Geri Dön

Mycobacterium kansasii izolatlarında ilaç direnç profili ve ilgili gen mutasyonları

Drug resistance profile and related gene mutations in mycobacterium kansasii isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 964060
  2. Yazar: HAKAN FARZİN MEHMETZADE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ALPASLAN ALP
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Daha sMehmetzade, H.F., Mycobacterium kansasii izolatlarında ilaç direnç profili ve ilgili gen mutasyonları. Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Programı Doktora Tezi, Ankara, 2025. Tüberküloz Dışı Mikobakteriler (TDM), çoğunlukla çevrede bulunan bakterilerdir ve üreme hızlarına göre iki gruba ayrılırlar: Yavaş üreyen TDM ve hızlı üreyen TDM. M. kansasii yavaş üreyen bir mikobakteridir ve tüberküloza benzer akciğer hastalığı ve lenfadenit, deri ve yumuşak doku enfeksiyonları gibi akciğer dışı hastalıklara neden olur. Bu çalışmanın amacı, Türkiye'de izole edilmiş olan 40 M. kansasii izolatının minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerlerinin belirlenmesi ve dirençli M. kansasii izolatlarında ilaç direncinden sorumlu gyrA, gyrB, rpoB, rbpA ve rrl genlerinde mutasyon varlığının araştırılmasıdır. Bu çalışma beş aşamadan oluşmaktadır: Konvansiyonel ilaç duyarlılık testleri, DNA ekstraksiyonu, gyrA, gyrB, rpoB, rbpA ve rrl genlerinin amplifikasyonu, Sanger DNA dizilemesi ve Nanopore dizileme. Çalışma sonucunda tüm izolatların amikasin (AMK), klaritromisin (CLA), linezolid (LZD), moksifloksasin (MXF) ve rifabutine (RFB) duyarlı olduğu; izolatların %90'ının siprofloksasin (SIP) ve rifampin (RIF), %47,5'inin doksisilin ve %70'inin trimetoprim/sülfametoksazole (TMP-SMZ) dirençli olduğu gösterilmiştir. Sensititre SLOMYCO panelinde minosiklin bulunmadığı için minosiklinin duyarlılık testi yapılamamıştır. Sanger dizileme sonucunda gyrA, gyrB ve rrl genlerinde herhangi bir mutasyon tespit edilmemiştir. Rifampin Direnç Belirleyici Bölgesi'nde (Rifampin Resistance-Determining Region; RRDR) en sık görülen mutasyonların 447 ve 457 kodonlarında olduğu belirlenmiştir. Bununla birlikte, bu çalışmada ilk kez rpoB geninde RRDR dışındaki 226, 617, 1191 ve 2555. nükleotitlerde mutasyonlar tespit edilmiştir. Ayrıca, rbpA gen bölgesinde herhangi bir mutasyon saptanmamıştır. Bu çalışma sonucunda rifampin dirençli izolatlarda ropB geninde hem RRDR bölgrsinde hem de RRDR dışında yeni mutasyonlar tespit edilmiştir.onra doldurulacaktır.

Özet (Çeviri)

Daha sonMehmetzade, H.F., Drug Resistance Profiles and Associated Gene Mutations in Mycobacterium kansasii Isolates. Hacettepe University Graduate School of Health Sciences, PhD Thesis in Microbiology, Ankara, 2025. Nontuberculous mycobacteria (NTM) are predominantly environmental bacteria that are categorized into two groups based on their growth rates: slow-growing and rapid-growing NTM. M. kansasii is a slow-growing mycobacterium responsible for tuberculosis-like pulmonary diseases as well as extrapulmonary conditions such as lymphadenitis, skin, and soft tissue infections. This study aimed to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) values of 40 M. kansasii isolates that were isolated in Turkey and to investigate mutations in the gyrA, gyrB, rpoB, rbpA, and rrl genes that are associated with drug resistance in resistant isolates. The study was conducted in five stages: conventional drug susceptibility testing, DNA extraction, amplification of gyrA, gyrB, rpoB, rbpA, and rrl genes, Sanger DNA sequencing, and next-generation sequencing. As a result of the study, all isolates were found to be susceptible to amikacin (AMK), clarithromycin (CLA), linezolid (LZD), moxifloxacin (MXF), and rifabutin (RFB); while 90% of the isolates were resistant to ciprofloxacin (CIP) and rifampin (RIF), 47.5% were resistant to doxycycline, and 70% were resistant to trimethoprim/sulfamethoxazole (TMP-SMZ). Susceptibility testing for minocycline could not be performed because minocycline is not included in the Sensititre SLOMYCO panel. Sanger sequencing revealed no mutations in the gyrA, gyrB, or rrl genes. The most frequent mutations in the Rifampin Resistance-Determining Region (RRDR) of the rpoB gene were identified at codons 447 and 457. Notably, for the first time, this study identified mutations outside the RRDR region of the rpoB gene at nucleotides 226, 617, 1191, and 2555. No mutations were detected in the rbpA gene region. This study identified novel mutations in the ropB gene, both inside and beyond the RRDR, in rifampin-resistant isolates.ra doldurulacaktır.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    170774

    Besin maddelerinden Mycobacterium sp. izolasyonu

    Isolation of Mycobacterium sp. from food products

    SERAP DÜLGERBAKİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUHSİN KONUK

  2. Tez No

    656985

    Solunum yolu örneklerinden izole edilen tüberküloz dışı mikobakterilerin PCR-RFLP yöntemi ile tanımlanması

    Identification of non-tuberculous mycobacteria isolated from respiratory specimens by PR-RFLPC method

    ŞERİHAN KÜBRA EMİKOĞLU CERİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiAdıyaman Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLNUR TARHAN

  3. Tez No

    340937

    Klinik örneklerden izole edilen tüberküloz dışı mikobakterilerin dizi analizi ile tanımlanması

    Identification of non-tuberculous mycobacteria isolated from clinical specimens by sequence analysis

    SELÇUK TÜRKEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE AYDAN ÖZKÜTÜK

  4. Tez No

    713493

    Matriks destekli lazer dezorpsiyon/iyonizasyon-uçuş zamanı kütle spektrometresi ile tüberküloz dışı mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanması

    Identification of nontuberculous mycobacteria at species level by matrix assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry

    MERT MANYASLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN ESEN

  5. Tez No

    687508

    Tüberküloz dışı mikobakterilerin PCR-RFLP (polymerase chain reaction restrioction fragment lenght polymorphism) ile tiplendirilmesi

    Typing of non-tuberculosis mycobacteria by PCR-RFLP (polymerase chain reaction restrioction fragment lenght polymorphism)

    TURAN NAJAFLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Sağlık EğitimiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖNÜL ASLAN

Geri Dön