Geri Dön

Türkiye kıyılarındaki lüfer balığının (Pomatomus saltatrix) genetik çeşitliliğinin belirlenmesi

Determination of genetic diversity of bluefish (Pomatomus saltatrix) in Turkish coasts

PDF İndir

  1. Tez No: 963540
  2. Yazar: İLYAS KUTLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM TURAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gümüşhane Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Ülkemizde ticari açıdan yüksek değere sahip Lüfer (Pomatomus saltatrix) balığı popülasyonları üzerinde detaylı moleküler çalışmaya rastlanmamışken, dünyada ise az sayıda çalışma bulunmaktadır. Önerilen tezde ülkemiz denizlerinde dağılım gösteren, ekonomik olarak değerli bir tür olan Lüfer balığı'nın genetik yapısının mikrosatellit belirteçler ve markör genlerin DNA dizileme yöntemi kullanılarak tespit edilmesi hedeflenmektedir. Çalışma (Hopa, Trabzon, Giresun, Samsun, Sinop, Kefken, İstanbul, İğneada, Erdek, Çanakkale, Bodrum, İzmir, Mersin ve Adana) toplam 14 istasyondan elde edilecek örnekler üzerinden yürütülecektir. Trabzon Su Ürünleri Merkez Araştırma Enstitüsü Moleküler Genetik Laboratuvarında DNA ekstraksiyonu yapılarak, Floresan işaretli primerler ile mikrosatellit lokuslar (8 lokus), mtDNA genlerinin (COI ve 16S bölgeleri) ve nükleer gen (Rhodopsin) universal primerler kullanılarak PZR tekniğiyle çoğaltılıp ABI 3500 cihazında sekans dizilimi ve mikrosatalit fragment boyları ayrı ayrı belirlenecektir. Elde edilen veriler DnaSP 4.0 programı kullanılarak tür içi popülasyonlar arası ve popülasyonlar içi haplotipler oluşturulacaktır. Haplotip çeşitliliği (Hd) değeri, Nükleotit çeşitliliği (Pi,  ) ve nükleotit farklılığı (k) değerlerini hesaplanacak, Mega5 ile türler arasındaki filogenetik ilişkiler ve filogenetik ağaç oluşturulacak, Genmaker ile Her bir tür ve lokus için allel büyüklükleri ve frekansları belirlenecek, Arlequın ve Amova ile Moleküler varyans bileşenlerinin ve populasyonlar arası gen akışının hesaplanması yapılacak, Genalex 6 ile Genetik farklılıkla coğrafik mesafe arasındaki ilişkinin belirlenmesi için kullanılarak populasyon genetiği için temel kriterler test edilecektir. Bu verilerden Lüfer (Pomatomus saltatrix) balığının uygun genetik belirteçler (mikrosatellit ve sekans dizilimi) kullanılarak popülasyon genetiği parametreleri, filogenetik ve filocoğrafik yapılanmayı öncelikle yakın türler ve onların populasyonları Genbank verileri ile karşılaştırılarak ortaya konulacaktır.

Özet (Çeviri)

While detailed molecular studies have not been found on Bluefish (Pomatomus saltatrix) populations, which have high commercial value in our country, there are few studies in the world. In the proposed thesis, it is aimed to determine the genetic structure of the bluefish, which is an economically valuable species distributed in the seas of our country, by using microsatellite markers and marker genes using DNA sequencing method. The study (Hopa, Trabzon, Giresun, Samsun, Sinop, Kefken, Istanbul, Igneada, Erdek, Çanakkale, Bodrum, Izmir, Mersin and Adana) will be carried out on samples obtained from a total of 14 stations. DNA extraction was performed at Trabzon Fisheries Central Research Institute Molecular Genetics Laboratory, amplified by PCR technique using fluorescent marked primers and microsatellite loci (8 loci), mtDNA genes (COI and 16S regions) and nuclear gene (Rhodopsin) universal primers, and sequenced in ABI 3500 device and sequenced. microsatellite fragment sizes will be determined separately. Using the obtained data, DnaSP 4.0 program will create intra-species, inter-population and intra-population haplotypes. Haplotype diversity (Hd) value, Nucleotide diversity (Pi,  ) and nucleotide diversity (k) values ​​will be calculated, phylogenetic relationships between species and a phylogenetic tree will be created with Mega5, allele sizes and frequencies for each species and locus will be determined with Genmaker, Arlequin and Calculation of molecular variance components and gene flow between populations will be made with Amova, and basic criteria for population genetics will be tested by using Genalex 6 to determine the relationship between genetic difference and geographic distance. From these data, population genetic parameters, phylogenetic and phylogeographic structure of Bluefish (Pomatomus saltatrix) will be revealed by using appropriate genetic markers (microsatellite and sequence sequencing), primarily by comparing closely related species and their populations with Genbank data.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    153519

    Short-term statistics of wind-waves around the Turkish coast

    Türkiye kıyılarındaki rüzgar dalgalarının kısa dönem istatistiği

    SİNAN AKBAŞOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL ÖZHAN

  2. Tez No

    238725

    Wind and wind wave climate for Turkish coast and application to Aegean and the Mediterranean sea

    Türkiye kıyılarındaki rüzgar ve rüzgar dalga iklimi ve Ege ve Akdeniz için uygulaması

    SERHAN ALDOĞAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Bölümü

    DOÇ. DR. AHMET CEVDET YALÇINER

    DR. IŞIKHAN GÜLER

  3. Tez No

    475051

    Genetic structure of modern and ancient swordfish populations from coasts of Turkey

    Türkiye kıyılarındaki modern ve antik kılıç balığı popülasyonlarının genetik yapısı

    EREN YÜNCÜ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İNCİ ZEHRA TOGAN

  4. Tez No

    50994

    The Biology and population parameters of the whiting (Merlangius merlangus euxinus NORDMANN) in the Turkish coast of the Black Sea

    Türkiye'nin Karadeniz kıyısındaki Mezgit (Merlangius merlangus euxinus NORDMANN) balığının biyolojisi ve populasyon parametreleri

    ALİ İŞMEN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1995

    Su ÜrünleriOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Deniz Biyolojisi ve Balıkçılık Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FERİT BİNGEL

  5. Tez No

    169683

    Türkiye'nin Ege Denizi kıyılarında dağılım gösteren bivalvia (Mollusca) Türklerinin biyo-ekolojik özellikleri

    Bioecological features of bivalvia (Mollusca) distributing along Turkish coasts of Aegean Sea

    ALPER DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MESUT ÖNEN

Geri Dön