Molecular characterization of cabbage black rot disease agent Xanthomonas campestris pv. campestris isolates and investigation of its biological control with antagonistic bacterial species
Lahana siyah damar çürüklüğü hastalık etmeni Xanthomonas campestris pv. campestris izolatlarının moleküler karakterizasyonu ile antagonistik bakteri türleriyle biyolojik mücadelesinin araştırılması
- Tez No: 951150
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMİNUR ELÇİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc)' nin neden olduğu siyah damar çürüklüğü, Niğde'de lahana bitkisini etkileyen en önemli bakteriyel hastalıklardan birisidir. Bu çalışmada, lahana bitkisinden izole edilen izolatlar fenotipik ve genotipik olarak karakterize edilip, biyolojik mücadelesi araştırılmıştır. Aşırı duyarlılık, pektolitik aktivite, patojenite ve gram boyama testleri gibi fenotipik analizler ve patovar-spesifik markör ile yapılan moleküler analizler izolatların teşhisini doğrulamıştır. Rep-PCR'ın kümeleme analizinde, UPGMA dendrogramı izolatları üç ana kümeye ayırmıştır. Temel bileşen analizi de bu bulguları desteklemiştir. MLSA' da, rpoD geni ile oluşturulan filogenetik ağaç, dnaK ve gyrB genlerinin aksine, izolatları kendi içinde alt gruplara ayırmıştır. Xcc' nin biyolojik mücadelesinde ise, aşırı duyarlılık, pektolitik aktivite ve patojenite testleri sonucunda seçilen dört antagonistik bakteri, 16S rRNA geni ve MALDI-TOF MS analizine göre Bacillus spp. olarak tanılanmışlardır. Hem in vitro hem de in vivo koşullar altında yapılan deneylerde tüm Bacillus izolatlarının Xcc'ye karşı etkili olduğu belirlenmiştir. Bu bulgularının, bölgede hastalık etmeni hakkında ve mücadele yöntemlerinin geliştirilmesinde bilgi sağlaması beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
Black rot, caused by Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), is one of the most important bacterial diseases affecting cabbage in Niğde. In this study, isolates from cabbage were phenotypically and genotypically characterized, and their biological control was investigated. Phenotypic analyses, including hypersensitivity, pectolytic activity, pathogenicity and Gram stain tests, along with molecular analyses using a pathovar-specific marker, confirmed the identification of the isolates. In the clustering analysis of Rep-PCR, the UPGMA dendrogram separated the isolates into three main clusters. Principal component analysis also supported these findings. In MLSA, the phylogenetic tree constructed with the rpoD gene, in contrast to the dnaK and gyrB genes, divided the isolates into subgroups within themselves. In the biological control of Xcc, four antagonistic bacteria selected based on hypersensitivity, pectolytic activity, and pathogenicity tests were identified as Bacillus spp. based on 16S rRNA gene and MALDI-TOF MS analysis. Experiments conducted under both in vitro and in vivo conditions determined that all Bacillus isolates were effective against Xcc. These findings are expected to provide information about the disease agent in the region and for the development of control methods.
Benzer Tezler
- Nükleer rezonasta moleküler yapıların incelenmesi (yapısal faz geçiş kuramları üzerine bir inceleme)
Başlık çevirisi yok
ABDURRAHMAN ANDİÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Fizik ve Fizik MühendisliğiUludağ ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTAÇ YALÇINER
- 1,3-difenil-4,5-bis(hidroksiimino)-imidazolidin ve Ni(II), Cu(II), Pd(II), UO2(VI) komplekslerinin sentezi
Başlık çevirisi yok
VEFA AHSEN
Doktora
Türkçe
1984
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZER BEKAROĞLU
- Purification of bacteriorhodopsin from halobacterium halobium and reconstitution studies in liposomes
Başlık çevirisi yok
M.BAKER ZABUT
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- NH3 için önerilen yeni bir gerçek gaz hal denklemi ve bu hal denklemi ile bazı moleküler-fiziksel özelliklerin saptanması
Başlık çevirisi yok
MERAL HOŞCAN