Üreteropelvik bileşke obstrüksiyonu tanısında idrarda uzun kodlamayan RNA MALAT-1 ve HOTAİR ekspresyon düzeyleri
Üreteropelvik bileşke obstrüksiyonu tanisinda i̇drarda uzun kodlamayan RNA MALAT-1 ve HOTAIR ekspresyon düzeyleri
- Tez No: 945894
- Danışmanlar: PROF. DR. TAYFUN MEVLÜT OKTAR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Üroloji, Bilim ve Teknoloji, Çocuk Cerrahisi, Urology, Science and Technology, Pediatric Surgery
- Anahtar Kelimeler: Cerrahi-ürolojik, Destek vektör makineleri, Makine öğrenmesi, Makine öğrenmesi yöntemleri, Piyeloplasti, Teşhis teknikleri-ürolojik, Vezikoüreteral reflü, Üreter tıkanmaları, Üreteropelvik bileşke darlığı, İnsan-yapay zeka etkileşimi, Surgery-urologic, Support vector machines, Machine learning, Machine learning methods, Pieloplasty, Diagnostic techniques-urological, Vesico ureteral reflux, Ureteral obstruction, Ureteropelvic junction obstruction, Human-artificial intelligence interaction
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Üroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaçlar: Üreteropelvik bileşke (ÜPB) obstrüksiyonu, çocukluk çağında sık görülen konjenital üriner sistem anomalilerindendir. Bu çalışmanın amacı, idrar eksozomlarında ölçülen uzun kodlamayan RNA'lardan (lncRNA) MALAT-1 ve HOTAİR'in ÜPB tanı ve cerrahi karar sürecindeki rollerini araştırmak ve yapay zekâ tabanlı bir tahmin modeli geliştirmektir. Hastalar ve Yöntemler: Antenatal/postnatal APD kriterlerini karşılayan 64 çocuk çalışmaya dahil edilmiştir. Cerrahi uygulanan 38 hasta obstrüksiyon, 26 hasta ise non-obstrüktif dilatasyon (NOD) grubunu oluşturmuştur. Ayrıca 24 sağlıklı çocuk kontrol grubuna alınmıştır. Tüm katılımcılardan non-invaziv olarak alınan idrar örneklerinden MALAT-1 ve HOTAİR düzeyleri qRT-PCR ile ölçülmüştür. Hastaları sınıflandırmak ve cerrahi ihtimalini öngörmek amacıyla lineer çekirdekli destek vektör makineleri (SVM) algoritması kullanılmıştır. Bulgular: Obstrüksiyon grubunda preoperatif MALAT-1 düzeyleri anlamlı şekilde daha yüksek saptanmış olup (p<0.05) cerrahi sonrası ise kontrol grubu ile benzer seviyelere gerilemiştir. HOTAİR düzeyleri kontrol grubuna göre yüksek saptanmış olup (p<0.05), NOD grubuyla fark saptanmamıştır (p>0.05). Çok değişkenli analizde MALAT-1, APD ve MAG-3 oranı cerrahi gereksinimin bağımsız belirleyicileri olarak belirlenmiştir. SVM modeli %91.94 doğruluk, %89.47 duyarlılık, %95.83 özgüllük, 0.93 F1 skoru ve 0.950 AUC değeriyle yüksek performans göstermiştir. Bu modele dayalı çevrimiçi bir web uygulaması geliştirilmiştir: https://rifat-ergul.shinyapps.io/rabb/ Sonuçlar: MALAT-1 ve HOTAİR, ÜPB'nin tanı ve yönetiminde potansiyel biyobelirteçler olarak öne çıkmaktadır. SVM tabanlı model ve web uygulaması, klinik karar destek sistemleri için yenilikçi bir araç sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Objectives: Ureteropelvic junction (UPJ) obstruction is one of the most common congenital urinary tract anomalies in childhood. This study aimed to investigate the diagnostic and surgical decision-making roles of the long non-coding RNAs (lncRNAs) MALAT-1 and HOTAIR measured in urinary exosomes, and to develop an artificial intelligence–based prediction model. Patients and Methods: A total of 64 children meeting antenatal/postnatal APD criteria were included. Thirty-eight patients who underwent surgery formed the obstruction group, while 26 were assigned to the non-obstructive dilatation (NOD) group. Additionally, 24 healthy children were included as controls. MALAT-1 and HOTAIR levels were measured using qRT-PCR from urine samples collected non-invasively. A linear support vector machine (SVM) algorithm was used to classify patients and predict surgical need. Results: Preoperative MALAT-1 levels were significantly higher in the obstruction group (p<0.05) and returned to normal postoperatively. Although HOTAIR levels were higher than in controls (p<0.05), there was no significant difference between the obstruction and NOD groups (p>0.05). Multivariate analysis identified MALAT-1, APD, and MAG-3 differential function as independent predictors of surgical intervention. The SVM model showed high performance with 91.94% accuracy, 89.47% sensitivity, 95.83% specificity, an F1 score of 0.93, and an AUC of 0.950. A web-based application was developed based on this model: https://rifat-ergul.shinyapps.io/rabb/ Conclusion: MALAT-1 and HOTAIR appear to be promising biomarkers in the diagnosis and management of UPJ obstruction. The SVM-based model and web tool provide an innovative approach to support clinical decision-making.
Benzer Tezler
- Vezikoüreteral reflü ve üreteropelvik darlığın renal morfoloji üzerine etkileri (Karşılaştırmalı deneysel çalışma)
Başlık çevirisi yok
İSMAİL BAŞARAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
Genel CerrahiÇukurova ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERBUĞ KESKİN
- Üreteropelvik obstrüksiyon şüphesi olan olgularda renal sintigrafide farklı diüretik uygulama protokollerinin (F+20, F+0 ve F-15) karşılaştırılması
The Comparison between different diuretic application protocols (F+20, F+0 and F-15) in renal scintigraphy in cases which involve suspicion of ureteropelvic obstruction
ŞEYDA TÜRKÖLMEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
Radyoloji ve Nükleer TıpGazi ÜniversitesiNükleer Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TAMER ATASEVER