Glioblastomda miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p ve miR-543'ün tümör doku ve periferik kan örneklerindeki ekspresyonu ve biyobelirteç potansiyelinin değerlendirilmesi
Evaluation of the expression of miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p and mir-543 in tumor tissue and peripheral blood samples and their biomarker potential in glioblastoma
- Tez No: 1008816
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİCAN TAHTA
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Nöroşirürji, Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Neurosurgery, Oncology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Glioblastom, miRNA, miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p, miR-543, Glioblastoma, microRNA, miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p, miR-543
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Medipol Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu çalışmanın amacı, glioblastom hastalarında miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p ve miR-543 miRNA'larının tümör dokusu ve periferik kan (serum) örneklerindeki ekspresyon düzeylerini değerlendirmek ve bu miRNA'ların glioblastom ayırımındaki biyobelirteç potansiyelini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya toplam 49 katılımcı dahil edildi (glioblastom n=28, epilepsi n=6, sağlıklı kontrol n=15). Glioblastom ve epilepsi gruplarında cerrahi sırasında elde edilen doku örnekleri ile tüm gruplardan alınan serum örnekleri analiz edildi. miRNA ekspresyonları qRT-PCR yöntemiyle belirlendi, RNU6 endojen kontrol olarak kullanıldı ve ekspresyonlar ΔCt/2^-ΔΔCt yöntemiyle hesaplandı. İstatistiksel analizler SPSS 27.0 (IBM Corp., Armonk, NY, USA) yazılımı ile yapıldı; normallik Shapiro–Wilk testi ile değerlendirildi. Grup karşılaştırmaları için uygun parametrik ve non-parametrik testler, korelasyonlar için Pearson analizi ve tanısal performans için ROC analizi uygulandı. Bulgular: Glioblastom grubunda doku miR-182-5p (p=0,008), miR-328-3p (p<0,001), miR-340-5p (p<0,001) ve miR-543 (p<0,001) düzeyleri epilepsi grubuna göre anlamlı farklılık gösterirken, miR-339-5p için anlamlı fark saptanmadı (p=0,299). Serumda (likit biyopsi) miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p ve miR-543 düzeyleri gruplar arasında anlamlı farklılık gösterdi (tümü p<0,001), miR-340-5p için anlamlılık izlenmedi (p=0,436). Doku ve serum ekspresyonları arasında miR-182-5p (r=0,655; p<0,001) ve miR-339-5p (r=0,696; p<0,001) için güçlü pozitif korelasyonlar izlendi. ROC analizinde özellikle miR-182-5p'nin hem doku hem serumda ayırt edici performans göstermesi (doku AUC=0,840; serum AUC=0,940) dikkat çekiciydi; ayrıca doku miR-340-5p (AUC=0,987) ve miR-328-3p (AUC=0,955) ile serum miR-328-3p (AUC=0,914) ve miR-543 (AUC=0,861) yüksek tanısal performans sergiledi. Sonuç: miR-182-5p, hem tümör dokusunda hem de serumda belirgin farklılaşması ve serumda yüksek AUC değeri ile en güçlü tanısal biyobelirteç adayı olarak öne çıkmıştır. Serumda anlamlı düzeyde farklılaşan miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p ve miR-543, likit biyopsi yaklaşımı açısından umut verici biyobelirteç adaylarıdır; doku düzeyinde ise miR-340-5p ve miR-328-3p en yüksek ayırt ediciliği göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Objective: This study aimed to evaluate the expression levels of miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, miR-340-5p, and miR-543 in tumor tissue and peripheral blood (serum) samples of patients with glioblastoma and to investigate their potential as diagnostic biomarkers. Materials and Methods: A total of 49 participants were included (glioblastoma n=28, epilepsy n=6, healthy controls n=15). Tumor tissue samples obtained during surgery from glioblastoma and epilepsy groups, as well as serum samples from all groups, were analyzed. miRNA expression levels were determined by quantitative real-time PCR (qRT-PCR), using RNU6 as the endogenous control, and calculated with the ΔCt/2^−ΔΔCt method. Statistical analyses were performed using SPSS version 27.0(IBM Corp., Armonk, NY, USA). Normality was assessed with the Shapiro–Wilk test. Appropriate parametric or non-parametric tests were applied for group comparisons, Pearson correlation analysis was used to assess associations, and receiver operating characteristic (ROC) analysis was conducted to evaluate diagnostic performance. Results: In the glioblastoma group, tissue levels of miR-182-5p (p=0.008), miR-328-3p (p<0.001), miR-340-5p (p<0.001), and miR-543 (p<0.001) differed significantly compared with the epilepsy group, whereas no significant difference was observed for miR-339-5p (p=0.299). In serum samples (liquid biopsy), miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, and miR-543 levels showed significant differences among the study groups (all p<0.001), while miR-340-5p did not demonstrate a significant change (p=0.436). Strong positive correlations between tissue and serum expression levels were observed for miR-182-5p (r=0.655; p<0.001) and miR-339-5p (r=0.696; p<0.001). ROC analysis highlighted the discriminatory performance of miR-182-5p in both tissue and serum (tissue AUC=0.840; serum AUC=0.940). In addition, high diagnostic performance was observed for tissue miR-340-5p (AUC=0.987) and miR-328-3p (AUC=0.955), as well as for serum miR-328-3p (AUC=0.914) and miR-543 (AUC=0.861). Conclusion: miR-182-5p emerges as the strongest diagnostic biomarker candidate, owing to its consistent differential expression in both tumor tissue and serum and its high AUC value in serum. Moreover, serum miR-182-5p, miR-328-3p, miR-339-5p, and miR-543 demonstrate promising potential as liquid biopsy–based biomarkers for glioblastoma, while tissue miR-340-5p and miR-328-3p exhibit the highest diagnostic discriminative power at the tissue level.
Benzer Tezler
- Temsirolimus ve zoledronik asit kombinasyonunun glioblastomada apoptoz ve mirna ifade değişimleri üzerindeki etkisinin araştırılması
Investigation of apoptosis and mirna expression changes via zoledronic acid combination effect with temsirolimus in glioblastoma
CANSU ÇALIŞKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI
- Effect of PDE4B inhibitors on miRNA levels in different glioma cell lines
Farklı glioma hücre hatlarında PDE4B inhibitörlerinin miRNA düzeyleri üzerindeki etkisi
LINAH MOHAMED ELMAGZOUB MOHAMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Tıbbi BiyolojiBahçeşehir ÜniversitesiSinir Bilimi Ana Bilim Dalı
Assist. Prof. Dr. MEHMET OZANSOY
Assist. Prof. Dr. BETİLAY TOPKARA ARSLAN
- TRPM2 iyon kanallarını kontrol eden miRNA'ların glioblastoma multiforme doku örneklerinde gen ifadesi ve glioblastoma kültür hücrelerinde TRPM2 kanallarının elektrofizyolojik karakterizasyonu
Expression of mi̇krornas regulating TRPM2 ion channels in glioblastoma multiforme tissues and electrophysiological characterization of TRPM2 channels in glioblastoma cell lines
NURCAN ŞAHİN DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
FizyolojiGaziantep ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. RAMAZAN BAL
- Diffüz ve yüksek dereceli glial tümörlerde miRNA ekspresyon değişimlerinin belirlenmesi
Detection of miRNA expression changes in diffuse and high grade glial tumors
SUNDE YILMAZ SÜSLÜER
- miR96 and miR182-driven regulation of cytoskeleton in glioblastomas
Glioblastomalarda hücre iskeletinin miR96 ve miR182 aracılı regülasyonu
ENES YAĞIZ AKDAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ