Fish yöntemi ile belirlenen FIP1-L1 /PDGFRA gen rearanjmanlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of FIP1-L1/PDGFRA gene rearrangements determined by fish method
- Tez No: 969981
- Danışmanlar: PROF. DR. YUSUF ÖZKUL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: FIP1L1-PDGFRA, FISH, Hipereozinofilik Sendrom, Kronik Eozinofilik Lösemi, İmatinib, FIP1L1-PDGFRA, FISH, Hypereosinophilic Syndrome, Chronic Eosinophilic Leukemia, Imatinib
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Gevher Nesibe Genom ve Kök Hücre Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hematolojik maligniteler, kemik iliği ve periferik kan hücrelerinin kontrolsüz çoğalması, farklılaşma bozuklukları ve genetik/moleküler anormalliklerle karakterize edilen heterojen bir hastalık grubudur. Son yıllarda moleküler sitogenetik ve genetik analiz tekniklerindeki hızlı gelişmeler, bu hastalıkların tanı, sınıflandırma ve tedavi süreçlerine önemli katkılar sağlamıştır. Özellikle kromozomal translokasyonlar, delesyonlar ve füzyon genleri, hematolojik malignitelerin patogenezinde kritik rol oynamaktadır. Bu bağlamda, FIP1L1-PDGFRA gen rearanjmanı, özellikle Hipereozinofilik Sendrom (HES) ve Kronik Eozinofilik Lösemi (CEL) olgularında klinik açıdan büyük önem taşımaktadır. Bu tez çalışmasının amacı, Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Hematoloji Kliniği'nde 2017–2023 yılları arasında tanı almış 175 hastada FIP1L1-PDGFRA gen füzyonlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi, pozitiflik oranının belirlenmesi, hematolojik parametrelerle ilişkilerinin incelenmesi ve tedavi yanıtlarının literatürle karşılaştırılmasıdır. Çalışmada, hasta verileri elektronik kayıt sisteminden elde edilmiş; yaş, cinsiyet, klinik tanı, hemogram parametreleri (lökosit, eozinofil, hemoglobin, trombosit), karyotip analiz sonuçları ve FISH testi bulguları kaydedilmiştir. Çalışmamızda, 175 hastanın 25'inde (%14,3) FIP1L1-PDGFRA gen füzyonu saptanmıştır. Pozitif hastalarda lökosit ve eozinofil sayıları anlamlı şekilde yüksek bulunurken (p<0,001), hemoglobin ve trombosit düzeylerinde anlamlı fark izlenmemiştir. Karyotip analizi yalnızca üç hastada anormal sonuç vermiş, geri kalan pozitif olgularda ise normal karyotip gözlenmiştir. Bu durum, kriptik delesyonların klasik sitogenetikle saptanamayacağını ve FISH yönteminin bu tür moleküler anomalilerde altın standart olduğunu göstermektedir. Tedavi alan FIP1L1-PDGFRA pozitif 12 hastanın 11'inde (%91,6) imatinib tedavisine hematolojik tam yanıt alınmıştır. Bu oran, uluslararası literatür ile uyumludur. Bulgularımız, erken moleküler tanının klinik önemini ve hedefe yönelik tedavi stratejilerinin hastaların prognozunu belirgin şekilde iyileştirdiğini ortaya koymaktadır. Bu tez, Türkiye'de FIP1L1-PDGFRA gen füzyonlarının retrospektif olarak incelendiği en güncel çalışmalardan biri olup hem tanısal yaklaşım hem de tedavi planlaması açısından klinik ve bilimsel katkı sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Hematological malignancies are a heterogeneous group of disorders characterized by uncontrolled proliferation of bone marrow and peripheral blood cells, differentiation defects, and genetic/molecular abnormalities. In recent years, rapid advancements in molecular cytogenetic and genetic analysis techniques have significantly contributed to the diagnosis, classification, and treatment processes of these diseases. Chromosomal translocations, deletions, and fusion genes play a critical role in the pathogenesis of hematological malignancies. In this context, the FIP1L1-PDGFRA gene rearrangement holds substantial clinical importance, particularly in cases of Hypereosinophilic Syndrome (HES) and Chronic Eosinophilic Leukemia (CEL). The aim of this thesis was to retrospectively evaluate FIP1L1-PDGFRA gene fusions in 175 patients diagnosed between 2017 and 2023 at the Hematology Clinic of Erciyes University Faculty of Medicine, to determine the positivity rate, examine their association with hematological parameters, and compare treatment responses with the literature. Patient data were obtained from the electronic medical record system, including age, sex, clinical diagnosis, complete blood count parameters (leukocyte, eosinophil, hemoglobin, platelet), karyotype analysis results, and FISH test findings. In our study, the FIP1L1-PDGFRA gene fusion was detected in 25 of 175 patients (14,3%). Leukocyte and eosinophil counts were significantly higher in positive patients (p<0.001), whereas hemoglobin and platelet levels showed no significant differences. Karyotype analysis revealed abnormalities in only three patients, while the remaining positive cases exhibited a normal karyotype. These findings demonstrate that cryptic deletions cannot be detected by conventional cytogenetics and that the FISH method serves as the gold standard for identifying such molecular anomalies. Among the FIP1L1-PDGFRA-positive patients who received treatment, 11 of 12 (91,6%) achieved a complete hematological response to imatinib therapy. This rate is consistent with international literature. Our findings highlight the clinical importance of early molecular diagnosis and show that targeted therapeutic strategies can significantly improve patient prognosis. This thesis represents one of the most recent studies in Türkiye to retrospectively examine FIP1L1-PDGFRA gene fusions and provides valuable contributions to both diagnostic approaches and treatment planning from clinical and scientific perspectives.
Benzer Tezler
- Konvansiyonel yöntemle sonuç alınamayan veya normal karyotip gözlenen akut lenfoblastik lösemi olgularının fısh yöntemi ile retrospektif incelenmesi
Retrospective investigation of acute lymphoblastic leukemia cases with no conventional results or normal karyotype by fish method
BENGİSU GÖKKAYA
- Fetal foku interfaz nükleuslarında 13, 18, 21, X ve Y kromozom anöploidilerinin fluoresan in situ hibridizasyon yöntemi ile araştırılması
Detection of numerical aberrations of chromosomes 13, 18, 21, X and Y in interphase nucleus of fetal tissues by fluorescence in situ hybridization
GÜLLEYLA KILIÇ
- CD30 eksprese eden kutanöz T hücreli lenfoma olgularında FISH ve immünhistokimyasal yöntemlerle IRF4 geninde yeniden düzenlenme ve protein ekspresyonunun araştırılması
The investigation of IRF4 gene rearrangement and protein expression of CD30+ cutaneous T cell lymphomas with FISH and immunohistochemical methods
TUĞÇE ESEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Patolojiİstanbul ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CUYAN DEMİRKESEN
- FISH ve standart mikrobiyolojik yöntemlerle gıda ve sulardaki önemli bakterilerin belirlenmesi
Determination of important bacteria in food and water by FISH and standard microbiological methods
BURCU İŞMAN ÇOKAY
Doktora
Türkçe
2011
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL BIYIK
- Kronik lenfositik lösemi hastalarında FCRL gen ailesi ekspresyon seviyelerinin ıgvh mutasyonu ile karşılaştırılması ve prognoza etkisinin araştırılması
Comparison of FCRL gene family expression levels with igvh mutation in chronic lymphocytic leukemia patients and investigation of its effect on prognosis
KÜBRA GÜNDÜZ
Doktora
Türkçe
2024
Tıbbi BiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENDER MEHMET ÇOŞKUNPINAR