The relationship between brain microstructure and the diffusion tensor mrı parameters for von economo-koskinas parcellation
Von economo-koskinas parselasyonu için beyin mikroyapisi ve difüzyon tensör mrg parametreleri arasindaki ilişki
- Tez No: 926362
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ANDAÇ HAMAMCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mühendislik Bilimleri, Engineering Sciences
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 91
Özet
Von Economo-Koskinas atlası, beynin kortikal bölgelerinin hücresel yapıları temelinde detaylı bir haritalandırması ve sınıflandırılmasıdır. Farklı kortikal bölgelerin hücresel bileşimi, hücre yoğunluğu ve hücre türleri hakkında ayrıntılı bilgiler sunar ve beynin anatomik parselasyonunda önemli bir referans kaynağıdır. Ayrıca, beyin parselasyonu klinik ortamlarda nörolojik hastalıkların teşhis ve tedavisinde de uygulanmaktadır. Bu tez, Von Economo-Koskinas atlasını kullanarak beyin mikroyapısı ile kortikal organizasyon arasındaki ilişkiyi araştırmak amacıyla HCP Young Adult 1200 Projesi'nden elde edilen verileri kullanmaktadır. 950'den fazla katılımcının beyin görüntüleri, Difüzyon Tensor Görüntüleme (DTI) yöntemiyle Ortalama Difüzyon (MD) ve Fraksiyonel Anizotropi (FA) değerleri için analiz edilmiştir. Veri işleme ve görselleştirme için FreeSurfer yazılımı, Python ve 3D Slicer kullanılmıştır. MD ve FA değerlerinin Von Economo-Koskinas atlası tarafından tanımlanan farklı beyin bölgeleri arasındaki normal dağılımını ve anlamlı farklılıklarını değerlendirmek için Kruskal-Wallis testi, Shapiro-Wilk testi ve Mann- Whitney U testi gibi istatistiksel analizler gerçekleştirilmiştir. Ayrıca, MD ve FA değerleri ile hücre yoğunluğu, hücre boyutu ve genel kalınlık gibi mikro yapısal parametreler arasındaki ilişkiyi değerlendirmek için regresyon analizi yapılmıştır. Sonuçlar, Von Economo-Koskinas Atlası'nın beyin bölgelerinde MD ve FA değerlerinde anlamlı farklılıklar olduğunu göstermiştir. Bu araştırma, Von Economo-Koskinas atlasının beyin mikro yapı çalışmalarındaki önemini vurgulamakta ve beyin bağlantısallığı, gelişimi ve nörolojik hastalıklar için potansiyel etkileri hakkında değerli bilgiler sunmaktadır. Ayrıca, sol ve sağ hemisferler arasındaki bölgeler arasındaki ilişkiyi anlamak için iki hemisfer de incelenmiştir. Hücre boyutu, toplam kalınlık ve beyin görüntüleme metrikleri arasındaki etkileşimler hakkında daha derin bilgiler sağlamak için makine öğrenmesi algoritmaları ve çok değişkenli regresyon gibi ileri düzey modelleme teknikleri kullanılabilir.
Özet (Çeviri)
The Von Economo-Koskinas atlas is a detailed mapping and classification of the brain's cortical regions based on their cellular structures. It provides detailed information on the cellular composition, cell density, and cell types of different cortical regions, making it a crucial reference for the anatomical parcellation of the brain. Additionally, brain parcellation is applied in clinical settings for diagnosing and managing neurological disorders. This thesis leverages data from the HCP Young Adult 1200 Project to explore the connection among brain microstructure and cortical structure through the Von Economo-Koskinas atlas. Brain images of more than 950 participants were analyzed for Mean Diffusivity (MD), and Fractional Anisotropy (FA) using Diffusion Tensor Imaging (DTI). FreeSurfer software and Python and 3D Slicer were used for data processing and visualizing. Statistical analyses, including the Kruskal-Wallis test, Shapiro-Wilk test, and Mann-Whitney U test were conducted to assess the normal distribution and significant differences in MD and FA values across various brain regions outlined by the Von Economo-Koskinas atlas. Additionally, Regression analysis was conducted to evaluate relationship between FA, MD values, also microstructural parameters such as cell density, cell size, and overall thickness. The results indicated significant differences in MD and FA values across the brain region of Von Economo-Koskinas Atlas. This research highlights the utility of the Von Economo-Koskinas atlas in brain microstructure studies and provides valuable insights into brain connectivity, development, and potential implications for neurological disorders. And also, left and right hemispheres investigating to understand relationship between the regions of the hemispheres. Advanced modeling techniques, such as machine learning algorithms and multi-variable regression, could provide deeper information into the interactions between cell size, total thickness, and brain imaging metrics.
Benzer Tezler
- Periventriküler lökomalazili olgularda nörolojik ve oftalmolojik bulgular ile difüzyon tensör manyetik rezonans bulgularının karşılaştırılması
The comparison of the neurological, ophthalmological findings and diffusion tensor magnetic resonance findings of the patients with periventricular leukomalacia
YILDIZ EKEMEN KELEŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Göz HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı Bölümü
PROF. DR. SARENUR GÖKBEN
- Kronik kulak çınlamalarının (tinnitus) beyin bağlantıları üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of chronic tinnitus on brain connections
FATMA PINAR ELPEN KARYEMEZ
Doktora
Türkçe
2023
Biyofizikİstanbul Gedik Üniversitesiİş Sağlığı ve Güvenliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA YAĞIMLI
PROF. DR. HAKAN TOZAN
- MS hastalarında beyin derin gri cevher yapılarındaki mikroyapısal değişiklikler ile klinik dizabilite ilişkisinin difüzyon tensör MR görüntüleme yöntemi ile değerlendirilmesi
Evaluation of the relationship between microstructural changes in the deep gray matter structures of the brain and clinical disability in MS patients with diffusion tensor mr imaging method
AHMET ARSLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Radyoloji ve Nükleer Tıpİnönü ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET FATİH ERBAY
- Effects of recreational cannabis use and subclinical psychosis risk on brain white matter integrity and structural connectivity in adolescence
Ergenlik döneminde eğlence amaçlı esrar kullanımının ve subklinik psikoz riskinin, beynin beyaz madde bütünlüğüne ve yapısal bağlantısına etkisi
HANDE EZGİ ATMACA
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Nörolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TIMOTHEA TOULOPOULOU
- Tedaviye dirençli depresyon hastalarında çift konili bobin kullanılarak dorsomedial prefrontal kortekse uygulanan transkraniyal manyetik uyarım tedavisi ve buna ilişkin mikroyapısal beyin değişikliklerinin incelenmesi
Investigation of transcranial magnetic stimulation treatment applied to the dorsomedial prefrontal cortex using a double-cone coil and associated microstructural brain changes in treatment-resistant depression patients
ELİF BURCU ERSUNGUR ÇELİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Psikiyatriİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURÇ ÇAĞRI POYRAZ