Geri Dön

Ülseratif kolit tanılı hastalarda otofaji ile ilişkili ULK1 kompleks genlerinin ekspresyonunun analizi

Analysis of autophagy-related ULK1 complex gene expression in patients with ulcerative colitis

PDF İndir

  1. Tez No: 1014824
  2. Yazar: HÜLYA TARIM
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MAHMUT SELMAN YILDIRIM
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Ülseratif kolit, otofaji, ULK1 Kompleksi, gen ekspresyonu, Ulcerative colitis, autophagy, ULK1 complex, gene expression
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Ülseratif kolit (ÜK), kolon ve rektumda mukozal inflamasyon ile karakterize, progresif seyirli bir inflamatuar bağırsak hastalığıdır. Patogenezi henüz tam olarak aydınlatılamamış olmakla birlikte; özellikle otofaji disregülasyonu, ÜK gibi kronik inflamatuar hastalıkların etyolojisini anlamaya yönelik güncel araştırmaların odağında yer almaktadır. Bu çalışmada; ÜK tanılı hastaların normal ve inflame kolon dokularında, otofaji mekanizmasının başlatıcı kompleksi olan ULK1/2 Kompleksi genlerinin (ULK1, ULK2, RB1CC1, ATG13, ATG101) mRNA ekspresyon profillerinin karşılaştırılmalı olarak incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Prospektif vaka-kontrol tasarımıyla yürütülen çalışmaya ÜK tanısı almış ve aktif hastalık döneminde olan 42 hasta dahil edilmiştir. Her hastadan kolonoskopi esnasında alınan makroskopik olarak inflamatuar ve normal görünümlü kolon mukozası biyopsilerinde; Reverse Transkripsiyon Kantitatif Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-qPCR) yöntemiyle ULK1, ULK2, ATG13, ATG101 ve RB1CC1 genlerinin mRNA ekspresyon düzeyleri belirlenmiştir. Veriler 2-ΔΔCt yöntemi kullanılarak β-actin (ACTB) referans genine göre normalize edilmiştir. Bulgular: ÜK hastalarının inflame kolon dokusunda normal kolon dokusuna kıyasla RB1CC1 (p=0,005), ULK2 (p=0,008) ve ATG101 (p=0,027) genlerinin ekspresyon düzeyi düşük saptanmıştır. Çok değişkenli lojistik regresyon analizinde; yaş, cinsiyet, vücut kitle indeksi ve hastalık süresinden bağımsız olarak RB1CC1 (OR=0,17; p=0,038) ve ULK2 (OR=0,13; p=0,031) genleri mukozal inflanmasyon ile ilişkili bulunmuştur. ROC analizlerinde RB1CC1'nin mukozal inflamasyonu ayırt etmede en yüksek özgüllüğe sahip olduğu belirlenmiştir (AUC=0,690; %92,9). Endoskopik hastalık şiddetinin sınıflandırılmasında inflame dokuda ULK1 (AUC=0,740) ve normal dokuda ATG101 (AUC=0,728) genlerinin anlamlı performans sergilediği görülmüştür. Sonuç: ÜK hastalarının inflame kolon dokusu örneklerinde ULK2, RB1CC1 ve ATG101'in selektif olarak baskılanması, ÜK'de otofaji başlatma kompleksinin alt birim düzeyinde inhibisyonunu desteklemekte; bu genlerin doku düzeyinde aday moleküler biyobelirteçler ve terapötik hedefler olabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Objective: Ulcerative colitis (UC) is a progressive inflammatory bowel disease characterized by mucosal inflammation of the colon and rectum. Although its pathogenesis remains incompletely understood, autophagy dysregulation has emerged as a central focus of current research into the etiology of chronic inflammatory conditions, including UC. The present study aimed to comparatively examine the mRNA expression profiles of ULK1/2 complex genes (ULK1, ULK2, RB1CC1, ATG13, ATG101), which constitute the initiator complex of the autophagy machinery, in normal and inflamed colonic tissues of patients with UC. Methods: This prospective case-control study included 42 patients with confirmed active UC. Paired biopsies were obtained from macroscopically inflamed and normal-appearing colonic mucosa in each patient. mRNA expression levels of ULK1, ULK2, RB1CC1 ATG13, and ATG101 were quantified by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and normalized to β-actin (ACTB) using the 2⁻ΔΔCt method. Results: Expression levels of RB1CC1 (p = 0.005), ULK2 (p = 0.008), and ATG101 (p = 0.027) were significantly lower in inflamed compared with normal colonic tissue. Multivariant logistic regression identified RB1CC1 (OR = 0.17; p = 0.038) and ULK2 (OR = 0.13; p = 0.031) as independently associated with mucosal inflammation after adjustment for age, sex, body mass index, and disease duration. On ROC analysis, RB1CC1 demonstrated the highest specificity for discriminating mucosal inflammation (AUC = 0.690; 92.9%), while ULK1 in inflamed tissue (AUC = 0.740) and ATG101 in normal tissue (AUC = 0.728) showed significant discriminative performance for classifying endoscopic disease severity. Conclusion: The selective downregulation of ULK2, RB1CC1, and ATG101 in the inflamed colonic mucosa of UC patients points to subunit-level impairment of the autophagy initiation complex, positioning these genes as promising tissue-level molecular biomarkers and candidate therapeutic targets.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    1005315

    İnflamatuvar Bağırsak Hastalığı'nda immün modülatör genleri düzenleyen mikroRNA'lar ve hedeflediği genlerin ekspresyon düzeylerinin incelenmesi

    Investigation of expression levels of microRNAs that regulate immune modulatory genes and their targeted genes in Inflammatory Bowel Disease

    EZGİ ÇOKAKLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Moleküler TıpMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM İZCİ AY

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZUHAL MERT ALTINTAŞ

  2. Tez No

    314560

    Ülseratif kolit tanılı hastalarda sitokin sinyal supresör (SOCS)- 1 1478 CA/DEL gen polimorfizminin incelenmesi

    Investigation of cytokine signal supressor (SOCS)-1 1478 CA/DEL gene polymorphism in patients with ulcerative colitis

    MUSTAFA HARTAVİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    GastroenterolojiUludağ Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELİM GİRAY NAK

  3. Tez No

    639715

    Ülseratif kolit tanılı hastalarda nötrofil / lenfosit ve platelet / lenfosit oranlarının hastalığın klinik, laboratuvar ve endoskopik aktivasyonunu belirlemedeki rolü

    The neutrophil / lymphocyte and platelet / lymphocyte ratios in ulcerative colitis patients: Relation with the clinical, laboratory and endoscopic disease activity

    MELİKE ÖZGÜVEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    İç HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ABDULBAKİ KUMBASAR

  4. Tez No

    669574

    Ülseratif kolit tanılı hastalarda yaşam kalitesinin değerlendirilmesi

    Evaluation of quality of life in patients wi̇th ulcerative colitis

    BÜŞRA NUR ÇEBER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GastroenterolojiManisa Celal Bayar Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TAHİR BURAN

  5. Tez No

    754264

    Ülseratif kolit tanılı hastalarda, serum soluble B7-H4, TNF-ALFA ve IL-6 kan seviyeleri ile hastalık aktivitesi arasındaki ilişki

    The relationship between serum soluble B7-H4, TNF-ALFA and il-6 BLOOD levels and disease activity in patients with ulcerative colitis

    DİCLE YURDATAP

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    İç HastalıklarıÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FATİH KAMIŞ

Geri Dön