Geri Dön

Samsun bölgesinde tüketime sunulan balıklarda beta-laktamaz dirençli escherıchıa colı'nin fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi

Identification of beta-lactamase resistant escherichia coli in fish consumed in samsun region by phenotypic and genotypic methods

PDF İndir

  1. Tez No: 966169
  2. Yazar: MEHMET FURKAN ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BELGİN SIRIKEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Su Ürünleri, Veteriner Hekimliği, Aquatic Products, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Hastalıkları Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 76

Özet

Samsun bölgesinde 2024-2025 yıllarında tüketime sunulan 56 adet kültür balıklardan Harlequin® E. coli/Coliform Agar selektif besiyerinde izole edilen ve MALDI-TOFF-MS ile doğrulanan toplam 34 adet E. coli izolatı materyal olarak kullanıldı. İzolatlar 11 antibiyotik grubundan 22 adet antibiyotiğe karşı analiz edildi. Yedi farklı gruptan 11 antibiyotiğe karşı %50,00- %5,88 oranında direnç saptandı. En yüksek dirençliliğin penislin grubu antibiyotiklere [SAM (%50,00), AM (%47,05), AMC'ye (%32,35)], bu grubu karbapenem [ETP (%11,76)], tetrasiklin [(%11,76)], kinolon [%5,88], florokinolon [CIP (%5,88), LEV'e (%5,88)] grubu ile sefalosporin [2'si FEP'e (%5,88)], amfenikol [2'si C'ye (%5,88)] ve fosfomisin [2'si FF (%5,88)] grupları takip etti. İzolatlar Çoklu antibiyotik dirençliliği (ÇAD) yönünden değerlendirildiğinde; 34 izolattan 4 (%11,76)'ünün ÇAD olduğu ve 3-8 farklı antibiyotiğe ve penisilin, sefalosporin, tetrasiklin, kinolon, florokinolon, amfenikol grubuna karşı dirençli olduğu saptandı. İzolatlar GSBL-E. coli yönünden çift disk difüzyon testi ile fenotipik olarak saptanamazken, 3 bla genlerinden blaTEM %91,18, blaSHV %58,82 ve blaCTX-M ise %23,53 oranlarında saptandı. Karbapenem dirençliliği fenotipik ve genotipik olarak saptandı. Bu çerçevede, blaNDM, VIM, KPC, IMP ve OXA-48 olmak üzere toplam 5 gen varlığı araştırıldı: NDM ve KPC gen varlıkları saptanamazken, IMP 5 (%14,71), OXA-48 ve VIM genleri 4'er (%11,76) izolatta saptandı. Toplamda ise 5 karbapenemaz üretiminden sorumlu genlerden en az biri 13 (%38,23) E. coli izolatında saptandı. Antibiyogramda izolatların IMP ve ETP'ye karşı duyarlı olduğu, 4 (%11,76) izolatın ise MEM'e karşı dirençli bulunurken MİK testinde bir (%2,94), MHT testinde 4 (%11,8) izolat karbapenem dirençli idi. İzolatların AMP-C ß-laktamaz genlerinden toplam 6 farklı gen grubu da araştırıldı ve sadece iki izolatta hem LAT-1'den LAT-4'e kadar, CMY-2'den CMY-7'ye kadar (n=2, %5,88), BIL-1 ile DHA-1 ve DHA-2 (n=2, %5,88) genleri saptandı. Her iki izolat aynı zamanda blaTEM genini de taşıması nedeniyle GSBL ve AMP-C-E. coli oluşları tehlikenin boyutunu artırmaktadır. Ayrıca, filogenetik gruplandırmada B23, A1, Ao ve D2 filogrupları sırasıyla 25 (%73,53), 5 (%14,71), 2 (%5,88) ve 1(1, %2,94) izolatta belirlendi. İzolatlar Sanger dizi analiz sonuçları ile de doğrulandı.

Özet (Çeviri)

A total 34 E. coli isolates isolated on Harlequin® E. coli/Coliform Agar and confirmed by MALDI-TOFF-MS from 56 cultured fish, Samsun region in 2024-2025 were used as material. The isolates were analyzed against 22 antibiotics from 11 antibiotic groups. Resistance rates of 50.00% - 5.88% were found against 11 antibiotics from seven different groups. The highest resistance was penicillin [SAM (50.00%), AM (47.05%), AMC (32.35%], followed by carbapenem [ETP (11.76%)], tetracycline [11.76%], quinolone [5.88%, fluoroquinolone [CIP (5.88%), LEV (5.88%)], cephalosporin [FEP (5.88%)], amphenicol [2(5.88%)] and fosfomycin [5.88%)] groups followed. When the isolates were evaluated in terms of MDR, 11.76% of 34 isolates were found MDR and resistant to 3-8 different antibiotics and penicillin, cephalosporin, tetracycline, quinolone, fluoroquinolone, and amphenicol group. While the isolates could not be phenotypically detected by DDDT as ESBL-E. coli, blaTEM, blaSHV and blaCTM were detected at 91.18%, 58.82% and 23.53% rates, respectively. Carbapenem resistance was detected phenotypically and genotypically. In this framework, a total of 5 genes, namely NDM, VIM, KPC, IMP and OXA-48, were investigated: in contrast to NDM and KPC, IMP was detected in 5 (14.71%), OXA-48 and VIM genes were detected in 4 (11.76%) isolates. In total, at least one of the 5 carbapenemase production genes was detected in 13 (38.23%) isolates. In the antibiogram, the isolates were susceptible to IMP and ETP, 4 (11.76%) isolates were resistant to MEM, 2.94% of the isolates were carbapenem resistant in MIC and 11.8% of the isolates were carbapenem resistant in MHT test. A total of 6 different genes were also investigated as AMP-C ß-lactamase; only two isolates had both LAT-1 to LAT-4, CMY-2 to CMY-7 (n=2, 5.88%), BIL-1 and DHA-1 and DHA-2 (n=2, 5.88%) genes. Since both isolates also carried the blaTEM gene, their ESBL and AMP-C-E. coli status increases the extent of the danger. In the phylogenetic classification, the isolates were distributed as follows: B23 (n=25,73.53%), A1 (n=5; 14.71%), Ao (n=2; 5,88%) isolates), and D2 (n=1; %2.94) isolate, belonging to phylogenetic group D). The classification of the isolates was further confirmed by Sanger sequencing analysis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    192498

    Marmara bölgesi askeri birliklerinde tüketime sunulan süt ve süt ürünlerinde aflatoksin M1 düzeylerinin belirlenmesi

    Determination of aflatoxin M1 levels in milk and dairy products, that presented to consumption in military unit of Marmara region

    ENDER ÖZBEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. BELGİN SIRIKEN

  2. Tez No

    212026

    Ordu-Samsun bölgesi hidroelektrik enerji potansiyel analizi

    The analysis of hydroelectric potential in Ordu-Samsun region

    OĞUZHAN YAVUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    İnşaat MühendisliğiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HIZIR ÖNSOY

  3. Tez No

    11181

    Samsun il merkezi ile Tekkeköy çevresinde havada bulunan kükürt dioksit (SO2), amonyak (NH3) ve duman konsantrasyonlarının meteorolojik faktörlerle ilişkisinin araştırılması

    An Investigation of the relationships between sulfur dioxide (SO2), ammonia (NH3) and smoke concentrations and meteorological factors in the centre of Samsun and around Tekkeköy

    ŞÜKRÜ DURSUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1988

    Çevre MühendisliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. OSMAN NURİ ERGUN

  4. Tez No

    299220

    Orta Karadeniz bölgesinde doğal olarak yetişen Bituminaria bituminosa L. (Syn. Psoralea bituminosa L.) bitkisinin tanımlanması ve tarımsal özelliklerinin araştırılması

    Characterization and determination of agricultural characteristics of Bituminaria bituminosa L. (Syn. Psoralea bituminosa L.) genotypes naturally grown at The Central Black Sea region

    ERDEM GÜLÜMSER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİ ACAR

  5. Tez No

    361373

    Samsun bölgesi ilköğretim çağı çocuklarında üriner sistem taş hastalığı prevalansı ve beslenme alışkanlığı ilişkisinin değerlendirilmesi

    The prevalance of Urinary stone disease in school age children

    CİHAN YALMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    ÜrolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. ENDER ÖZDEN

Geri Dön