Geri Dön

SH-SY5Y hücre hattının 3D modelinde circRNA-miRNA süngerindeki genlerinin Achyrofuran ile hedeflenmesi

Targeting genes within the circRNA-miRNA sponge network using Achyrofuran in a 3D model of SH- SY5Y cells

PDF İndir

  1. Tez No: 969013
  2. Yazar: MERVE BOZKURT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SIRMA GEYİK
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Nöroloji, Neurology
  6. Anahtar Kelimeler: Achyrofuran, Alzheimer hastalığı, SH-SY5Y hücreler, Achyrofuran, Alzheimer's disease, SH-SY5Y cells
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Nöroloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Bu çalışmada, Alzheimer hastalığında miRNA ve circRNA'ların tanı ve tedavi potansiyeli incelenmiştir. Achyrofuran'ın Aβ ve tau proteinlerini hedefleyen circRNA–miRNA etkileşimlerine etkisi değerlendirilmiş; bu etkileşimlerin gen ekspresyonu ile apoptoz, otofaji ve mitofaji süreçlerindeki rolleri araştırılmıştır. Gereç ve Yöntem: Achyrofuranın Alzheimer ile ilişkili moleküler mekanizmalarını incelemek amacıyla SH-SY5Y hücre hattı kullanıldı. Hücreler, retinoik asit, BDNF ve db-cAMP içeren 18 günlük protokol ile nöron-benzeri fenotipe farklılaştırılmıştır. Deneysel toksisite ve tau modelleri Aβ oligomerleri ve okadaik asit ile oluşturuldu. Achyrofuran 0.07 μg/ml dozunda uygulanarak etkileri değerlendirildi. Hücre canlılığı ve proliferasyonu Trypan Blue, CCK-8 ve MTT testleriyle; apoptoz, otofaji ve mitofaji ELISA tabanlı kitlerle incelendi. Gen, miRNA ve circRNA ekspresyonları qRT-PCR; hücre morfolojisi faz kontrast mikroskopi; Tau ve Aβ proteinleri ise immünositokimya ile analiz edilmiştir. Veriler SPSS 11.0 ile değerlendirilmiş, p<0.05 anlamlı kabul edilmiştir. Bulgular: SH-SY5Y hücreleri, 18 günlük protokol sonunda nöron-benzeri morfoloji geliştirmiştir. Achyrofuran tedavisi hücre canlılığını azaltırken apoptozu artırmıştır. BECN1 ve LC3-II artışı ile p62 azalması otofaji aktivasyonunu göstermiştir. CYCS, CASP3 ve CASP9 gen ekspresyonları yükselirken bunları hedefleyen miRNA'lar baskılanmış, ilgili circRNA'lar ise artış göstermiştir. Mitofaji yolunda PINK1 yükselmiş, LRRK2 azalmış, PARK2'de ise anlamlı değişiklik gözlenmemiştir. İmmünohistokimya, Aβ agregasyonunun azaldığını ancak tau proteininin yanlış lokalizasyonunun sürdüğünü ortaya koymuştur. Bulgular, Achyrofuran'ın otofaji ve mitofaji aracılığıyla nöroprotektif etki gösterebileceğini, ancak apoptoz artışı ve tau patolojisinin bu etkiyi sınırladığını ortaya koymaktadır. Sonuç: Bu çalışma, Achyrofuran'ın SH-SY5Y hücrelerinde otofaji, apoptoz ve mitofajiyi düzenlediğini göstermiştir. Aβ birikimini azaltmasına karşın artan apoptoz ve sınırlı mitofaji etkisini kısıtlamıştır. Bulgular, uygun doz ve kombinasyonların gelecekte araştırılmasını önermektedir

Özet (Çeviri)

Aim: In this study, the diagnostic and therapeutic potential of miRNAs and circRNAs in Alzheimer's disease was investigated. The effect of Achyrofuran on circRNA–miRNA interactions targeting Aβ and tau proteins was evaluated, and their roles in gene expression as well as in apoptosis, autophagy, and mitophagy were investigated. Methods: The SH-SY5Y cell line was employed to investigate the molecular mechanisms of Alzheimer's disease associated with Achyrofuran. The cells were differentiated into a neuron-like phenotype through an 18-day protocol involving retinoic acid, BDNF, and db-cAMP. Experimental toxicity and tau models were induced using Aβ oligomers and okadaic acid. Achyrofuran was administered at a dose of 0.07 μg/ml to evaluate its effects. Cell viability and proliferation were assessed using Trypan Blue, CCK-8, and MTT assays, while apoptosis, autophagy, and mitophagy were analyzed with ELISA-based kits. Gene, miRNA, and circRNA expressions were analyzed by qRT-PCR; cell morphology by phase-contrast microscopy; and Tau and Aβ proteins by immunocytochemistry. Data were analyzed using SPSS 11.0, with p<0.05 considered statistically significant. Results: SH-SY5Y cells developed a neuron-like morphology at the end of the 18- day protocol.Achyrofuran treatment reduced cell viability while increasing apoptosis.An increase in BECN1 and LC3-II accompanied by a decrease in p62 indicated autophagy activation.CYCS, CASP3, and CASP9 gene expressions were upregulated, while their targeting miRNAs were suppressed and the corresponding circRNAs were increased.In the mitophagy pathway, PINK1 was upregulated, LRRK2 was downregulated, while no significant change was observed in PARK2.Immunocytochemistry revealed a reduction in Aβ aggregation but persistent mislocalization of tau protein.The findings suggest that Achyrofuran may exert neuroprotective effects through autophagy and mitophagy; however, increased apoptosis and tau pathology limit this effect. Conclusion: This study demonstrated that Achyrofuran modulates autophagy, apoptosis, and mitophagy in SH-SY5Y cells. Although it reduced Aβ accumulation, increased apoptosis and limited mitophagy constrained its effect. The findings suggest that appropriate dosing and combination strategies should be explored in future studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    974321

    2D and 3D in vitro Alzheimer's disease model

    2D ve 3D in vitro Alzheimer hastalığı modeli

    DİLARA SABIRTAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyomühendislikManisa Celal Bayar Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞEYMA TAŞDEMİR

  2. Tez No

    661904

    Creating a 3D neuronal-culture using alginate and collagen hydrogels optimal for neuronal survival and axon growth

    Aljinat ve kolajen hidrojeli ile 3B hücre kültürünün nöronal sağkalım ve akson uzaması için optimizasyonu

    BAŞAK DALBAYRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyomühendislikBoğaziçi Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAİME HALE SAYBAŞILI

    PROF. DR. IŞIL KURNAZ

  3. Tez No

    895593

    SH-SY5Y nöroblastom hücre hattının farklılaştırılmasında HN1'in etkisi

    HN1's effect in SH-SY5Y neuroblastoma cell line differentiation

    TİLBE ÖZAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ

  4. Tez No

    444641

    Fipronilin nöroblastom SH-SY5Y hücre hattında sitotoksik etkisinin araştırılması

    Investigation of the cytotoxic effect of fipronil on neuroblastoma SH-SY5Y cell line

    ÖZGE NUR KANAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLDENİZ SELMANOĞLU

  5. Tez No

    846877

    Uyarılmış adipoz doku kaynaklı mezenkimal kök hücrelerden elde edilen eksozomların Alzheimer modeli oluşturulmuş SH-SY5Y insan nöroblastoma hücre hattı ve Aβ degradasyonu üzerindeki etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the effects of exosomes from stimulated adipose tissue-derived mesenchymal stem cells on Alzheimer's modeled SH-SY5Y human neuroblastoma cell line and Aβ degradation

    MERZET AYDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Kök Hücre ve Doku Yenilenmesi Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLÇİN GACAR

Geri Dön