Interaction of syndecan-1 cytoplasmic domain with CASK PDZ domain
Sindekan-1 in sitoplazmik bölgesinin, CASK in PDZ bölgesi ile etkileşimi
- Tez No: 96198
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SMİTH GÜNAY ÇİZMECİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2000
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 79
Özet
ÖZET Sindekan proteinleri önemli hücresel faaliyetlerde görev alan hücre zarı proteoglikanlarındandır. Sindekanlarm, hücre dışı matriks molekülleri, hücreler arası bağlantı molekülleri, ve bazı büyüme hormonları gibi değişik hücre dışı ligandlan için yardımcı reseptör olarak görev aldıkları düşünülmektedir. Önceden bu tip fonksiyonları sayesinde, hücre çoğalmasında, hücreler arası bağlantılarda, hücre hareketlerinde, ve hücre kaderinin belirlenmesinde ayarlayıcı rolleri gösterilmiştir. Yakın zamandaki çalışmalarda ise bu moleküllerin hücre içindeki protein zinciri bölümlerinin görev aldığı etkileşmeler sayesinde sinyal iletimi fonksiyonlarını ayarladıkları gösterilmiştir. Bu etkileşmelerin büyük bir kısmı bu moleküllerin büyük oranda korunmuş olan sitoplasmik bölgeleri yardımıyla gerçekleşmektedir. Sindekanlarm karboksil uçlarında sinyal iletimi olaylarındaki rollerini açıklamada çok önemli olabilecek PDZ bölgesi bağlanma alanları bulunmaktadır. Biz, mayada melezleme tekniği ile sindekanlarm sitoplasmik bölgelerinin görev aldığı yeni protein etkileşmelerini ortaya çıkarmayı amaçladık. Bunun için CASK proteini ve AF-proteininin PDZ bölgeleri ile sindekanlarm sitoplasmik bölgeleri arasındaki etkileşmeleri mayada melezleme tekniği ile denedik. Çalışmalarımızın sonunda CASK proteini ile sindekan-1 proteini arasında bir etkileşme olduğunu gösterdik. Sonuçlarımız gösterdi ki CASK proteini PDZ bölgesi sayesinde sindekan-1 proteininin sitoplasmik bölgesine, maya hücresi içerisinde eksprese edildikleri zaman bağlanabilmektedir. Ve bu etkileşmenin sinyal iletimi olaylarında önemli fonksiyonları olması muhtemeldir. iv
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Syndecans are integral membrane proteoglycans which have important cellular functions. They are thought to function as co-receptors for various extracellular ligands like extracellular matrix molecules, cell-cell adhesion molecules, and growth factors. It is shown that they modulate cell proliferation, cell adhesion, cell motility, and cell fate upon such interactions. Recent studies indicated that they also modulate signal transduction events by their core protein interactions. Most of these interactions are through their highly conserved cytoplasmic domains. They contain PDZ domain binding site at their carboxy terminal end, and identification of PDZ protein interactions of Syndecans may be important to explain their role in signaling. We aimed to identify a protein-protein interaction between Syndecan-1 cytoplasmic domain and PDZ domains of CASK and AF-6 proteins with yeast two-hybrid technique. We showed that there is a detectable interaction between CASK and Syndecan-1 through these domains. Our results indicated that CASK PDZ domain binds to Syndecan-1 cytoplasmic domain when expressed in yeast, and this interaction may have important functions in signaling events. Ill
Benzer Tezler
- Sindekan-1 (cd 138) molekülünün serum konsantrasyonu ile izole koroner arter bypass greft cerrahisi sonrası erken dönem mortalite ve morbidite ilişkisinin araştırılması
Determination of the relationship between Syndecan-1 (cd 138) concentration and early postoperative mortality and morbidity in patients with isolated coronary artery bypass surgery
SADIK AHMET SÜNBÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Göğüs Kalp ve Damar CerrahisiSağlık Bilimleri ÜniversitesiKalp ve Damar Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET FATİH ÖZYAZICIOĞLU
- The role of tissue transglutaminase (dTG) in renal cell carcinoma cell adhesion and cell migration
Doku transglutaminaz (dTG)'ın böbrek hücre karsinomlu hücre yapışması ve metastazındaki rolü
YEŞİM BAĞATUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DİLEK TELCİ
- Interaction of private art venues with surrounding urban areas (The case of Tophane)
Özel sanat kurumlarının kent alanları ile ilişkisi (Tophane vakası)
MURAT BOROVALI
Doktora
İngilizce
2015
Kamu YönetimiYeditepe ÜniversitesiAntropoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞIN CANDAN
- Kanserli hücrelerde folik asit içeren magnetik nanopartikül etkileşimi
Interaction of cancer cells with folic acid modified magnetic nanoparticles
NAGEHAN SALTAN
- İdarenin sorumluluğunda adli ve idari yargı kararlarının etkileşimi
Interaction of judicial and administrative jurisdiction in the responsibility of the administration
MUSTAFA BURAK YETİŞKİN
Doktora
Türkçe
2024
HukukAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiKamu Hukuku Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENGİN SAYGIN