Geri Dön

Mesane kanserinde uzun kodlamayan RNA HOXA-AS2-mir520c-3p/TGF-β yolağının incelenmesi

Investigation of the long non-coding RNA HOXA-AS2/miR-520c-3p/TGF-β pathway in bladder cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 987370
  2. Yazar: ELİF DELEN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. İLKNUR BİNGÜL, PROF. DR. SEVDA TANRIKULU KÜÇÜK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Biyokimya, Onkoloji, Genetics, Biochemistry, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Giriş ve Amaç: Mesane kanseri (MK), ürotelyal hücrelerden köken alan, klinik seyri heterojen olan ve yüksek rekürrens oranları nedeniyle hem klinik hem de ekonomik açıdan önemli bir sağlık sorunudur. Son yıllarda epigenetik mekanizmalar ve protein kodlamayan RNA'lar, kanser biyolojisinin anlaşılmasında ön plana çıkmıştır. Uzun kodlamayan RNA'lardan biri olan HOXA-AS2'nin çeşitli kanser türlerinde onkogenik özellikler sergilediği, mikroRNA'lardan miR-520c-3p'nin ise tümör baskılayıcı rol oynayabildiği bildirilmiştir. Ayrıca TGF-β sinyal yolunun MK progresyonunda kritik rol oynadığı bilinmektedir. Bu çalışmada, tümörlü ve tümörsüz doku örnekleri ile hücre kültürü modellerinde HOXA-AS2, miR-520c-3p ve TGF-β ekspresyon profillerinin analiz edilmesi; bu moleküler yolağın hastalığın tanı ve prognozunun değerlendirilmesinde potansiyel bir biyobelirteç ve/veya terapötik bir hedef olarak taşıdığı olası klinik önemin ortaya konması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Üroloji Anabilim Dalı, Ürolojik Onkoloji Bilim Dalı'na başvuran ve MK tanısı alan 80 hasta (71 erkek, 9 kadın) dahil edildi. MK hastalarından alınan tümörlü ve tümörsüz doku örneklerinde HOXA-AS2, miR520c-3p ve TGF-β ekspresyonları kantitatif gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PCR) yöntemiyle belirlendi. Analizler, sağlıklı mesane epiteli (SV-HUC-1), kasa invaze olmayan (RT-112) ve kasa invaze ileri evre (T24) MK hücre hatları kullanılarak da gerçekleştirildi. Ekspresyon düzeyleri ile klinikopatolojik parametreler arasındaki ilişkiler uygun istatistiksel yöntemlerle değerlendirilmiştir. Bulgular: Tümörlü dokularda HOXA-AS2 ekspresyonunun, tümörsüz dokulara kıyasla anlamlı derecede arttığı saptanırken, miR-520c-3p ve TGF-β ekspresyonları açısından gruplar arasında bir fark gözlenmedi. Klinik T evresi arttıkça HOXA-AS2 ve TGF-β ekspresyonlarının anlamlı olarak yükseldiği belirlendi. Korelasyon analizlerinde HOXA-AS2 ile TGF-β arasında pozitif yönde anlamlı bir ilişki saptantı. ROC analizleri, HOXA-AS2'nin tümörlü ve tümörsüz dokuların ayrımında ve evrelerin belirlenmesinde orta düzeyde ayırt edici güce sahip olduğunu gösterdi. Hücre hattı analizlerinde ise HOXA-AS2 ve TGF-β ekspresyonunun progresyonla birlikte arttığı, miR-520c-3p ekspresyonunun ise azaldığı belirlendi. Sonuç: Bu çalışma, HOXA-AS2'nin MK'de onkogenik özellikler sergileyen, TGF-β ile pozitif ilişkili ve tümör progresyonu ile bağlantılı bir molekül olduğunu ortaya koymaktadır. Hücre hattı bulguları, HOXA-AS2/miR-520c-3p/TGF-β ekseninin MK biyolojisinde işlevsel bir bütünlük oluşturduğunu düşündürmektedir. Elde edilen veriler, bu moleküllerin MK'de tanısal ve prognostik biyobelirteçler olarak değerlendirilebileceğini ve hedefe yönelik yeni tedavi yaklaşımlarının geliştirilmesine katkı sağlayabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Introduction and Aim: Bladder cancer (BC) is a malignancy originating from urothelial cells, characterized by a heterogeneous clinical course and high recurrence rates, which together impose a significant clinical and economic burden. In recent years, epigenetic mechanisms and non-coding RNAs have emerged as key regulators in the understanding of cancer biology. Among long non-coding RNAs, HOXA-AS2 has been reported to exhibit oncogenic properties in various cancer types, whereas the microRNA miR-520c-3p has been shown to function as a tumor suppressor. In addition, the transforming growth factor-beta (TGF-β) signaling pathway is known to play a critical role in BC progression. In this study, we aimed to analyze the expression profiles of HOXA-AS2, miR-520c-3p, and TGF-β in tumor and non-tumor tissue samples as well as in cell culture models, and to elucidate the potential clinical significance of this molecular axis as a diagnostic and/or prognostic biomarker and a therapeutic target in bladder cancer. Materials and Methods: A total of 80 patients diagnosed with bladder cancer (71 males and 9 females) who were admitted to the Department of Urology, Division of Urological Oncology, Istanbul University Istanbul Faculty of Medicine were included in the study. Expression levels of HOXA-AS2, miR-520c-3p, and TGF-β in tumor and non-tumor tissue samples obtained from BC patients were determined using quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). In addition, analyses were performed using a normal bladder epithelial cell line (SV-HUC-1), a non–muscle-invasive BC cell line (RT-112), and a muscle-invasive advanced-stage BC cell line (T24). The associations between expression levels and clinicopathological parameters were evaluated using appropriate statistical methods. Results: HOXA-AS2 expression was found to be significantly increased in tumor tissues compared to non-tumor tissues, whereas no significant differences were observed in miR-520c-3p and TGF-β expression levels between the groups. Increasing clinical T stage was associated with significantly elevated HOXA-AS2 and TGF-β expression levels. Correlation analyses revealed a significant positive correlation between HOXA-AS2 and TGF-β expression. Receiver operating characteristic (ROC) analyses demonstrated that HOXA-AS2 had a moderate discriminatory power in distinguishing tumor from non-tumor tissues and in differentiating between disease stages. In cell line analyses, HOXA-AS2 and TGF-β expression levels increased with tumor progression, whereas miR-520c-3p expression was decreased. Conclusion: This study demonstrates that HOXA-AS2 is an oncogenic molecule in bladder cancer, positively associated with TGF-β expression and tumor progression. The findings from cell line models suggest that the HOXA-AS2/miR-520c-3p/TGF-β axis constitutes a functionally integrated pathway in BC biology, and that these molecules may serve as potential diagnostic and prognostic biomarkers as well as targets for the development of novel targeted therapeutic strategies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    836645

    Kasa invaze olmayan mesane kanserinde; uzun kodlamayan RNA ZEB-1 AS-1 ve miR-200b ekspresyonlarının klinik ve histopatolojik parametreler ile ilişkisi

    In non-muscle invasive bladder cancer; relationship of long non-coding RNA ZEB-1 AS-1 and miR-200b expressions with clinical and histopathological parameters

    MEHMET ENES DEĞİRMENCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Ürolojiİstanbul Üniversitesi

    Üroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖNER ŞANLI

  2. Tez No

    870550

    Mesane kanserli hastalarda uzun kodlamayan RNA-ATB ve MiR-200c ekspresyonlarının incelenmesi

    Investigation of long non-coding RNA-ATB and MiR-200c expressions in bladder cancer patients

    ARİF MURAT KAYTAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Biyokimyaİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA DOĞRU ABBASOĞLU

  3. Tez No

    938411

    Mesane kanseri hastalarında ileal konduit üriner diversiyonun üst üriner sistem üzerindeki uzun dönem etkilerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of the long-term effects of illeal conduit urinary diversion on the upper urinary system in bladder cancer patients

    ALP AKYOL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ÜrolojiEge Üniversitesi

    Üroloji Ana Bilim Dalı

    DR. KASIM EMRE ERGÜN

    PROF. DR. AHMET BARIŞ ALTAY

  4. Tez No

    882131

    Mesane kanserinde HER2 ve CDK12 mutasyon varlığınınhistopatolojik ve klinik bulgular ile ilişkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of the relationship between HER2 and CDK12 mutations in bladder cancer with histopathological and clinical findings

    BİLGE GÜNAY GÜLEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    PatolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU SARSIK KUMBARACI

  5. Tez No

    912245

    Mesane kanserinde total lezyon glikolizi ve metabolik tümör volümü parametrelerinin tümörün histopatolojik özellikleri ve biyodavranışı arasındaki ilişkinin araştırılması

    Investigation of the relationship between total lesion glycolysis and metabolic tumor volume parameters with tumor histopathological features and biobehavior in bladder cancer

    CİHAN ŞİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Nükleer Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BURCU ESEN AKKAŞ

Geri Dön