Fokal segmental glomerüloskleroz olgularında yeni nesil dizileme ile genetik etyopatogenezin araştırılması
Investigating genetic etiopathogenesis in focal segmental glomerulosclerosis cases utilizing next-generation sequencing
- Tez No: 1008315
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ ÖZTÜRK, DOÇ. DR. İLKNUR SUER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Fokal Segmental Glomerüloskleroz (FSGS), podosit hasarı ile karakterize olup glomerüler filtrasyon bariyerinin bozulmasına ve belirgin proteinüriye yol açan önemli bir klinikopatolojik hastalıktır. Hastalık çoğu olguda ilerleyici seyir göstererek son dönem böbrek hastalığına (SDBH) ilerleyebilmektedir. Bu tez çalışmasında, böbrek biyopsisi ile FSGS tanısı konulmuş 18 yaş üstü 50 olguda Tüm Ekzom Dizileme (TED) analizi yapıldı. Sonra tespit edilen varyantların seçilen vakalarda doğrulanması ve ailelerinde segregasyon analizi için Sanger dizileme yapıldı. 50 olguda gerçekleştirilen TED analizi sonucunda, 25 olguda FSGS ile ilişkili olabilecek aday genlerde, olgunun kliniğini açıklayacak varyant veya CNV saptanmadı. hastalıkla ilişkili olabilecek varyant tespit edilen 7 olguda aile bireylerinden örnek temin edilemediğinden Sanger dizileme yapılamamıştır. 12 olguda ise sanger dizileme sonucunda incelenen varyantın/varyantların FSGS'nin gelişiminde patojenik etkileri olmadığı (benign bir değişim oldukları) sonucuna varılmıştır. 3 olguda, SDCCAG8, NPHS2 ve COQ8B genlerinde hastalığın patogenezini açıklayan, daha önce tanımlanmış, patojenik ve muhtemel patojenik varyantlar tespit edildi. 3 olguda ise MAPKBP1, PODXL ve ARHGAP24 genlerinde daha önce bildirilmemiş yeni varyantlar tespit edildi. Sonuç olarak bu tez çalışmasında kullanılan TED yöntemi, FSGS tanılı olgularda bilinen hastalık genlerinin ve saptanan yeni varyantların tanısal değerini ortaya koymuş, ayrıca olası aday genlerin rolüne dikkat çekmiştir. Klinik bulgularla uyumlu patojenik varyantların belirlenmesi ise genetik danışmanlık sürecine katkı sağlayarak aile içindeki riskli bireylerin saptanmasına olanak sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Focal Segmental Glomerulosclerosis (FSGS) is a clinicopathological disease characterized by podocyte injury, leading to disruption of the glomerular filtration barrier and significant proteinuria, and may progress to end-stage renal disease (ESRD). In this thesis, Whole Exome Sequencing (WES) analysis was performed in 50 patients over 18 years of age diagnosed with FSGS by kidney biopsy. Subsequently, Sanger sequencing was conducted to validate the detected variants in selected cases and to perform segregation analysis in their families. WES analysis of 50 cases revealed that in 25 cases, no variants or CNVs were identified in candidate genes that could explain the clinical phenotype of FSGS. In 7 cases with potentially disease-related variants detected by WES, Sanger sequencing could not be performed due to the lack of family samples. In 12 cases, Sanger sequencing showed that the detected variant(s) were benign and not involved in the development of FSGS. In 3 cases, previously reported pathogenic or likely pathogenic variants were identified in the SDCCAG8, NPHS2, and COQ8B genes. Additionally, 3 cases harbored novel variants in the MAPKBP1, PODXL, and ARHGAP24 genes. In conclusion, the WES approach used in this study revealed the diagnostic value of known disease genes and newly identified variants in FSGS patients, while highlighting the potential role of candidate genes. The identification of pathogenic variants consistent with clinical findings can support genetic counseling and help identify at-risk family members.
Benzer Tezler
- Glomerülonefritlerde FAS, BCL-2, p53 moleküllerinin değerlendirilmesi, klinik ve laboratuvar bulgularla korelasyonu
Evaluation of fas, bcl-2, p53 molecules in glomerulonephritis and correlation with clinical and laboratory findings
AYSUN HATİCE UĞUZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
PatolojiÇukurova ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLFİLİZ GÖNLÜŞEN
- Fokal segmental glomerüloskleroz ve minimal değişiklik hastalığında podosit ilişkili proteinler ile TGF beta-1, WT-1 ekspresyonunun değerlendirilmesi, histolojik ve klinik bulgularla korelasyonu
Expression of podocyte related proteins, TGF Beta-1, WT-1 in focal segmental glomerulosclerosis and minimal change disease, correlation of histological and clinical parameters
HAYRİYE TATLI DOĞAN
- Steroid dirençli, steroid bağımlı ve sık relaps geçiren nefrotik sendrom tanılı çocuk hastaların tedavi cevaplarının retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of treatment responses in pediatric patients with steroid resistant, steroid dependent and frequently recurrent nephrotic syndrome
SALİH TÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVGİ YAVUZ
- 2007-2015 yılları arasında kliniğimizde böbrek biyopsisi yapılan olguların değerlendirilmesi
Evaluation of kidney biopsy cases in our clinic between 2007-2015
BİLAL ALTUNIŞIK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
NefrolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESLİHAN SEYREK