biyoaktif bileşiklerin eldesi için transformasyonda kullanılması

    MELİS KÜÇÜKSOLAK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

    DOÇ. DR. DUYGU SAĞ

  2. Tez No

    895142

    Anadolu sığla ağacı (Liquidambar orientalis Mill.) yapraklarının endofitik mikobiyotasının belirlenmesi

    Determination of endophytic mycobiota in leaves of Anatolian sweetgum tree (Liquidambar orientalis Mill.)

    SULTAN AKYOL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ REFİKA CEYDA BERAM

  3. Tez No

    859050

    Endofitik funguslar ile biyoaktif doğal bileşiklerin üretimi

    Production of bioactive natural substances by using endophytic fungi

    CEREN ELMACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyokimyaEskişehir Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖKALP İŞCAN

  4. Tez No

    945830

    Endofitik bakteri uygulamasının Xanthomonas euvesicatoria'nın biberde neden olduğu hastalığa ve bitki fizyolojisine etkisi

    Effect of endophytic bacteria application on disease caused by Xanthomonas euvesicatoria and plant physiology in pepper

    MİHRİBAN TAŞKIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    ZiraatVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET AKKÖPRÜ

    DOÇ. DR. ŞEYDA ÇAVUŞOĞLU

  5. Tez No

    606186

    Buğday (Triticum aestivum L.)'dan izole edilen endofitik fungusların, buğdayın gelişimine etkisi ile kök boğazı çürüklük etmeni Fusarium culmorum (W.G. Sm.) Sacc'a karşı biyolojik mücadele potansiyeli üzerinde araştırmalar

    Endophytic fungi isolated from wheat (Triticum aestivum L.) effect of wheat plant growth and evaluation of biological control potential against crown rot pathogen Fusarium culmorum (W.G. Sm.) Sacc.

    BÜŞRA MÜGE MALDAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERNA TUNALI

Geri Dön