Comparative analysis of the molecular, spatial, and functional domains of vertebrate habenula
Omurgalı habenulasının farklı moleküler, uzamsal ve fonksiyonel bölgelerinin belirlenmesi ve türler arası karşılaştırılması
- Tez No: 926933
- Danışmanlar: PROF. DR. EMRE YAKSI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Nöroloji, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Nörobilim Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Nörobilim Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Habenula (Hb), adaptif davranışlar ve nöropsikiyatrik bozukluklarla ilişkili olan diensefalik bir beyin bölgesidir. İki ana Hb alt bölümü, lateral habenula ve medial habenula, klasik ve edimsel öğrenmeden sonuçların öngörülmesi, korku, bağımlılık ve sosyal etkileşimlere kadar çeşitli davranışlarda farklı roller oynamaktadır. Bununla birlikte, omurgalı habenulasının hücre yapısı ve topografyası ile farklı habenula mikro devrelerinin türler arasında nasıl organize edildiği konusundaki anlayışımız sınırlıdır. Bu çalışmada, habenulanın alt bölümlerinin nasıl organize edildiğini ve bu organizasyonun habenula fonksiyonu ile ilgili olarak türler arasında nasıl karşılaştırıldığını araştırmak için tek hücre RNA dizileme (scRNA-seq) ve mekansal transkriptomik yaklaşımlarını birleştirerek farklı omurgalı türlerde araştırma yaptık. İlk olarak, habenular hücre tiplerinin balıklardan farelere kadar türler arasında , bazı istisnalar dışında, nispeten korunduğunu gösterdik. Ardından, hücre altı çözünürlükte mekansal transkriptomikleri kullanarak, yetişkin zebra balığı ve fare habenulası içinde çok sayıda topografik olarak organize edilmiş alt bölgeyi tanımladık. Bu alt bölgelerin birçoğunun her iki tür arasında paylaşıldığını bulduk. Ayrıca, zebra balığı habenulasının yarıküreler arasında oldukça asimetrik olduğu bilinirken, bazı habenular alt bölgelerin fare habenulası gibi simetrik kaldığını gözlemledik. Benzer şekilde, fare habenulası geleneksel olarak yarıküreler arasında oldukça simetrik kabul edilse de, birkaç fare habenula alt bölgesinde belirgin asimetriler gözlemledik. Bu sonuçlar, omurgalı habenulasının asimetrisinin türler arasında bir devamlılık içinde olduğunu göstermektedir. Ayrıca, omurgalılar, topografik olarak organize edilmiş birçok hücre yapısı benzerliği paylaşmaktadır. Devam eden araştırmamız, zebrafish Hb'sinin moleküler topografyasının fonksiyonel mimarisiyle nasıl ilişkili olduğunu aydınlatmayı amaçlamaktadır.
Özet (Çeviri)
The habenula (Hb) is a diencephalic brain region implicated in adaptive behaviors and neuropsychiatric disorders. Two main Hb subdivisions, the lateral habenula and medial habenula, have been shown to play different roles in diverse behaviors, ranging from classical and operant learning to the prediction of outcomes, fear, addiction, and social interactions. However, our understanding of cytoarchitecture and topography of the vertebrate Hb, as well as how different Hb microcircuits are organized across species, remains limited. In this study, we utilized a combination of single-cell and spatial transcriptomic approaches across multiple species to investigate how habenular subdivisions are organized and how this organization compares across species in relation to Hb function. First, we demonstrated that habenular cell types are relatively conserved across species from fish to mice, with some exceptions. Subsequently, employing spatial transcriptomics at subcellular resolution, we identified numerous topographically organized subregions within the adult zebrafish and mouse Hb. Many of these subregions were found to be shared between both species. We also observed that while zebrafish Hb is known to be highly asymmetric across hemispheres, several habenular subdomains remain symmetric, resembling those of mouse Hb. Similarly, though the mouse habenula is traditionally considered highly symmetrical across hemispheres, we observed a few mouse Hb subregions with prominent asymmetries. These results suggest that the asymmetry of the vertebrate habenula exists on a continuum across species. Moreover, vertebrates share many cytoarchitectural similarities that are topographically organized. Our ongoing investigation aims to elucidate how the molecular topography of the zebrafish Hb relates to its functional architecture.
Benzer Tezler
- Melanogenez inhibitörü olarak N-benzil benzamitlerin MCET/CoMCET metoduyla 4D-QSAR incelenmesi
4D-QSAR investigation of n-benzyl benzamides as a melanogenesis inhibitor by MCET/CoMCET method
TUĞBA ALP TOKAT
- Hücresel otomat yöntemi ile kentsel yayılmanın mekansal-zamansal modellenmesi
Spatio-temporal modelling of urban sprawl with cellular automata method
GÜLSÜM ELOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Jeodezi ve FotogrametriNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiHarita Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI BOZDAĞ
- Çevre davranış alanı içinde konut ve çevre değiştirmenin insana etkisinin mimari açıdan incelenmesi
Investigation from the architectural point of view the influence of residential shift-relocation on human being
CEMİLE TİFTİK
- Comparative analysis of the molecular mechanisms of melanocyte regeneration and melanoma using the zebrafish model and manipulation of gene expression profiles in melanoma cells using the CRISPR/Cas9 to induce a regeneration-like progress
Melanosit rejenerasyonunun ve melanomun moleküler mekanizmalarının zebrabalığı modelinde karşılaştırmalı analızı ve melanom hücrelerinde gen ifadesi profillerının CRISPR/Cas9 yöntemi ile düzenlenerek rejenerasyon benzeri bir ilerleyişin indüklenmesi
ESRA KATKAT
Doktora
İngilizce
2024
Bilim ve TeknolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
PROF. DR. ŞERİF ŞENTÜRK
- Comparative analysis of the molecular mechanisms of brain regeneration and glioma using zebrafish model to develop therapeutic approaches for gliomas
Beyin rejenerasyonu ve glioma moleküler mekanizmalarının zebrabalığı modeli kullanılarak gliomalarda terapötik yaklaşımlar geliştirilmesi için karşılaştırmalı olarak analizi
YELİZ DEMİRCİ
Doktora
İngilizce
2021
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN