Geri Dön

Ekstraintestinal patojenik Escherichia coli izolatlarında virülans genlerinin ve patojenite adalarının araştırılması

Investigation of virulance genes and pathogenetic islands in extraintestinal pathogenic Escherichia coli isolats

PDF İndir

  1. Tez No: 958272
  2. Yazar: İLKNUR YİĞİT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. DİDEM ÖZGÜR, DR. ÖĞR. ÜYESİ NURULLAH ÇİFTÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kafkas Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Ekstraintestinal patojenik Escherichia coli (ExPEC), tüm yaş gruplarını etkileyen önemli bir Gram negatif patojendir. Çalışmada ExPEC ve sağlıklı bireylerin fekal örneklerinden izole edilen kommensal Escherichia coli (E. coli) izolatlarının filogenetik gruplarının belirlenmesi, virülans faktör genleri ile patojenite adaları (PAI'ler)'nın araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamıza Kafkas Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına gelen klinik örneklerden izole edilen 50 ExPEC ve 50 E. coli izolatı dahil edilmiştir. Multiplex PZR yöntemi kullanılarak filogenetik gruplar, virülans faktör genleri ve PAI'lerin varlığı belirlenmiştir. Antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile saptanmıştır. Genişletilmiş spektrumlu beta laktamaz üretimi, Çift Disk Sinerji Testi ile tespit edilmiştir. ExPEC izolatlarında saptanan virülans faktör genleri sırasıyla iutA %58 (n=29), iss %40 (n=20), iroN %24 (n=12), papC %20 (n=10), hlyF %14 (n=7), cnf1 %12 (n=6) ve fyuA %10 (n=5); PAI'ler ise IV536 %20 (n=10) ve IICFT73 %10 (n=5) olarak belirlenmiştir. Filogenetik olarak bu izolatların %50 (n=25)'si Grup-A'da, %10 (n=5)'u Grup-B1'de, %26 (n=13)'sı Grup-B2'de ve %14 (n=7)'ü Grup-D'de saptanmıştır. Kommensal izolatlarda saptanan virülans faktör genleri sırasıyla iutA %66 (n=33), iss %34 (n=17), ve fyuA %32 (n=16), iroN %14 (n=7), papC %10 (n=5), hlyF %6 (n=3), cnf1 %4 (n=2); PAI olarak ise yalnızca IV536 %40 (n=20) oranında tespit edilmiştir. Filogenetik olarak bu izolatların, %56 (n=28)'sı Grup-A'da, %6 (n=3)'sı Grup-B1'de, %20 (n=10)'si Grup-B2'de ve %18 (n=9)'i Grup-D'de saptanmıştır. Sonuç olarak, ExPEC izolatlarının kommensal E. coli'ye kıyasla daha fazla virülans geni ve PAI taşıdığı belirlenmiştir. ExPEC' in patojenitesinin moleküler düzeyde tanımlanmasının, enfeksiyonların kontrolü ve etkili tedavi stratejilerinin geliştirilmesi açısından kritik öneme sahip olduğunu düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) is one of the most common Gram negative bacterial pathogens affecting individuals across all age groups. The objective of this study was to characterize the phylogenetic distribution, virulence factor genes, and pathogenicity islands (PAIs) of ExPEC and commensal Escherichia coli (E. coli) isolates obtained from the fecal samples of healthy individuals. A total of 50 ExPEC and 50 commensal E. coli isolates recovered from clinical specimens submitted to the Medical Microbiology Laboratory of Kafkas University Research and Training Hospital were included in the study. The ExPEC isolates were evaluated for phylogenetic grouping, the presence of virulence factor genes, and PAIs using the multiplex PCR method. Antimicrobial susceptibility testing was performed using the Kirby-Bauer disk diffusion method, and Extended-spectrum beta-lactamase production was detected using the Double Disk Synergy Test. The virulence factor genes detected in ExPEC isolates were as follows: iutA (58%, n=29), iss (40%, n=20), iroN (24%, n=12), papC (20%, n=10), hlyF (14%, n=7), cnf1 (12%, n=6), and fyuA (10%, n=5). The PAIs identified in these isolates included IV536 (20%, n=10) and IICFT73 (10%, n=5). Phylogenetic analysis of the ExPEC group revealed that 50% (n=25) belonged to Group A, 10% (n=5) to Group B1, 26% (n=13) to Group B2, and 14% (n=7) to Group D. In the commensal isolates, the virulence factor genes detected were: iutA (66%, n=33), iss (34%, n=17), fyuA (32%, n=16), iroN (14%, n=7), papC (10%, n=5), hlyF (6%, n=3), and cnf1 (4%, n=2). Among the commensal isolates, 56% (n=28) were classified in phylogenetic Group A, 6% (n=3) in Group B1, 20% (n=10) in Group B2, and 18% (n=9) in Group D. In conclusion, ExPEC isolates were found to harbor a greater numbeR of virulence genes and PAIs compared to commensal E. coli strains. Molecular characterization of ExPEC pathogenicity is considered critical for infection control and the development of effective treatment strategies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    659717

    Ürosepsis etkeni olan escherichia coli izolatlarının virülans genlerinin araştırılması

    Investigation of virulence genes of escherichia coli isolates causing urosepsis

    EFDAL OKTAY GÜLTEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU

  2. Tez No

    14453

    İnce ve kalın barsak yerleşimli crohn hastalığında cerrahi tedavi yaklaşımları

    Başlık çevirisi yok

    METİN ERTEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    Genel Cerrahiİstanbul Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ALİ HAYDAR TAŞPINAR

  3. Tez No

    22401

    Ekstra-intestinal ve intestinal amöbiyazda serum immunoglobulin düzeyleri ve indirekt hemaglutinasyon testin tanı değeri

    Başlık çevirisi yok

    VEYSEL BAKIŞGAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1992

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İZZET ŞAHİN

  4. Tez No

    22908

    Edirne ve çevresinde yersinia enterocolitica infeksiyon oranının serolojik olarak belirlenmesi

    Başlık çevirisi yok

    FİLİZ AKATA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1992

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiTrakya Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. H. MURAT TUĞRUL

  5. Tez No

    30167

    Ankara'daki askeri birliklerin su kaynaklarında aeromonos'ların bulunuşu

    Isolation and identification of aeromonas species from water sources of military units

    TURGUT KENAN GÜRSOY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1993

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET YURTYERİ

Geri Dön