Biberde (Capsicum annuum l.) abiyotik stres koşullarının fizyo-biyokimyasal etkilerinin değerlendirilmesi ve yabby gen ailesinin genom çaplı analizi
Evaluation of the physio-biochemical effects of abiotic stress conditions in pepper (Capsicum annuum l.) and genome-wide analysis of the yabby gene family
- Tez No: 986356
- Danışmanlar: PROF. DR. EMRE İLHAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Ziraat, Biology, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Abiyotik stres, Filogenetik, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Moleküler genetik, Protein motifleri, Yeşil biber, Abiotic stress, Phylogenetic, Reverse transcription polimerase chain reaction, Molecular genetic, Protein motifs, Green pepper
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erzurum Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Demre biberinde tuz, kuraklık, sıcaklık ve üşüme stresleri altında ortaya çıkan fizyo-biyokimyasal yanıtları değerlendirmekte ve Capsicum annuum genomunda bulunan YABBY gen ailesini kapsamlı biçimde incelemektedir. Yapılan ölçümler, tüm stres koşullarında bitki gelişiminin yavaşladığını; buna karşılık prolin ve MDA düzeylerinde artış ile bazı antioksidan enzim aktivitelerinde belirgin değişimler olduğunu göstermiştir. Bu bulgular, Demre genotipinin stres tipine göre farklı savunma yollarını devreye soktuğunu işaret etmektedir. Genom analizlerinde dokuz CaYABBY geni tanımlanmış; bu genlerin motif yapıları, ekzon-intron düzenleri ve filogenetik ilişkileri ortaya konmuştur. CaYABBY3'teki belirgin motif kayıpları, bu genin aile içinde işlevssel olarak ayrıştığını düşündürmektedir. RT-qPCR analizleri, CaYABBY6'nın özellikle kök dokusunda tuz stresine güçlü bir yanıt verdiğini ve sıcaklık ile üşüme streslerinde de anlamlı şekilde arttığını göstermiştir. CaYABBY3'ün dokuya ve stres türüne göre değişen ifadesi ise aile içinde işlevsel bir farklılaşmayı desteklemektedir. Genel olarak, elde edilen sonuçlar YABBY gen ailesinin gelişim süreçlerinde olduğu kadar abiyotik stres yanıtlarında da önemli düzenleyici roller üstlendiğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
This study evaluates the physio-biochemical responses arrising under salt, drought, heat and cold stresses in Demre pepper comprehensively investigates the YABBY gene family found in the Capsicum annuum genome. Measurements indicated that plant growth under all stress conditions; conversely, increases in proline and malondialdehyde (MDA) levels and significant changes in certain antioxidant enzyme activities were observerd. These findings suggest that the Demre genotype activates distinct defense mechanisms depending on the stress type. In genome analyses, nine CaYABBY genes were identified; the motif structures, exon-intron organizations and phylogenetic relationships of these genes were elucidated. Significant motif losses in CaYABBY3, suggest that this gene had steucturally diverged within the family. RT-qPCR analyses demonstrated that CaYABBY6 exhibited a strong response to salt stress. The expression of CaYABBY3, varying according to tissue and stress type, supports functional differentitation within the family. Overall, the obtained results reveal that the YABBY gene family undertakes important regulatory roles in abitotic stress responses as well as in developmental processes.
Benzer Tezler
- Örtüaltı biber (capsicum annuum L. var. longum cvs“asi F1”ve“Görkem F1”) yetiştiriçiliğinde aşılı fide kullanımının bitki gelişimi, verim ve meyve kalitesi üzerine etkileri
The effect of grafted seedlings on plant growth, yield and fruit quality of peppers (capsicum annuum L. var. longum CVS“asi F1”and“görkem F1”) grown under cover
AYDIN AYDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BotanikAdnan Menderes ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR ŞİRİN
- Dışarıdan yapılan melatonin uygulamaları ile biberde çimlenme sırasında üşüme stresine karşı toleransın arttırılması
Enhancing chilling stress tolerance in pepper during seed germination by melatonin applications
AYGÜL KARACA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KORKMAZ
- Selüloz-bazlı hidrojel/ag nanokompozit sentezi ve kuraklık stresikoşullarında biber bitkisi büyüme ve gelişmesine etkileri
Cellulose-based hydrogel/ag nanocomposite synthesis and effectsof growth and development of pepper plants under drought stress
KHAIRUL MAGHFIRAH HASANAH
- Nitrik oksit uygulamasının biber bitkisinde (Capsicum Annum L.) kimi stres faktörleri üzerine etkisi
Effect of nitric oxide application on some stress factors in pepper (Capsicum Annum L.)
GÜNSU BARIŞIK KAYIN
Doktora
Türkçe
2020
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ALİ TURAN
- Biberde kuraklık stresinin hafifletilmesinde UV-B uygulamaları
UV-B treatments in alleviating drought stress in pepper
SÜMEYRA ALTINTAS
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BENGÜ TÜRKYILMAZ ÜNAL