Farklı segmentasyon metotları ile koyun kafa bölgesinde yer alan anatomik yapıların morfometrik ve volumetrik verilerinin değerlendirilmesi
Evaluation of morphometric and volumetricdata of anatomical structures in the sheep head region using different segmentation methods
- Tez No: 996009
- Danışmanlar: DOÇ. DR. CANER BAKICI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Anatomi, Veteriner Hekimliği, Anatomy, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Anatomi, Hacimsel veriler, Koyunlar, Morfometri, Segmentasyon, Üç boyutlu baskı, Anatomy, Volumetric data, Sheep, Morphometry, 3D printing
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Anatomisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Romanov koyunlarına ait baş bölgesi anatomik yapılarının bilgisayarlı tomografi (BT) ve manyetik rezonans görüntüleme (MRG) verileri üzerinden altı farklı segmentasyon yöntemi kullanılarak elde edilen morfometrik ve hacimsel özelliklerinin karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Özellikle mandibula, molar dişler ve beyin; anatomik ve klinik önemleri nedeniyle seçildi. Altın standart olarak kabul edilen manuel segmentasyon, yarı otomatik ve otomatik segmentasyon yöntemleriyle karşılaştırılmıştır. Morfometrik ölçümler (uzunluk, genişlik ve yükseklik), hacim ve yüzey alanı verileri ile segmentasyon için harcanan süre kantitatif yönden değerlendirmeye alınmıştır. Ayrıca her yönteme ait üç boyutlu modeller üzerinden yapılan görsel analizlerle nitel değerlendirme yapıldı. Ortaya çıkan bu sonuçlar, değerlendirilen tüm parametreler açısından segmentasyon yöntemleri arasında anlamlı istatistik farklar olduğunu gösterdi (p <0,05). Fazla zaman almış olsa da en gerçekçi ve detaylı modeller manuel segmentasyonla elde edildi. Yarı otomatik segmentasyon ve dilimler arası doldurma algoritması, manuel yönteme nicel olarak yakın sonuçlar vermiş ve diğer yarı otomatik algoritmalar ve otomatik yöntemlere göre daha yüksek görsel doğruluk göstermiştir. Otomatik eşikleme ve büyüme tabanlı segmentasyonlar ise zamandan tasarruf sağlamalarına rağmen, fazla veya eksik modellemelere neden oldu, yapısal gerçekliği ve ölçüm güvenilirliğini düşürdü. Nitel değerlendirmelerde; delikler, çıkıntı-oluk yapıları ve diş konturlarının manuel segmentasyon modellerinde en iyi şekilde korunduğu gözlemlendi. Sonuç olarak, segmentasyon yöntemi seçiminin morfometrik ve hacimsel verilerin anatomik doğruluğu ve güvenilirliği üzerinde doğrudan etkili olduğu ortaya kondu. Zaman ve doğruluk açısından denge sunan yarı otomatik yöntemler belirli durumlar için uygun olsa da yüksek hassasiyet gerektiren anatomik modellemelerde manuel segmentasyonun vazgeçilmez olduğu sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
This study was aimed to evaluate and compare morphometric and volumetric characteristics of anatomical structures in the head region of Romanov sheep using six different segmentation methods applied to computed tomography (CT) and magnetic resonance imaging (MRI) data. Specifically, the mandible, molar teeth, and brain were selected due to their anatomical and clinical relevance. Manual segmentation, considered the gold standard, was compared to semi-automatic and automatic segmentation methods. Morphometric measurements (length, width, and height), volumetric and surface area data, as well as the time required for segmentation, were quantitatively assessed. Furthermore, qualitative evaluations based on 3D model visuals were performed to determine the anatomical realism of each method. The results indicated significant statistical differences between the segmentation techniques in terms of all parameters evaluated (p <0.05). Manual segmentation consistently provided the most anatomically realistic and detailed models, albeit requiring the most time. Semi automatic segmentation and fill between slices algorithm yielded results that were quantitatively close to the manual method and showed higher visual fidelity than other semi automatic algorithms and automatic methods. Automatic thresholding and Grow-based methods, while time-efficient, resulted in over- or under-segmentation, affecting structural realism and measurement reliability. Qualitative evaluations revealed that fine anatomical details such as foramina, gyri-sulci structures, and dental contours were best preserved in manual models. In conclusion, the study demonstrates that segmentation choice significantly impacts the anatomical accuracy and reliability of morphometric and volumetric data. While semi-automatic methods may offer a good balance between time and accuracy, manual segmentation remains essential for high-precision anatomical modeling, especially in veterinary and comparative anatomy research.
Benzer Tezler
- Object-based classification of landforms based on their local geometry and geomorphometric context
Yerşekillerinin geometrik ve jeomorfometrik özelliklerine göre nesne tabanlı sınıflandırılması
DENİZ GERÇEK
Doktora
İngilizce
2010
Jeodezi ve FotogrametriOrta Doğu Teknik ÜniversitesiJeodezi ve Coğrafi Bilgi Teknolojileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. JOSEF STROBL
PROF. DR. VEDAT TOPRAK
- Markov random fields and a multiscale implementation of markov random fields on Bayesian image segmentation
Başlık çevirisi yok
UĞUR SIVAKÇI
Yüksek Lisans
İngilizce
1998
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERTUĞRUL ÇELEBİ
- Konik ışınlı bilgisayarlı tomografi kullanılarak yapılan hacimsel hesaplamalarda farklı planimetrik yöntemlerin karşılaştırılması
Comparing different planimetric methods on the volumetric estimations with cone beam computed tomography
ALAETTİN KOÇ
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2017
Diş HekimliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiAğız, Diş ve Çene Radyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖMER SAİD SEZGİN
- Derin öğrenme metotları kullanılarak SAR (sentetik açıklıklı radar) görüntülerinden bina tespiti
Building detection from SAR (synthetic aperture radar) images using deep learning methods
RECAİ ALPER EMEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mühendislik BilimleriAkdeniz ÜniversitesiUzaktan Algılama ve Coğrafi Bilgi Sistemleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NUSRET DEMİR
- Makine öğrenmesi ile hasar tespiti modellemesi
Modeling of damage detection with machine learning
NUH MUHAMMED PİŞKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
İnşaat MühendisliğiEge Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRE ERCAN