Differential gene expression of pnces A4 in populus nigra
Populus nıgra'da pnces A4' ün diferansiyel gen ifadeedilmesi
- Tez No: 987597
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ KAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Populus nigra L., nehir kıyısı ekosistemlerinde en kritik öncü ağaç türü olmaya borçludur ve ekolojik ve ekonomik olarak zorunlu hızlı büyüyen türler olarak kabul edilir. Ayrıca, biyokütle ve biyoenerji kullanımı ve“selüloz içeriği”özelliğinin manipülasyonu için harika bir ağaç türüdür. Fosil yakıtlardan elde edilen sınırlı enerji kaynakları, Populus nigra'nın büyük bir aday olduğunu gösterdiği alternatif verimli biyokütle mahsulleri gerektirir. Bu çalışmada, Populus nigra L'de selüloz ile ilgili CESA (selüloz sentaz) ikincil hücre duvarı ile ilgili“PnCesA4”alt birim gen ifadesi araştırıldı. CESA alt birimlerini içeren selüloz sentaz kompleksi (CSC),“CesA4/ 7 ve 8”ikincil hücre duvarı regülasyonu ve tutulumu için henüz tam olarak keşfedilmemiştir. Böylece, CESA ikincil hücre duvarı ile ilgili alt birim genlerinden Populus nigra'da tek kopya selülaz sentaz geni olan PnCesA4 alt birim geninin ifade edimesi araştırıldı. PnCesA4 gen ifadesine ek olarak, Taşkıran (2020) tarafından sağlanan veriler kullanılarak bu genin UGPase ve SuSy aktivitesi, büyüme ve selüloz karakterleriyle olan ilişkileride etraflıca araştırıldı. Çalışmanın sonuçları şaşırtıcı bir şekilde beklenenin aksine PnCesA4 gen ifade seviyeleri ile büyüme özellikleri (boy ve Çap) arasında negatif korelasyonlar bulundu. Ayrıca ilginç bir şekilde PnCesA4 gen ifadesi, selüloz içeriği veya selüloz sentezleyen enzimler ile ilişkili olmadığı görüldü. Buluan bu sonuçlar birlikte değerlendirildiğinde, bu genin bulunduğu biyokimyasal yolakda daha karmaşık bir düzenleme ve CesA4 alt birimi için henüz bilinmeyen daha benzersiz bir işlevi olduğu düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Populus nigra L. owes to be the most critical pioneer tree species in riparian ecosystems and is considered an ecologically and economically-wise imperative fast-growing species. Moreover, it is a great tree species for biomass and bioenergy utilization and cellulose content manipulation. The limited energy resources from fossil fuels demand an alternative efficient biomass crop, where Populus nigra shows to be a great candidate. In this study, the CesA (cellulose synthase) secondary cell wall-related CesA4 subunit gene expression (PnCESA4) and its relation to cellulose were investigated in Populus nigra L. The cellulose synthase complex (CSC) involving the CESA subunits, PnCesA4/ 7/ and 8, for secondary cell wall regulation and involvement, was not yet fully discovered. Thus, from the CesA secondary cell wall-related subunit genes the expression of the PnCesA4 subunit gene, which is the only single-copy cellulose synthase gene, was investigated in Populus nigra trees. In addition to PnCesA4 gene expression, its relation to UGPase and SuSy activity, and growth data which were provided by Taşkıran (2020) were explored to understand the relationship among cellulose-related traits. The results of the study surprisingly are in contrary to what was expected that is, there were negative correlations between PnCesA4 gene expression levels and growth traits (Height and Diameter). Moreover, interestingly PnCesA4 gene expression was not correlated with cellulose content or cellulose synthesizing enzymes. These outcomes taken altogether, indicate in owing to a more complicated regulation in the pathway that is taking place, and a more unique functional role for the PnCesA4 subunit that is yet to be known.
Benzer Tezler
- Differential gene expression analysis of candida albicans exposed to biologically-synthesized silver nanoparticles
Biylojik sentezlenmiş gümüş nanoparticles'e maruz kalan candida albicans diferansiyel gen ekspresyon analizi
OSAID ALHAROUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiNanobilim ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HİLAL AY
- Differential expression of a bromoperoxidase-like gene between sporophytes and gametophytes of a red alga, porphyra yezoensis
Bromoperoksidaz benzeri genin kırmızı alg porphyra yezoensis sporofit ve gametofitlerinde farklı ifadeleri
RENGİN ÖZGÜR UZİLDAY
- Identification of differential gene expression amonglow phytic acid and high grain protein genotypes in winterwheat (Triticum aestivum L.)
Kışlık ekmeklik buğday düşük fitik asit ve yüksek protein içerikli genotipler arasındaki farklı gen ifadelerinin belirlenmesi
BETÜL ÇETİNDERE
- DCNA: A tool for differential co-expression network analysis of gene expression data
DCNA: Gen ifade verileriyle ko-ekspresyon analizi yapan ağ tabanlı uygulama
TALİP YASİR DEMİRTAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyomühendislikAdana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA GÖV
- Investigating the role of RNA-binding proteins (RBPs) in explaining differential gene expression in cancer
RNA'ya bağlanan proteinlerin kanserde gen ifade değişimine olan etkilerinin incelenmesi
ATEFEH LAFZI
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyomühendislikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
YRD. DOÇ. DR. HİLAL KAZAN