CCDC13 genindeki mutasyonun nörogelişimsel bir hastalıktaki rolünün knockout zebra balığı modeli ile araştırılması
Investigation of the role of the CCDC13 gene mutation in a neurodevelopmental disorder using a knockout zebrafish model
- Tez No: 958076
- Danışmanlar: PROF. DR. SULTAN CİNGÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Moleküler biyoloji, Moleküler genetik, Nörobiyoloji, Molecular biology, Molecular genetic, Neurobiology
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Nörogelişimsel hastalıklar, dünya genelinde çocukların %3'ünden fazlasını etkilemektedir. Nörogelişimsel bozuklukların etiyolojisinde nadir varyasyonlar ve de novo mutasyonların belirleyici roller oynadığı bilinmektedir. CCDC13 geninin, mitoz sırasında DNA hasarının artmasını önleyerek genom stabilitesini koruduğu ayrıca PCM1, Cep290 ve pericentrin gibi proteinlerle etkileşime girerek silyum biyogenezinde görev alan sentriyolar uydu proteinlerinden birini kodladığı ve siliyopati proteini BBS4'ün lokalizasyonu için gerekli bir bileşen olduğu gösterilmiştir. CCDC13 proteini, birçok nörogelişimsel hastalık ve siliyopati ile ilişkilendirilen uydu proteinleriyle etkileşim halinde olmasına rağmen, literatürde CCDC13 genindeki herhangi bir germ hattı varyasyonunun nörogelişimsel ya da başka bir hastalıkla ilişkisini ortaya koyan bir çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmada, indeks hasta ve literatür taramalarında tespit ettiğimiz hastalarda CCDC13 geninde de novo varyasyonlar bildirilmiştir. Ancak gendeki varyasyonların herhangi bir hastalıkla ilişkisini gösteren bir çalışma bulunmamaktadır. Araştırmamızda CCDC13 genindeki nadir mutasyonların nörogelişimsel fenotiplere katkısını ortaya koymak amaçlanmıştır. CRISPR-Cas9 teknolojisi ile zebra balığı (Danio rerio) embriyolarında hedeflenen ccdc13 gen lokusu işlevsiz hale getirilmesiyle oluşan model ile gendeki varyasyonların genotip-fenotip ilişkisi deneysel olarak test edilmiştir
Özet (Çeviri)
Neurodevelopmental disorders affect more than 3% of children worldwide. Rare variants and de novo mutations are known to play decisive roles in the etiology of neurodevelopmental disorders. The CCDC13 gene is known to preserve genomic stability by preventing increased DNA damage during mitosis and to encode one of the centriolar satellite proteins involved in ciliogenesis through interactions with proteins such as PCM1, Cep290, and pericentrin. It is also recognized as an essential component for the localization of the ciliopathy-associated protein BBS4. Although the CCDC13 protein interacts with satellite proteins associated with various neurodevelopmental disorders and ciliopathies, there are no studies in the literature demonstrating an association between any germline variant in the CCDC13 gene and neurodevelopmental or other diseases. In this study, de novo variants in the CCDC13 gene were identified in the index patient and in additional cases found through literature review. However, no study has established an association between the gene variants and any disease. The aim of our research is to elucidate the contribution of rare mutations in the CCDC13 gene to neurodevelopmental phenotypes. The genotype-phenotype correlation of the gene variants was experimentally assessed using a model generated by the functional disruption of the target ccdc13 gene locus in zebrafish (Danio rerio) embryos via CRISPR-Cas9 technology.
Benzer Tezler
- Situs inversus totalisi olan primer siliyer diskinezi tanılı hastaların demografik, fenotipik ve genotipik özellikleri
Demographic, phenotypic and genotypic characteristics of patients diagnosed with primery ciliary dyskinesia with situs inversus totalis
UZEYİR JAFAROV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıBezm-İ Alem Vakıf ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERKAN ÇAKIR
- Search for the novel protein markers that may allow early diagnosis of breast cancer by using comparative serological proteome analysis of breast cancer tissues
Meme kanser dokularında karşılaştırmalı serolojik proteom analizi yaparak meme kanserinin erken tanısında kullanılabilecek potansiyel biyomarker moleküllerin araştırılması
KÜBRA KARAOSMANOĞLU YÖNETEN
Doktora
İngilizce
2020
Tıbbi BiyolojiKocaeli ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT KASAP
- Dissecting the regulation of the centrosome/cilium complex biogenesis using proximity-based proteomics
Sentrozom/silyim compleks biogenezinin regülasyonunun yakınlığa dayalı proteomik yöntemlerle incelenmesi
MELİS DİLARA ARSLANHAN GÜL
Doktora
İngilizce
2022
BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF NUR FIRAT KARALAR
- Koyunlarda peri-implantasyon döneminde uterus lümen sıvısının proteomiks analizi
Proteomic analysis of uterine luminal fluid during the peri-implantation period in sheep
MEHMET POLAT
Doktora
Türkçe
2026
Veteriner HekimliğiDicle ÜniversitesiVeterinerlik Doğum ve Jinekolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KÖSE