Remdesivir ve parasetamol arasındaki ilaç etkileşimlerinin DFT, QTAIM ve moleküler kenetleme yöntemleri ile incelenmesi
Investigation of drug interactions between remdesivir and paracetamol by DFT, QTAIM and molecular docking methods
- Tez No: 935506
- Danışmanlar: PROF. DR. CEMAL PARLAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 48
Özet
Bu çalışmada, sıklıkla birlikte reçete edilen antiviral remdesivir (RDV) ve analjezik–antipiretik parasetamol (PCM) arasındaki etkileşimlerin, tek ilaç–çok kazanç yaklaşımı ya da akıllı ilaç çalışmalarına katkı olarak, etki düzeylerinin belirlenmesi planlanmıştır. İlaç çiftlerinin etkileşimleri ve aktiviteleri DFT ve QTAIM metotları ve protein–ligand (ilaç ve ilaç çiftleri) etkileşimleri ise siklooksijenaz (COX-2) için 5KIR ve SARS-CoV-2 RNA' ya bağımlı RNA polimeraz (RdRp) için 7AAP enzimlerine karşı moleküler kenetleme simülasyonları ile incelenmiştir. İlaç–ilaç ve protein–ilaç çifti olarak iki aşama da incelenen tüm etkileşimler için en kararlı ve en reaktif yapılar belirlenmiştir. RDV ve PCM ilaçlarının etkileşiminin anti–viral/inflamatuar aktiviteleri arttırdığı gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
This study aimed to determine the levels of effect of the interactions between the antiviral remdesivir (RDV) and analgesic-antipyretic paracetamol (PCM), which are frequently prescribed together, as a contribution to single drug–multiple gain approaches or smart drug works. The interactions and activities of the coupled drug were investigated by DFT and QTAIM methods and protein–ligand (drug and drug coupled) interactions were investigated by molecular docking simulations against 5KIR enzyme for cyclooxygenase (COX-2) and 7AAP enzyme for SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). The most stable and reactive structures were determined for all interactions examined in two stages as drug–drug and protein–coupled drug. It was observed that the interaction of RDV and PCM drugs increased their anti–viral / inflammatory activities.
Benzer Tezler
- Twitter verisi üzerinde Covid-19'a karşı etkili olan ilaçların doğal dil işleme kullanılarak analizi
Analysis of drugs effective against Covid-19 using natural language processing on Twitter data
ORHAN TALHA KUM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEFER BADAY
- Covid-19 tedavisi için rna-bağımlı rna polimeraz (RDRP) inhibitörlerinin sanal ligand taraması yöntemiyle tasarlanması
Design of rna-dependent rna polymerase (RDRP) inhibitors by virtual ligand screening method for the treatment of Covid-19
BEKİR CAN UĞUR
- Study the effect of medicatins used for COVID patients on liver function in Iraqi people
Irak insanlarında kovid hastalarında kullanılan ilaçların karaciğer fonksiyonu üzerine etkisinin çalışması
MOHAMMED HASHIM MOHAMMED MOHAMMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU
DR. ÖĞR. ÜYESİ BİLAL JASİR MOHAMMED AL-RAWİ ALDAHHAM
- Repurposing of existing drugs for treatment of Covid-19 target RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) enzyme-using in silico screening techniques
Covid-19 hedef RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRp) enzimlerinin tedavi için mevcut ilaçların yeniden kullanılması siliko tarama tekniklerinde kullanılması
MELTEM KILIÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyolojiKadir Has ÜniversitesiHesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
- Development of peptides for targeting TMPRSS2 as drug candidates and targeting spike MHC-II T-cell epitopes as vaccine candidates for COVID-19
COVID-19 ilaç çalışmaları için TMPRSS2 hedefine yönelik, aşı çalışmaları için spike MHC-II T-hücre epitoplarına yönelik peptitlerin geliştirilmesi
GİZEM BEYOĞLU BOZDOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ