Geri Dön

Sorgum (Sorghum bicolor) SnRK2 gen ailesinin soğuk stresi altındakitranskriptomik yanıtlarının biyoinformatik analizi

Bioinformatic analysis of the transcriptomic responses of the SnRK2 gene family to cold stress in sorghum (Sorghum bicolor)

PDF İndir

  1. Tez No: 983662
  2. Yazar: SERHAD BÜYÜKYILDIZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FIRAT KURT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Muş Alparslan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, Sorghum bicolor bitkisinde SnRK2 gen ailesine ait SORBI_3002G379400 geninin Ağırlıklandırılmış Koekspresyon Ağı (AGKA) Analizi yoluyla moleküler ağlar içindeki rolü ve etkileşimlerinin belirlenmesini hedeflenmiştir. AGKA sonuçlarına göre, SnRK2 ile yüksek korelasyon gösteren 23 gen çifti belirlenmiş ve bu genlerin transkripsiyonel düzenleme, membran taşınımı, protein fosforilasyonu, translasyonel kontrol ve redoks homeostazı gibi temel biyolojik süreçlerle ilişkili olduğu ortaya konmuştur. SnRK2'nin ağ içindeki merkezi konumu, onu abiyotik stres yanıtlarında kilit bir düzenleyici haline getirmektedir. Etkileşim gösteren genler arasında AMPK homologları, ferredoksinle ilişkili elektron taşıma genleri, iyon kanalları ve ribozomal protein genleri yer almakta, bu da SnRK2'nin stres sinyallemesinde çok katmanlı bir rol üstlendiğini göstermektedir. Literatürle desteklenen bu bulgular, SnRK2'nin sadece ABA sinyali ile sınırlı kalmayıp enerji dengesi, çeviri, redoks ve iyon yanıtları gibi hayati süreçlerde de aktif olduğunu göstermektedir. Gelecekteki deneysel doğrulama çalışmaları, bu genlerin fonksiyonlarını daha ayrıntılı ortaya koyacak ve SnRK2 merkezli ağ yapısının biyolojik önemini derinleştirecektir

Özet (Çeviri)

In this study, the aim is to determine the role and interactions of the SORBI_3002G379400 (or SORBI_3002G379400) gene, which belongs to the SnRK2 gene family in Sorghum bicolor, within molecular networks through Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA). Using WGCNA, 23 highly correlated gene pairs were identified, highlighting the strong transcriptional coordination between SnRK2 and other genes involved in key biological processes such as transcriptional regulation, membrane transport, protein phosphorylation, translational control, and redox homeostasis. The central position of SnRK2 within the network suggests that it plays a pivotal regulatory role in abiotic stress responses. Among the interacting genes are AMPK homologs, ferredoxin-related electron transport genes, ion channels, and ribosomal protein genes, indicating a multi-layered involvement of SnRK2 in stress signaling. These results, supported by existing literature, demonstrate that SnRK2 functions not only in ABA signaling but also in broader cellular pathways including energy balance, translation, redox regulation, and ionic responses. Future experimental validations will be crucial to elucidate the functional roles of these genes and to explore the full regulatory potential of the SnRK2-centered co-expression network.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    47743

    Sorgum (sorghum bicolor (l.) moench)'da ekim zamanı ve bitki sıklığının verim öğelerine etkisi

    Effect of sowing time and plant density on yield components of sorghum

    N.FUNDA KÖKSOY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    DOÇ.DR. YAVUZ EMEKLİER

  2. Tez No

    300242

    Sorgum (Sorghum bicolor L. Moench) bitkisinde şeker miktarı ile ilişkili kantitatif karakter lokuslarının (QTL) haritalanması

    Mapping of quantitative trait loci (QTLs) related to sugar content in sorghum (Sorghum bicolor L. Moench)

    HAMDULLAH KORHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyomühendislikKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. YÜKSEL BÖLEK

  3. Tez No

    433046

    Sorgum (Sorghum bicolor (L.) moench) koleksiyonunda Sorgum afitine (Melanaphis sacchari (Zehntner)) dayanıklılık ve uzun boy karakterlerinin moleküler markerler yardımıyla belirlenmesi

    Identification of resistance against Sorghum aphid (Melanaphis sacchari (Zehntner)) and plant height characteristics via molecular markers in a sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) collection

    BİRGÜL GÜDEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BÜLENT UZUN

  4. Tez No

    677464

    Sorgum (Sorghum bicolor L.) çeşitlerinin bor noksanlığı ve fazlalığına duyarlılıkları

    Susceptibilities of sorghum (Sorghum bicolor L.) varieties to boron deficiency and toxicity

    RABİA GÜLŞEN KARAHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAKUP ÇIKILI

  5. Tez No

    879596

    Sorgum (Sorghum bicolor L.) ve yonca (Medicago sativa L.) ekstraklarının bazı bitkiler üzerine allelopatik etkisi

    Allelopathic effect of sorghum (Sorghum bicolor L.) and alfalfa (Medicago sativa L.) extracts on some plants

    SEMİH TOKAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatSakarya Uygulamalı Bilimler Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ÖTEN

Geri Dön