Functional Implications of the Knops Blood Group Polymorphisms on Complement Receptor 1 Binding
Knops Kan Grubu Polimorfizmlerinin Kompleman Reseptör 1'in Baglanmasina Fonksiyonel Etkileri
- Tez No: 965603
- Danışmanlar: PROF. DR. ALEXANDRA ROWE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Allerji ve İmmünoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Allergy and Immunology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: The Unıversıty Of Edınburgh
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Son yıllarda sıtma nedeniyle ölümlerde azalma görülse de, özellikle Sahra Altı Afrika'daki küçük çocuklar için hastalık hâlâ ciddi bir sorun olmaya devam etmektedir. DSÖ'nün 2018 raporuna göre, 2017'de 219 milyon sıtma vakası ve yaklaşık yarım milyon ölüm kaydedilmiştir. Plasmodium falciparum'un insanları nasıl enfekte ettiği ve sıtma belirtilerine yol açtığı konusunda ilerleme kaydedilse de, neden bazı insanların ağır hastalık geçirdiği, bazılarının geçirmediği hâlâ bilinmemektedir. İnsan genomundaki bazı mutasyonların ağır sıtmaya karşı koruyucu olabileceği düşünülmektedir. 5500 Kenyalı çocuk üzerinde yapılan bir çalışmada, CR1 (Complement Receptor 1) genindeki Sl2 mutasyonunun beyin sıtmasına ve ağır sıtmadan ölüme karşı koruyucu olabileceği, buna yakın bir başka mutasyon olan McCb'nin ise ters etki gösterebileceği bulunmuştur. CR1 proteini, bağışıklık sisteminin sıtmaya yanıtında önemli rol oynar; Mannoz Bağlayıcı Lektin (MBL) ve C1q gibi moleküllere bağlanarak etki gösterir. Bu çalışmada, CR1'in Sl2 ve McCb mutasyonlarının MBL ve C1q'a bağlanma gücünü değiştirip değiştirmediği araştırılmıştır. Bunun için CR1 geninin farklı mutasyonlar içeren DNA parçaları bakterilere ve insan böbrek hücrelerine aktarılmış, böylece mutasyonlu CR1 proteinleri üretilmiş ve saflaştırılmıştır. Daha sonra bu proteinlerin MBL ve C1q'a bağlanma özellikleri Yüzey Plazmon Rezonansı (SPR) yöntemiyle test edilmiştir. Ancak beklenildiği gibi bir bağlanma gözlemlenmemiştir. Kırmızı kan hücreleriyle yapılan ek deneylerde de C1q ile yalnızca çok zayıf bir bağlanma saptanmıştır. Sonuç olarak, beyin sıtmasıyla ilişkili mutasyonlara sahip CR1 proteinleri başarıyla üretilmiştir. Ancak bu mutasyonların CR1'in MBL veya C1q ile bağlanmasını etkilediğine dair kanıt bulunmamıştır. Hatta CR1'in MBL ve C1q ile bağlanıp bağlanmadığına dair mevcut bilgiler de sorgulanmıştır. Bu nedenle konunun aydınlatılması için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
II. Lay Summary Although recent studies show a decrease in deaths due to malaria, the disease remains a critical problem particularly for young children in Sub-Saharan Africa. According to World Health Organization 2018 Malaria report, in 2017 there were 219 million malaria cases and almost half a million people died. Progress has been made in working out how Plasmodium falciparum (the malaria parasite) infects people and causes the symptoms of malaria. However, we still don't know why some people get severe disease and others don't. One clue is the human genome (the personal instructions that everyone carries in each of their cells), which has developed its own defence mechanisms against malaria. Some people carry mutations or“typos”in their genes which seem to protect them against severe malaria. Examining what these mutations do may help to shed light on the underlying mechanisms of the disease and might help lead to develop new anti-malarial drugs or vaccines. A recent study of 5500 Kenyan children showed that one mutation called Sl2 in Complement Receptor 1 (CR1) may protect against cerebral malaria (severe malaria in the brain) and death from severe malaria, while another nearby mutation called is McCb seems to have the opposite effects. CR1 is a protein which is important in how the immune system responds to infections including malaria. It does this by binding (sticking to) a number of different molecules which include Mannose Binding Lectin (MBL) and C1q. I wanted to test whether the Sl2 and McCb mutations in CR1 may be changing how strongly it sticks to MBL and C1q which might influence the immune system response and affect the risk of malaria. To test this idea, I decided to produce some CR1 proteins, which contained the Sl2 and McCb polymorphisms and see how strongly they stuck to MBL and C1q. Firstly, I took a short piece of genetic code (DNA) which contained the recipe for CR1 and inserted it into a plasmid (a tiny factory found inside bacteria that can make proteins). I used different pieces of DNA which each had different mutations on them. I then transferred these pieces of DNA into new, bigger plasmids using enzymes (molecular scissors) to cut them out and stitch them back in. I put these new plasmids into bacteria which acted like photocopiers to make lots more plasmids. I then transferred these new plasmids into cells that originally came from human kidneys to make my final proteins. This was important because producing these proteins in human cells makes the protein as close to a human one as possible. These cells then produced the proteins with the different mutations. I then checked them for any contamination with bacteria and purified them. After this, I investigated the mutant proteins to see how strongly they stuck to MBL and C1q proteins by using a technique called Surface Plasmon Resonance. This allows us to see how strongly the proteins and the MBL or C1q bind to each-other in real-time. After many experiments, I could not see any binding between these proteins, however I also did not see any binding between normal CR1 protein and MBL or C1q, which I would have expected. Therefore, I decided to look for myself whether CR1 could stick to MBL or C1q using a different approach. Erythrocytes have lots of CR1 on their surfaces and I found that they could only stick very weakly to C1q. To sum up, I have successfully made CR1 proteins which contain mutations that are linked with cerebral malaria. From my experiments, it does not seem likely that this link is due the mutations affecting how MBL or C1q bind to CR1. However, my study has also called into question whether CR1 binds to MBL and C1q at all, as we had previously thought. We will need to do further work to look into this.
Benzer Tezler
- 1,3-difenil-4,5-bis(hidroksiimino)-imidazolidin ve Ni(II), Cu(II), Pd(II), UO2(VI) komplekslerinin sentezi
Başlık çevirisi yok
VEFA AHSEN
Doktora
Türkçe
1984
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZER BEKAROĞLU
- Çoklu amaçların çözümlemesinde amaç programlaması ile genelleştirilmiş ters yaklaşımı ve yem sanayiinde bir uygulama
Goal programming and generalieed inverse approaches in the multi-objective analysis and application in feed industry
HASAN BAL
- İki aşamalı en küçük kareler yöntemi üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
SEMRA AKSAKAL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolEge ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞABAN EREN