Kanser tanı ve tedavisi için yeni radyofarmasötiklerin İnSiliko ve İn Vitro çalışmalar ile belirlenmesi
Identification of new radiopharmaceuticals for cancerdiagnosis and treatment by In Silico and In Vitro studies
- Tez No: 964657
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FERAH CÖMERT ÖNDER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Radyoloji ve Nükleer Tıp, Tıbbi Biyoloji, Radiology and Nuclear Medicine, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Sistem Biyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
İn siliko yaklaşımlar geleneksel in vitro ve in vivo radyofarmasötik geliştirme yöntemleri tarafından oldukça zorlayıcı olan kritik değişkenler için sonuçları ve bir bileşiğin hedef bağlama özelliklerini tahmin edebilir. Bu nedenle, in siliko yöntemlerin dahil edilmesi öncü bileşikleri değerlendirmek için hayvan modellerine olan ihtiyacı azaltan in vitro ve in vivo çalışmalara bilgi vererek yeni radyofarmasötiklerin daha hızlı belirlenmesini ve daha uygun maliyetli tasarımını kolaylaştırabilir. Nükleer tıpta kanser, koroner arter hastalıkları, tiroid bozuklukları, osteomiyelit başta olmak üzere birçok hastalığın görüntüleme, tanı ve teşhisinde radyonüklidler ile etiketlenmiş radyofarmasötikler kullanılmaktadır. Kimyasal özellikleri, yarı ömürleri, bozunma türleri ve yaydıkları fotonlara göre değişiklikler gösteren radyonüklidler arasındaki Teknesyum (99mTc) çeşitli avantajlarından dolayı görüntülemede sıklıkla kullanılmaktadır. Bu tez çalışmasında, belirlenen hedef protein üzerinden in siliko çalışmalar gerçekleştirilmiştir. Buna göre, öncelikle Discovery Studio yardımıyla onaylı ilacın farmakofor modeli oluşturularak çeşitli veri tabanlarından farmakofor- ve yapı-esaslı sanal taramalar gerçekleştirilmiştir. Hedef protein DPP-4 ve seçilen ligandlar arasında yüksek bağlanma enerjili aday ilaçların belirlenmesi için Glide/SP yöntemi kullanılarak moleküler yerleştirme çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sonuçlara göre ilaçların 99mTc ile bağlanma potansiyelleri değerlendirilmiştir. Sefaleksin, İvabradin, Sitagliptin, Gambojik asit, 8PN, Val-Cit-PAB-Eksatekan ve Abareliks'in 99mTc ile radyoetiketleme çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Metformin ve Famotidin'in önceki çalışmalarda 99mTc ile radyoetiketlemeleri yapıldığı için kontrol amaçlı kullanılmıştır. Radyoetiketleme ince tabaka kromatografisi (İTK) ile hareketli faz yardımıyla takip edilmiştir. Ayrıca in siliko sanal taramalar sonucu belirlenen Sefaleksin, Ramipril, Mebendazol ilaçlarının ve ayrıca çalışılan Gambojik asit, 8PN doğal ürünlerinin ve Val-Cit-PAB-Eksatekan ile Abareliks peptitlerinin MCF7, BT-20 ve MDA-MB-231 kanser hücre hatlarında in vitro sitotoksik etkileri değerlendirilmiştir. Radyoimmünoterapi için monoklonal antikor Tusamitamab ile mAb-Famotidin ve mAb-Doksorubisin konjugatları elde edilerek UV spektrumları elde edilmiştir. Sonuç olarak, farklı hastalıkların tedavisinde kullanılan ilaçların potansiyel radyofarmasötikler olarak ikincil etkileri değerlendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
In silico approaches can predict outcomes for critical variables that are particularly challenging in traditional in vitro and in vivo radiopharmaceutical development methods, as well as the target-binding properties of a compound. Therefore, the integration of in silico methods can inform in vitro and in vivo studies, reducing the need for animal models to evaluate lead compounds, thereby facilitating the faster identification and more cost-effective design of novel radiopharmaceuticals. In nuclear medicine, radiopharmaceuticals labeled with radionuclides are used for imaging, diagnosis, and detection of various diseases, including cancer, coronary artery diseases, thyroid disorders, and osteomyelitis. Among radionuclides, which differ in terms of their chemical properties, half-lives, types of decay, and the photons they emit, technetium-99m (99mTc) is frequently used in imaging due to its various advantages. In this thesis study, in silico analyses were conducted based on a selected target protein. Accordingly, a pharmacophore model of an approved drug was created using Discovery Studio, followed by pharmacophore-based virtual screening and structure-based virtual screenings using various databases. To identify candidate drugs with high binding affinities between the target protein DPP-4 and selected ligands, molecular docking studies were performed using the Glide/SP method. Based on the obtained results, the binding potentials of drugs with high binding energies to 99mTc were evaluated and radiolabeling studies with 99mTc were carried out for Cephalexin, Ivabradine, Sitagliptin, Gambogic acid, 8PN, Val-Cit-PAB-Exatecan, and Abarelix. Metformin and Famotidine, which were previously radiolabeled with technetium in earlier studies, were used as controls. Radiolabeling was monitored by instant thin-layer chromatography (ITLC) using a mobile phase. Additionally, the in vitro cytotoxic effects of Sitagliptin, Cephalexin, Ramipril, Mebendazole, Gambogic acid, and 8PN natural products and Val-Cit-PAB-Exatecan and Abarelix peptides identified through in silico virtual screening were evaluated on MCF7, BT-20, and MDA-MB-231 cancer cell lines. The conjugates of mAb-Famotidine and mAb-Doxorubicin were obtained with monoclonal antibody Tusamitamab for radioimmunotherapy, and their UV spectra were obtained. In conclusion, the secondary effects of drugs used in the treatment of various diseases were evaluated as potential radiopharmaceutical candidates.
Benzer Tezler
- Palpabl ve nonpalpabl meme kitlelerinin araştırılmasında Tc 99m tetrofosmin sintimammografinin mammografi, ultrasonografi ve histopatoloji bulgularıyla karşılaştırmalı değeri
Başlık çevirisi yok
İNANÇ KARAPOLAT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
Radyoloji ve Nükleer TıpEge ÜniversitesiNükleer Tıp Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ARGON
- Synthesis of folate receptor 1 targeted dye-conjugated peptides for use in positron emission tomography imaging systems
Pozitron emisyon tomografi görüntüleme sistemlerinde kullanılacak folate receptör 1 hedefli boya takılı peptitlerin sentezi
DERYA CİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ
- Prostat kanserinde eksozomal miRNA moleküllerinin araştırılması
Investigation of exosomal miRNA molecules in prostate cancer
DİLRÜBA BEYZA DEMİREL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Onkolojiİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞEREF BUĞRA TUNÇER
- Anjiogenezis etkili faktörlerin karbonik anhidraz IX Gen ekspresyonuna etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects angiogenesis related factors on carbonic anhydrase IX Gene expression
AYLA SOLMAZ AVCIKURT
- Nanoparticle enabled diagnosis and combination therapy of cancer
Nanoparçacık destekli kanser tanı ve kombine tedavi araştırmaları
EDA ÇELİKBAŞ