Geri Dön

Kan kültürlerinden hastane kaynaklı izole edilenCandida auris'in farklı yöntemlerle tanımlanması veantifungal duyarlılıklarının değerlendirilmesi

Identification of Candida auris isolated from blood cultures from hospital origin with different methods and evaluatoon of their antifungal susceptibility

PDF İndir

  1. Tez No: 930388
  2. Yazar: FATİH GÜNGÖR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 121

Özet

Candida auris, küresel olarak çoklu ilaca dirençli, sağlık bakımıyla ilişkili bir mantar patojeni olarak ortaya çıkmıştır. C.auris tüm dünyada hastalardan giderek daha fazla izole edilmektedir. Son raporlar, mikroorganizmanın yanlış tanımlanması, yüksek oranlarda antifungal ilaç direnci ve önemli hasta ölümlerine neden olması tanı ve tedavisinde zorluklara neden olduğunu göstermiştir. Deri kolonizasyonu ve çevresel ortamlarda uzun süre canlı kalmasını kolaylaştıran virülans faktörleri ile sağlık kuruluşları içinde ve arasında hızla bulaşmaya neden olan yeni tanımlanmış bir kandida türüdür. Bu çalışma da, yoğun bakım hastalarından alınan kan örneklerininden yapılan kan kültürlerinde farklı yöntemler kullanılarak elde edilen ve biyokimyasal testlerle C.auris olarak tanımlanan suşların kromojenik agar besiyeri ve moleküler yöntem kullanılarak yeniden test edilmesi, sonuçların karşılaştırılması ve mikrodilüsyon antifungal duyarlılık profillerinin değerlendirilmesi amaçlandı. Geleneksel yöntemler ile kandida türü olarak saptanan suşlar BioMérieux Vitek2 compact (BioMérieux, Fransa) ve MALDI-TOFF MS BioMérieux Vitek MS v.3.2 cihazı ile (BioMérieux, Fransa) identifikasyonları yapıldı. Bu sistemler ile C.auris olarak tanımlanan 30 suş çalışmaya dahil edildi. 30 C.auris suşu 26 hastanın kan kültüründen izole edildi. Dört hasta farklı kliniklerde farklı zamanlarda yatışta kaldığı sürede C.auris türü izole edildiği için çalışmaya dahil edildi. 26 hastanın 14 (%53.85)'ü erkek hasta, 12 (%46.15)'si ise kadın hasta idi. 60 ve üstü yaş (%69.23) en yüksek grubu oluşturdu. İzole edilen suşlar en fazla İç Hastalıklar Yoğun Bakım 2 kliniğinde (%36.67) ve Temmuz-Eylül (%43.33) ayları arasında saptandı. C.auris olarak tanımlanan suşların identifikasyonunda CHROMagar Candida Plus'ın ve Real Time PCR yöntemlerinin değerini araştırmak amacıyla tekrar test edildi. Sabouraud Dekstroz Agar (SDA) ve CHROMagar Candida Plus besiyerleri ve mısır unu-Tween 80 agarda koloni rengi ve morfolojisi değerlendirilerek karşılaştırıldı. Ticari sistemler ile C. auris olarak tanımlanan 30 suşun hem CHROMagar Candida Plus hemde Real Time PCR yöntemiyle 26 14 (%88.24)'sı C.auris, 3 (%8.82)'ü C.parapsilosis,1 (%2.94)'i C.tropicalis olarak tanımlandı. Kolorimetrik mikrodilüsyon yöntemi (Thermo Scientific™ Sensititre™ YeastOne™ YO9 AST Plate) (SYO; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, ABD) ile yapılan antifungal duyarlılık test sonucunda en yüksek direnç amfoterisin B (%100.00)'de saptandı. Sonuç olarak yapılan çalışmada CHROMagar Candida Plus'ın C.auris dahil olmak üzere kandida izolatlarının görsel olarak tanımlanmasına yardımcı olmak için yararlı bir kültür yöntemi olabileceği, ancak karışık floralı örneklerde benzer maya kolonilerinin varlığında ve özellikle yakın akrabalık özellikler nedeniyle C.auris'in yanlış tanımlanamasına neden olan maya grubu türlerin çıkması durumunda MALDİ-TOFF MS veya Real time PCR gibi genom düzeyinde araştırma gerekmektedir. C.auris olarak tanımlanan suşların mutlaka antifungal duyarlılık profillerinin CDC'nin önerileri doğrultusunda ve EUCAST veya CLSI kriterleri kullanılarak belirlenmesi direncin ortaya konulması açısından çok önemlidir.

Özet (Çeviri)

Candida auris has emerged as a globally multidrug-resistant, healthcare- associated fungal pathogen. C.auris is increasingly isolated from patients worldwide. Recent reports have shown that misidentification of the microorganism, high rates of antifungal drug resistance, and significant patient mortality have led to difficulties in diagnosis and treatment. It is a newly identified Candida species that rapidly spreads within and between healthcare institutions due to its virulence factors that facilitate skin colonization and long- term survival in environmental environments. In this study, it was aimed to retest the strains obtained from blood cultures of intensive care patients using different methods and identified as C.auris by biochemical tests using chromogenic agar medium and molecular methods, to compare the results, and to evaluate the microdilution antifungal susceptibility profiles. Strains identified as Candida species by conventional methods were identified using BioMérieux Vitek2 compact (BioMérieux, France) and MALDI-TOFF MS BioMérieux Vitek MS v.3.2 device (BioMérieux, France). 30 C.auris strains identified as C.auris with these systems were included in the study. 30 C.auris strains were isolated from blood cultures of 26 patients. Four patients were included in the study because C.auris was isolated during their hospitalization at different times in different clinics. Of the 26 patients, 14 (53.85%) were male and 12 (46.15) were female. The highest age group was 60 and above (69.23%). The isolated strains were detected mostly in Internal Medicine Intensive Care Unit 2 clinic (36.67%) and 16 between July and September (43.33%). The value of CHROMagar Candida Plus and Real Time PCR methods in the identification of strains identified as C.auris was tested again. Colony color and morphology were evaluated and compared on Sabouraud Dextrose Aagar (SDA) and CHROMagar Candida Plus media and corn flour-Tween 80 agar. Of the 30 strains identified as C.auris by commercial systems, 26 were identified as (88.24%) C.auris by both CHROMagar Candida Plus and Real Time PCR method, 3 as (8.82%) C.parapsilosis, and 1 as (2.94%) C.tropicalis. In the antifungal susceptibility test result performed with the colorimetric microdilution method (Thermo Scientific™ Sensititre™ YeastOne™ YO9 AST Plate) (SYO; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA), the highest resistance was detected in amphotericin B (100.00%). In conclusion, in our study, CHROMagar Candida Plus may be a useful culture method to aid in the visual identification of Candida isolates including C.auris, however, in the presence of similar yeast colonies in mixed flora samples and especially in the case of yeast group species that cause misidentification of C.auris due to closely related characteristics, MALDI-TOFF MS or Real Time PCR should be retested and identified. It is very important to determine the antifungal susceptibility profiles of the strains identified as C.auris according to CDC recommendations and using EUCAST or CLSI criteria in order to reveal resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    941911

    Hastanemizde kandidemisi olan hastalardan izole edilen Candida auris kökenlerine ait antifungal duyarlılık profilinin belirlenmesi

    Determination of antifungal susceptibility profile of Candida auris isolates obtained from patients with candidemia at Marmara University Hospital

    SENA DEMİRCAN KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ELVAN SAYIN

  2. Tez No

    454077

    Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde izlenen yetişkin hastalarda kandidemi olgularının epidemiyolojisi, risk faktörleri, antifungal duyarlılıkları ve mortalite açısından farklılıklarının saptanması

    Evaluation of epidemiology, risk factors, antifungal susceptibilities and mortality of candidaemia in adult patients admitted to Akdeniz University Medical School Hospital

    ÇİĞDEM ÇİÇEK KOLAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ GÜNSEREN

  3. Tez No

    118423

    Kan kültürlerinden izole edilen stafilokok kökenlerinin slime üretimi ve bunun antibiyotik direnci ile ilişkisi

    Slime production of staphylococci spp isolated from blood cultures and its relationship with antibiotic susseptibility

    UĞUR ERSOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FUNDA BABACAN

  4. Tez No

    496765

    Kan kültürlerinden izole edilen karbapenem dirençli enterobacterıaceae suşlarında karbapenem direnç genleri ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    HARUN REŞİD SU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZGE TURHAN

  5. Tez No

    934574

    Kan kültürlerinden izole edilen Klebsiella pneumoniae izolatlarında otomatize sistem ile belirlenen karbapenem duyarlılık profilinin referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon ile doğrulanması ve karbapenemaz genlerinin multipleks qPZR ile saptanması

    Başlık çevirisi yok

    ALPER DOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLAY ÇÖPLÜ

Geri Dön