Adana ve Hatay illerinden toplanan Balclutha hebe (Kirkaldy, 1906) türlerinde fitoplazma enfeksiyonunun taranması
Screening of phytoplasma infection in Balclutha hebe (Kirkaldy, 1906) species collected from Adana and Hatay provinces
- Tez No: 988867
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ IŞIL TULUM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Botanik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Fitoplazmalar, Mollicutes sınıfına ait bitki patojenlerindendir. Gram-pozitif, hücre duvarı içermeyen bu bakteriler dünya çapında 1.000'den fazla bitki türünü enfekte ederek ciddi ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bu organizmalar bitkiden bitkiye vektörler, özellikle de Hemiptera ailesinden böcekler ile bulaştırılır. Cicadellidae fitoplazma vektörü olduğu kanıtlanmış bir çok tür içerirken, fitoplazmaların kozmopolit bir tür olan Balclutha hebe ile taşınmasına ilişkin literatür son derece sınırlıdır. Bu sebeple, 2024 yılında Türkiye'nin önemli tarımsal alanlarından olan Adana ve Hatay illerinde yapılan saha çalışması sırasında 10 lokaliteden toplanan 86 böcek örneğinde fitoplazmaların varlığını belirlemek için 16S rRNA genleri üzerinde moleküler analizler yapılmıştır. Kısaca, semptomatik bitki örneklerinin etrafında bulunan böcekler toplanmış, DNA'ları ekstrakte edilmiş, sonrasında ise evrensel primerler P1/P7 ve R16F2n/R16R2 ile iç içe polimeraz zincir reaksiyonu (nested PCR) kullanılarak çoğaltılmıştır. Farklı lokalitelerden toplanan Balclutha hebe türlerinden 1,2 kb'lik amplikonlar (16S rRNA geni) elde edilmiştir. Bu örneklerden elde edilen 16S rRNA gen amplikonları sonrasında dizilenerek değerlendirilmiştir. Değerlendirilen diziler sonucu 'Candidatus Phytoplasma trifolii' türü varlığı saptanmış ve referans dizileriyle %99,74 benzerlik göstermiştir. Sanal RFLP yöntemi ile de tür sağlaması yapılmıştır. Bu sonuçlar Türkiyede kaydedilen ilk fitoplazma pozitif, dünyada da 'Ca. P. trifolii' taşıyan ilk Balclutha hebe kaydını ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
Phytoplasmas are plant pathogens belonging to the Mollicutes class. These Gram-positive bacteria, which lack a cell wall, infect over 1,000 plant species worldwide, causing significant economic losses. These organisms are transmitted from plant to plant by vectors, particularly insects from the Hemiptera family. While the Cicadellidae family contains many species proven to be phytoplasma vectors, the literature on the transmission of phytoplasmas by Balclutha hebe, a cosmopolitan species, is extremely limited. Therefore, in 2024, molecular analyses were performed on 16S rRNA genes to determine the presence of phytoplasmas in 86 insect samples collected from 10 different localities during a fieldwork conducted in the provinces of Adana and Hatay, which are important agricultural areas of Turkey. To summarize, insects found around symptomatic plant samples were collected, their DNA was extracted, and then amplified using nested polymerase chain reaction (PCR) with universal primers P1/P7 and R16F2n/R16R2. 1.2 kb amplicons (16S rRNA gene) were obtained from Balclutha hebe species collected from different locations. The 16S rRNA gene amplicons obtained from these samples were subsequently sequenced and evaluated. As a result of the evaluated sequences, the presence of the species 'Candidatus Phytoplasma trifolii' was detected, showing 99.74% similarity with reference sequences. Species confirmation was also performed using the virtual RFLP method. These results represent the first phytoplasma-positive record in Turkey and the first record worldwide of Balclutha hebe carrying 'Ca. P. trifolii'.
Benzer Tezler
- Yeni viral etmenlerin narlarda [Punica granatum L.] yüksek kapasiteli dizileme ile saptanması, biyolojik ve epidemiyolojik özelliklerinin araştırılması, organik nar bahçelerinde taranması
Investigation of new viral agents in pomegranates [Punica granatum L.] by high throughput sequencing, their biological and epidemiological characteristics, screening in organic pomegranate orchards
HAMİDE DENİZ KOCABAĞ
Doktora
Türkçe
2022
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ÇAĞLAYAN
- Türkiye'de turunçgil tristeza virüs hastalığının mevcut durumunun serolojik ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Detection of citrus tristeza virus currently situation by the methods of serological and molecular in Turkey
ONUR TURGUT
- Türkiye'deki bazı Cassidinae ve Hispinae türlerinin genital morfolojileri üzerine araştırmalar (Coleoptera : Chrysomelidae)
Researches on genital morphologies of some Cassidinae and Hispinae species (Coleoptera : Chrysomelidae )in Turkey
FATİH ATAŞ
- Türkiye'deki bazı Bemisia tabaci (Genn.) (Homoptera:Aleyrodidae) populasyonlarının biyolojik, morfolojik, biyokimyasal ve moleküler genetik özelliklerinin belirlenmesi üzerine bir araştırma
A research on the determination of biological, morphological, biochemical and molecular genetic characteristics of some Bemisia tabaci (Genn.) (Homoptera:Aleyrodidae) populations in Turkey
NURDAN TOPAKCI
- Adana K. Maraş ve Hatay ili ilköğretim müfettişleri ve öğretmenlerinin farklılaştırılmış denetim modelini benimseme ve kamu ilköğretim okullarında uygulanabilir bulma düzeyleri
In Adan K. Maraş and Hatay provinces primary school supervisors`and primary school teachers`adoption level differentiated supervision and the consideration of its applicability at state schools
ABDURRAHMAN İLĞAN
Doktora
Türkçe
2006
Eğitim ve ÖğretimAnkara ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. İNAYET AYDIN