Cephidae familyasına ait cinslerin bağırsak mikobiyotalarının metabarkodlama yöntemiyle karakterizasyonu
Characteri̇zati̇on of gut mycobi̇ota of genera belongi̇ng to the fami̇ly cephi̇dae usi̇ng metabarcodi̇ng
- Tez No: 991368
- Danışmanlar: PROF. DR. MAHİR BUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetics, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoinformatik Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında, tarımsal ekosistemlerde fitofag yaşam biçimiyle öne çıkan Cephidae (Hymenoptera: Symphyta) familyasına ait türlerin bağırsak mikobiyotası metabarkodlama yöntemiyle karakterize edilmiştir. Çalışmada, Cephus pygmeus, Pachycephus smyrnensis, Syrista parreyssi, Trachelus stipa ve Trachelus tabidus türlerine ait toplam 10 ergin birey kullanılmıştır. Mantar topluluklarının tanımlanmasında ITS1 ve ITS2 gen bölgeleri hedeflenmiş, elde edilen DNA'lar Illumina MiSeq platformunda dizilenmiştir. Dizileme verileri QIIME2 (v2022.11.1) yazılımı ile analiz edilmiş; DADA2 algoritması kullanılarak hata düzeltme ve kimerik filtreleme yapılmış, taksonomik atamalar ise BLAST+ yöntemiyle UNITE mantar veritabanına karşı gerçekleştirilmiştir. Analizler sonucunda, fungal toplulukların büyük çoğunluğunun Ascomycota ve Basidiomycota şubelerine ait olduğu belirlenmiştir. En baskın cinsler arasında Metschnikowia, Cladosporium, Alternaria, Cutaneotrichosporon, Vishniacozyma, Bettsia ve Skoua yer almıştır. Türler arasında belirgin mikrobiyal farklılıklar gözlenirken, bazı mantar cinslerinin birden fazla türde ortak olarak bulunması, Cephidae familyasında filogenetik olarak korunmuş simbiyotik ilişkilerin varlığını düşündürmektedir. Yüksek oranda tespit edilen“unassigned”diziler ise mevcut veri tabanlarının Hymenoptera kökenli simbiyotik mantar çeşitliliğini temsil etmede sınırlı olduğunu göstermektedir. Elde edilen bulgular, Cephidae familyasında simbiyotik mantarların yalnızca sindirim süreçlerinde değil, aynı zamanda ekolojik adaptasyon, bağışıklık düzenlenmesi ve evrimsel simbiyotik ağların oluşumunda da önemli roller üstlendiğini ortaya koymuştur. Ayrıca bu çalışma sonucunda ortaya çıkan veri biyoteknolojik ve biyokontrol uygulamaları açısından yüksek potansiyele sahiptir.
Özet (Çeviri)
In this study, the gut mycobiota of species belonging to the family Cephidae (Hymenoptera: Symphyta), which are characterized by a phytophagous lifestyle in agricultural ecosystems, were characterized using the metabarcoding approach. A total of ten adult individuals representing five species — Cephus pygmeus, Pachycephus smyrnensis, Syrista parreyssi, Trachelus stipa, and Trachelus tabidus — were analyzed. The ITS1 and ITS2 gene regions were targeted for the identification of fungal communities, and the obtained DNA samples were sequenced using the Illumina MiSeq platform. Sequence data were analyzed with the QIIME2 (v2022.11.1) software; error correction and chimera filtering were performed using the DADA2 algorithm, and taxonomic assignments were carried out using the BLAST+ method against the UNITE fungal database. As a result of the analyses, the majority of the fungal communities were found to belong to the phyla Ascomycota and Basidiomycota. The dominant genera included Metschnikowia, Cladosporium, Alternaria, Cutaneotrichosporon, Vishniacozyma, Bettsia, and Skoua. Although clear microbial variations were observed among the species, the presence of several fungal genera shared across multiple hosts suggests the existence of phylogenetically conserved symbiotic associations within the Cephidae family. The high proportion of“unassigned”sequences indicates that current reference databases are limited in representing the fungal symbiont diversity associated with Hymenoptera species. Overall, the findings reveal that the symbiotic fungi of Cephidae not only contribute to digestive processes but also play crucial roles in ecological adaptation, immune regulation, and the establishment of evolutionary symbiotic networks. Furthermore, the data obtained from this study has high potential for biotechnological and biocontrol applications.
Benzer Tezler
- Türkiye Cephidae (Hymenoptera: Insecta) türlerinin sistematiği, biyocoğrafyası ve filogenisi
Systematics, biogeography and phylogeny of Cephidae (Hymenoptera: Insecta) species of Turkey
MAHİR BUDAK
Doktora
Türkçe
2012
ZoolojiCumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK
- Cephinae (Hymenoptera: Symphyta: Cephidae) altfamilyasında konak kullanım genlerinin tüm genom boyunca karşılaştırmalı karakterizasyonu ve konak değişiminin evrimi
Genome-wide comparative characterisation of host use genes and evolution of host shift in the subfamily Cephinae (Hymenoptera: Symphyta: Cephidae)
ÖZGÜL DOĞAN
Doktora
Türkçe
2021
BiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERTAN MAHİR KORKMAZ
- İç Anadolu Cephus (Cephidae: Hymenoptera: Insecta) türlerinin morfolojik ve moleküler karakterizasyonu
Morphological and molecular characterization of Central Anatolia species of the genus Cephus (Cephidae: Hymenoptera: Insecta)
ERTAN MAHİR KORKMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HASAN BAŞIBÜYÜK
- Türkiye Calameuta (Cephidae:Hymenoptera) türlerinin morfolojik ve moleküler yönden incelenmesi
Molecular and morphological investigation on turkish species of the genus Calameuta (Cephidae:Hymenoptera)
MAHİR BUDAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK
- Calameuta haemorrhoidalis (Fabricius, 1781) (Hymenoptera: Cephidae) populasyonlarının morfometrik analizi
The morphometric analysis of Calameuta haemorrhoidalis (Fabricius, 1781) (Hymenoptera: Cephidae) populations
GİZEM HAZAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK