Gundelia tenuisecta etanol ekstraktının biyoaktif kompozisyonu Covid-19 spike ACE2 bağlanma inhibisyon potansiyeli ile in silico molecular docking ve adme özelliklerinin belirlenmesi
Determination of the bioactive composition of gundelia tenuisecta etanol extract with covid-19 spike ACE2 binding inhibition potential and in silico molecular docking and adme properties
- Tez No: 940255
- Danışmanlar: PROF. DR. FATİH ÇAĞLAR ÇELİKEZEN, DR. MEHMET FIRAT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bitlis Eren Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Bitkiler insanlık tarihi boyunca hastalıkların tedavisinde ve hastalıklardan korunmak amacıyla kullanılmıştır. Yan etkilerinin az olması ve bitki bazlı ilaçların maliyetlerinin düşük olması sebebi ile doğal ajanların anti-COVID etkileri dünyada birçok laboratuvarda araştırılmaktadır. Sunulan çalışmada Gundelia tenuisecta (Boiss.) Freyn & Sint bitkisinin in vitro ve insilico ortamlarda anti COVID-19 etkisi araştırıldı. In vitro çalışmalar ticari kitler kullanılarak spektrofotometrik olarak yapıldı. Bitki içeriği ise HPLC-DAD analizleri ile tespit edildi. Tespit edilen komponentlerin ADME özellikleri SwissADME web aracı kullanılarak yapılırken moleküler docking çalışmaları CB-DOCK-2 web aracı ile yapıldı. Elde edilen veriler G. tenuisecta bitkisinin 0.01 µl konsantrasyonda %19.23 oranında COVID-19 Spike ACE2 bağlanma inhibisyonu gerçekleştirdiğini gösterdi. Bunun yanında, bitki içeriğinde tespit edilen bileşiklerden resveratrol, kuersetin ve krisin tüm ilaç filtrelerine uyum gösterdi. Klorojenik asit, p-kumarik asit, salisilikasit ve t-sinamik asit sitokrom p450 izoenzimlerine karşı hiçbir inhibisyon etkisi göstremedi. Kan beyin bariyerini klorojenik asit ve kuersetin dışında tüm moleküller geçti. Moleküler docking çalışmalarında ise en yüksek bağlanma enerjisine sahip molekül klorojenik asit olarak tespit edildi (∆G= -8.3 kcal/mol). Sonuç olarak, G. tenuisecta bitkisinin in vitro ve in silico analiz sonuçları bu bitkinin COVID-19'a karşı kullanılabileceğini gösterdi.
Özet (Çeviri)
Plants have been used throughout human history for the treatment and prevention of diseases. Due to the low side effects and low cost of plant-based drugs, the anti-COVID effects of natural agents are being investigated in many laboratories around the world. In the present study, the anti COVID-19 effect of Gundelia tenuisecta (Boiss.) Freyn & Sint. was investigated in vitro and in silico. In vitro studies were performed spectrophotometrically using commercial kits. Plant content was determined by HPLC-DAD analysis. ADME properties of the detected components were performed using SwissADME web tool, while molecular docking studies were performed with CB-DOCK-2 web tool. The data obtained showed that G. tenuisecta plant realized 19.23% COVID-19 Spike ACE2 binding inhibition at 0.01 µl concentration. In addition, resveratrol, quercetin and chrysin, the compounds detected in the plant content, complied with all drug filters. Chlorogenic acid, p-coumaric acid, salicylic acid and t-cinnamic acid showed no inhibition effect against cytochrome p450 isoenzymes. All molecules crossed the blood brain barrier except chlorogenic acid and quercetin. Molecular docking studies revealed that chlorogenic acid had the highest binding energy (∆G= -8.3 kcal/mol). In conclusion, the results of in vitro and in silico analysis of G. tenuisecta showed that this plant can be used against COVID-19.
Benzer Tezler
- Anadolu'da yetişen Gundelia taksonlarının biyolojik aktivitelerinin ve kimyasal içeriklerinin belirlenmesi
Investigation of biological activities and chemical composition of Gundelia taxa growing in Anatolia
ABBAS TARHAN
- Gundelia cappadocica bitkisinin kimyasal kompozisyonu, COVİD-19 spıke ACE2 bağlanma inhibisyon potansiyeli ile ın sılıco molecular dockıng ve adme özelliklerinin belirlenmesi
Chemical composition, COVİD-19 spike ACE2 binding inhibitionpotential and in silico molecular docking and admeproperties of gundelia cappadocica
AYDIN BAŞTİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
KimyaBitlis Eren ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH ÇAĞLAR ÇELİKEZEN
DR. MEHMET FIRAT
- Endemik Gundelia dersim bitkisinin farklı ekstraklarının sitotoksik ve antigenotoksik etkilerinin araştırılması
Investigation of cytotoxic and antigenotoxic effects of different extracts of endemic Gundelia dersim plant
SALİHA AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaBalıkesir ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERAP DOĞAN
DR. BEGÜMHAN YILMAZ KARDAŞ
- Diyarbakır, Şanlıurfa ve Mardin illerinde kenger bitkisinde (Gundelia spp.) zararlı böcek türleri ve doğal düşmanlarının belirlenmesi
Determination of pest insect species and natural enemies of kenger plant (Gundelia spp.) in Diyarbakır, Şanlıurfa and Mardi̇n provinces
HAKAN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilim ve TeknolojiDicle ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL BOLU
- Endemik Gundelia dersim ekzozomlarının farklı kanser tipleri üzerinde anti kanser etkisi
Anti-cancer effect of endemic Gundelia dersim exosomes on different cancer types
GÜL KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiFırat ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FAZİLET ERMAN