Karaciğer kanserinde MikroRNA-2110'un FOXM1 transkripsiyon faktörünün anlatımına etkisinin belirlenmesi
Determination of the MicroRNA-2110 effect on FOXM1 transcription factor expression in liver cancer
- Tez No: 989147
- Danışmanlar: DOÇ. DR. PELİN BALÇIK, DR. İREM YALIM CAMCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Moleküler biyoloji, Molecular biology
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hepatosellüler Karsinom (HCC), karaciğer kanserinin en büyük alt grubunu oluşturmakta ve kansere bağlı ölümlerde üçüncü sırada yer almaktadır. Forkhead Box ailesinin üyesi olan FOXM1 transkripsiyon faktörü, hücre döngüsünde rol almaktadır ve çeşitli kanser türlerinde tümör progresyonu, hücre proliferasyonu ve metastaz süreçleriyle ilişkilendirilmektedir. FOXM1'in HCC gelişiminde onkogen olarak rol oynadığı belirlenmiştir. MikroRNA'lar (miRNA'lar), yaklaşık 20-23 nükleotid uzunluğunda, hedef mRNA'ların 3'UTR bölgelerine bağlanarak gen ifadesini baskılayan, post-transkripsiyonel düzeyden düzenleme sağlayan küçük kodlanmayan RNA molekülleridir. MiRNA-2110, kanserde potansiyel bir düzenleyici molekül olarak dikkat çeken, işlevi tam olarak aydınlatılmamış bir miRNA'dır. In-silico analizler, miRNA-2110'un FOXM1 geninin 3'UTR'sini hedeflediğini göstermektedir. Literatürde miRNA-2110'un HCC'deki fonksiyonu ve FOXM1 üzerindeki olası düzenleyici etkisine ilişkin veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, miR-2110 transfekte edilmiş HCC hücrelerinde FOXM1 protein ifadesinin anlamlı düzeyde azaldığı saptanmıştır. Bu amaçla FOXM1 3'UTR bağlanma bölgeleri içeren plazmid üzerinde bağlanma dizileri yönlendirilmiş mutasyon ile silinmiştir. Mutasyonlar, Sanger dizileme ile doğrulanmış ve hedef bölgelerin yapısal bütünlüğü analiz edilmiştir. FOXM1'in HCC üzerindeki etkileri ve mikroRNA-2110'un terapötik potansiyeli ele alındığında tez çalışması kapsamında, HCC progresyonunda önemli olan FOXM1 transkripsiyon faktörünün post-transkripsiyonel regülasyonunun miRNA-2110'nın direkt regülatör olarak rol oynadığı belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most prevalent primary liver cancer and the third most common cause of cancer-related mortality. Forkhead Box M1 (FOXM1), a member of the Forkhead Box family, is a transcription factor that involves cell cycle regulation and contributes to tumor progression, proliferation and metastasis in various cancer types. FOXM1 has been identified as an oncogene for the development of HCC. MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs, 20-23 nucleotides in length, that provide post-transcriptional control by binding to the 3'UTR regions of mRNAs. MiRNA-2110 has a potential regulatory molecule in cancer, although its function has not yet been fully elucidated. In-silico analyses showed that the FOXM1 3'UTR region is a potential target of miR-2110. The function of miR-2110 in HCC and its regulatory effect on FOXM1 have not yet been defined in the literature. In this study, transfection of miR-2110 into HCC cell lines resulted in a significant decrease in FOXM1 protein expression. To further investigate this interaction, the predicted miR-2110 binding sites within the FOXM1 3′UTR were selectively deleted using site-directed mutagenesis method. The mutations were validated by Sanger sequencing, and the structural integrity of the target regions was analyzed. Considering the effects of FOXM1 on HCC and the therapeutic potential of miRNA-2110, the results of this thesis demonstrate that miR-2110 acts as a direct post-transcriptional regulator of FOXM1, highlighting its potential significance in the molecular regulation of HCC progression.
Benzer Tezler
- Effect of doxorubicin and microrna-140-3p on pd-L1 expression in colon cancer
Kolon kanserinde doxorubıcın ve mıcrorna-140-3p'nin pd-L1 ifadesine olan etkisi
NOEL MOPOUGUINI NABA
Doktora
İngilizce
2020
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
Assoc. Prof. Dr. AYÇA SAYI YAZGAN
- A shiny application for pancan survival analysis with paralog/miRNA pairs and in vitro validation of miRNA synergism in liver cancer
Paralog/miRNA çiftleri ile pancan sağkalım analiz shiny aplikasyonu ve karaciğer kanserinde miRNA sinerjizminin in vitro doğrulanması
MELİKE TOMBAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Genetikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEN KONU KARAKAYALI
- Hücre metabolitlerinin ve bazı biyobelirteçlerin tayinine yönelik elektokimyasal sensörlerin geliştirilmesi
Designing of electrochemical sensors for detection of some biomarkers and cell metabolites
TUĞBA KILIÇ
Doktora
Türkçe
2015
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN
PROF. DR. MEHMET EMİN ŞENGÜN ÖZSÖZ
- Kolorektal kanserde peritoneal karsinomatozise ve karaciğer metastazına etki eden hücre içi sinyal yolakları ve mikroRNA expresyonun ilişkisi
The relationship between intracellular signaling pathways and microRNA expression affecting peritoneal carcinomatosis and liver metastasis in colorectal cancer
MEHMET AZİRET
Doktora
Türkçe
2023
OnkolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiMoleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA DUMAN
- Serum miRNA profillerinin hepatit B virüs (HBV) infeksiyonu ve kronik HBV ile ilişkili hepatosellüler karsinomanın erken tanısındaki biyomarkır olma potansiyelinin araştırılması
Investigating the potential of serum miRNA profiles as a biomarker in early diagnosis of hepatitis B virus (HBV) infection and chronic hbv related hepatocellular carcinoma
BURCU GÜRER GİRAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜROL EMEKDAŞ