Geri Dön

Genotyping for Self-Incompatibility Alleles In European Pear (Pyrus communis L.)

Avrupa Armudunda Kendine Kısırlık Alellerinin Genotiplendirilmesi (Pyrus Communis L.)

PDF İndir

  1. Tez No: 932400
  2. Yazar: FATIH GOKHAN ERBAS
  3. Danışmanlar: Belirtilmemiş.
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: The University of Nottingham
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 30

Özet

Avrupa grubu armutlar, ılıman iklim bölgeleri için büyük öneme haizdirler. Angiospermler aktif pistil ve anterlere sahip hermafrodit çiçekler üretirler fakat kendi çiçek tozlarıyla tozlaşmayı önleyen kendine kısırlık mekanizmalarına sahiptirler. Avrupa grubu armutlarda kendine kısırlık S-lokus tarafından kontrol edilen S-RNase mekanizması ile sağlanmaktadır. Avrupa armutlarında S-RNase; 5 intron ve 1 aşırı değişkenlik gösteren RHV bölgesi (C1, C2, C3, RHV, RC4 ve C5) ile kontrol edilmektedir. Kendine kısırlık özelliği, başarılı bir ıslah programı için en önemli unsurların başında gelmektedir. Bu nedenle S-genotipinin doğru olarak belirlenmesi ve çapraz uyuşur çeşitlerin kullanılması ıslah programının başarısını artırmaktadır. Goldway ve arkadaşları, çok fazla Avrupa armut çeşidinin yanlış olarak S-genotip grubunda gruplandırıldığını belirtmiş, bu nedenle 133 Avrupa armudunda moleküler S-genotip analizini yapılmış ve S-aleller tekrar numaralandırılmıştır (2009). Bu çalışmada 16 Avrupa armudu çeşidinin moleküler S-genotiplemesi (MPyC1F C1- MPyC5R-C5) ve (MPyC1F-C1 PyEIIWPN) 2 farklı primer çiftinin PCR reaksiyonunda kullanılması ile belirlenmiştir. Elde edilen PCR ürünleri agoroz jel elektroforez ile PCR reaksiyonunun etkinliği ve farklı primer çiftlerinden elde edilen S-bantlarının yaklaşık boyutları tespit edilmiştir. Ayrıca MPyC1F-C1-PyEIIWPN primer çiftinden elde edilen PCR ürünleri Fragment Length Analysis (FLA) analizine tabi tutulmuşlardır. Bu sayede 1bp hassasiyetinde S-alellerin uzunlukları tespit edilmiş ve S-genotipleri belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

The European pear is one of the most important agricultural products in temperate regions. Angiosperms produce hermaphroditic flowers which have active pistils and anthers, but a great deal of them do not show pollination with their own pollen because of their self-incompatibility (SI) characteristic. This characteristic encourages outbreeding, genetic diversity and viable seed production. Self-pollination is prevented by several types of SI mechanism. European pears intercept self-pollination with S-RNase mediated self-incompatibility which is controlled by a single polymorphic S-locus. Because of this, European pears need to pollinator for stabile fruit sets, excellent syncarpy, fruit quality and fruit size. In European pears, the S-RNase gene consists of 5 conserved regions, namely C1, C2, C3, RC4 and C5, and one hypervariable region. Additionally, self-incompatibility plays a substantial role in breeding programmes. For successful breeding programmes, self-incompatibility characteristics must be taken into account. Therefore, correct S-genotyping has become more and more important. Goldway et al. mentioned that numerous European pear cultivars have been located incorrectly in more than one S-allele group in different studies. For this reason, they renumbered S-alleles and classified 133 European pear cultivars with new S-allele numbers (2009). In this study, two different primer pairs were used in the PCR reaction for the S-genotyping of 16 European pear cultivars. Fluorescently HEX labelled MPyC1F C1 forward primer was used with MPyC5R-C5 and PyEIIWPN reverse primers. The PCR products obtained were run on agarose gel and fragment sizes were compared. The (MPyC1F C1 and PyEIIWPN) primer pair yields a smaller fragment size than those of the (MPyC1F C1 and MPyC5R-C5) primer pair. Moreover, the obtained PCR product fragments from (MPyC1F C1 and PyEIIWPN) primers were sized by Fragment Length Analysis (FLA) which can sequence fragments less than 500bp. FLA analysis accurately showed the fragment size of S-alleles on results paper as a peak excepts some alleles whose size is bigger than 500bp. Thus, The S-allele genotyping was done correctly.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    816188

    Orta anadolu'da doğal olarak yetişen zerdali (Prunus armeniaca L.) genotiplerinde biyoçeşitliliğin S allel kompozisyonu ile belirlenmesi

    Determination of biodiversity in zerdali (Prunus armeniaca L.) genotypes naturally growing in Central Anatolia by S allelle composition

    ZEHRA REFAYELİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatAtatürk Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZAİ ERCİŞLİ

  2. Tez No

    301023

    Bazı kayısı genotiplerinde eşeysel uyuşmazlık durumlarının arazi koşullarında ve moleküler tekniklerle araştırılması

    Investigation sexual incompatibility cases in some apricot genotypes under field conditions and using molecular techniques

    ZEHRA TUĞBA ABACI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Biyolojiİnönü Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BAYRAM MURAT ASMA

    PROF. DR. SALİH KAFKAS

  3. Tez No

    522412

    İki farklı kısır susam mutantının morfo-fizyolojik ve genetik karakterizasyonu

    Morpho-physiologic and genetic characterization of two different infertile mutants of sesame

    HABİBE NİHAL DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSA İLHAN ÇAĞIRGAN

  4. Tez No

    958813

    Ergenlerde kendine zarar verme davranışının OXTR- rs53576,rs2254298 ve CD38-rs3796863 Gen Polimorfizmleri ile İlişkisinin İncelenmesi

    Investigation of the relationship between non-suicidal self-injury in adolescents and oxtr-rs53576, rs2254298 and cd38-rs3796863 gene polymorphisms

    LARA NAZ KULAKSIZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    PsikiyatriTrakya Üniversitesi

    Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HASAN CEM AYKUTLU

  5. Tez No

    306263

    Türk toplumunda ailesel nonsendromik işitme kaybının genetik temelinin araştırılması

    The investigation of the genetic base of the familial nonsyndromic hearing loss in turkish population

    ASLI SUBAŞIOĞLU UZAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    GenetikErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUNİS DÜNDAR

Geri Dön