Escherichia coli kaynaklı sığır mastitislerinin süt mikrobiyomunda meydana getirdiği değişikliklerin araştırılması
Investigation of changes in milk microbiome in bovine mastitis caused by Escherichia coli
- Tez No: 1016924
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ KIRKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu çalışmada, sığır mastitislerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının patotipik karakterizasyonu ve mastitisli sütlerin mikrobiyom profillerindeki değişimlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Aydın ilindeki çiftliklerden toplanan 115 mastitisli ve 20 sağlıklı süt örneği incelenmiştir. Tespit edilen E. coli izolatlarının patotipleri PCR ile belirlenerek gruplandırılan sütlerin mikrobiyom analizleri 16S rRNA dizileme yöntemiyle gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Örneklerin %20'sinde (n=23) E. coli tespit edilmiştir. İzolatların tamamı (%100) ETEC genlerini taşırken, %56,52'sinin (n=13) shiga toksin genleri ve %26,09'unun (n=6) eae geni taşıdığı tespit edilmiştir. İzolatların %60,87'sinin (n=14) hibrit patotip karakterinde olduğu tespit edilmiştir. Mikrobiyom analizlerinde, sağlıklı sütlerde Pseudomonadota (%42,86) ve Bacillota (%41,65) filumlarının dengeli dağılımına karşın, mastitisli sütlerde Pseudomonadota filumunun (%91,77-%98,58) belirgin bir disbiyozis tablosu oluşturduğu ve Enterobacteriaceae familyasının baskın hale geldiği saptanmıştır. Alfa ve beta çeşitlilik analizleri, enfeksiyonun mikrobiyal çeşitliliği azalttığını ve sütün ekolojik yapısını tamamen değiştiridğini ortaya koymuştur. Sonuç: Çalışma sonucunda E. coli'nin bölgedeki sığır mastitis vakalarındaki prevalansı ile beraber süt mikrobiyomunda farklı patotiplerin yarattığı değişiklikler ortaya konarak süt mikrobiyomunun patotip bazında değerlendirilmesi gerektiği sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Objective: This study aimed to determine the pathotypic characterization of Escherichia coli strains isolated from bovine mastitis and the changes in the microbiome profiles of mastitic milk. Materials and Methods: A total of 115 mastitic and 20 healthy milk samples collected from dairy farms in Aydın province were examined. The pathotypes of the detected E. coli isolates were identified via PCR, and microbiome analyses of the grouped milk samples were performed using the 16S rRNA sequencing method. Results: E. coli was detected in 20% (n=23) of the samples. While all isolates (100%) carried ETEC genes, 56.52% (n=13) were found to carry shiga toxin genes and 26.09% (n=6) carried the eae gene. It was determined that 60.87% (n=14) of the isolates exhibited hybrid pathotype characteristics. In microbiome analyses, in contrast to the balanced distribution of Pseudomonadota (42.86%) and Bacillota (41.65%) phyla in healthy milk, it was found that the Pseudomonadota phylum (91.77-98.58%) created a distinct dysbiosis in mastitic milk, and the Enterobacteriaceae family became dominant. Alpha and beta diversity analyses revealed that the infection reduced microbial diversity and completely altered the ecological structure of the milk. Conclusion: In conclusion, the prevalence of E. coli in bovine mastitis cases in the region was revealed along with the changes created by different pathotypes in the milk microbiome, leading to the conclusion that the milk microbiome should be evaluated on a pathotype basis.
Benzer Tezler
- Etlerde escherichia coli O157:H7 varlığının araştırılması
Investigation of the presence of eshercihia coli o157:h7 in meats
EMİNE BEKAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiKafkas ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEYLA VATANSEVER
- Çeşitli gıdalarda shiga toksin üreten Escherichia coli (STEC) serotiplerinin ve bazı gıda patojenlerinin prevalansının araştırılması
Investigation of the prevalence of shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) serotypes and certain foodborne pathogens in various foods
ADEM SOYCAN
Doktora
Türkçe
2025
MikrobiyolojiKocaeli ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DEVRİM DÜNDAR
- Çeşitli gruplarda dışkıda Escherichia coli O157:H7 varlığının araştırılması
Investigation of E. coli O157:H7 in fecal samples of in various groups
ESMA YENİİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiGataEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Neonatal buzağı ishallerinden izole edilen Escherichia coli izolatlarına özgü litik bakteriyofajların izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu
Isolation and molecular characterisation of lytic bacteriophages specific to Escherichia coli isolates from neonatal calf diarrhoea
FATMA TÜRKARSLAN AKBABA
Doktora
Türkçe
2025
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN HÜSEYİN HADİMLİ
- Aydın ili mezbahalarında E. coli O157: H77 ve Listeria monocytogenes varlığının araştırılması
The presence of Escherichia coli O157: H7 and Listeria monocytogenes in beef slaughterhouses in Aydin province
CEMALETTİN YEŞİLYURT
Doktora
Türkçe
2010
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN KAYA